UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1K08D8.1K08D8.11e-62chrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
2Y40H7A.11Y40H7A.11n/achrIV 15,219,977contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
3F14H3.12F14H3.12n/achrV 16,074,705contains similarity to Pfam domain PF02149 Kinase associated domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001772 (Kinase-associated KA1)
4ZC196.1ZC196.1n/achrV 8,744,495
5F52E10.4F52E10.4n/achrX 16,286,357contains similarity to Homo sapiens Zinc finger protein 277; ENSEMBL:ENSP00000006035
6srx-128F55B12.7n/achrV 13,838,056C. elegans SRX-128 protein ;
7C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
8dnj-4C01G8.4n/achrI 5,283,025This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
9ZK632.9ZK632.9n/achrIII 9,825,065contains similarity to Barley yellow dwarf virus Coat protein.; SW:COAT_BYDVN
10B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
11F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
12rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
13math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
14F14D2.8F14D2.8n/achrII 3,348,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
15F53F10.3F53F10.3n/achrI 3,827,677contains similarity to Pfam domain PF03650 Uncharacterised protein family (UPF0041) contains similarity to Interpro domain IPR005336 (Protein of unknown function UPF0041)
16F56B6.6F56B6.6n/achrX 3,532,316contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
17hlh-12C28C12.8n/achrIV 8,478,993C. elegans HLH-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR002418 (Transcription regulator Myc)
18T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
19D1079.1D1079.1n/achrX 4,405,551
20Y57G11C.18Y57G11C.18n/achrIV 14,841,760contains similarity to Interpro domain IPR000767 (Disease resistance protein)
21D2007.1D2007.1n/achrIII 8,155,633
22K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
23T24E12.5T24E12.5n/achrII 3,755,632contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
24F07G11.2F07G11.2n/achrV 7,304,229contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
25srh-70T21B4.9n/achrII 12,517,220C. elegans SRH-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
27H43I07.1H43I07.1n/achrV 4,206,564contains similarity to Interpro domains IPR010754 (Optic atrophy 3-like), IPR005819 (Histone H5)
28srw-137H27D07.4n/achrV 2,943,264C. elegans SRW-137 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
29hex-1T14F9.3n/achrX 2,225,047hex-1 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase that is orthologous to the human gene CERVICAL CANCER PROTO-ONCOGENE 7 (HEXB; OMIM:606873), which when mutated leads to disease.
30K02A11.3K02A11.3n/achrI 9,746,967contains similarity to Homo sapiens Placental protein 11 precursor; ENSEMBL:ENSP00000229003
31C10G8.3C10G8.3n/achrV 5,313,573contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
32T05A7.1T05A7.1n/achrII 4,678,765
33F15D4.2F15D4.2n/achrII 13,216,307contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Protein ENDO16 (Fragment).; SW:P13665
34srh-292Y94A7B.1n/achrV 17,803,313C. elegans SRH-292 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35T04A11.5T04A11.5n/achrIV 12,485,693contains similarity to Pfam domain PF02567 Phenazine biosynthesis-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003719 (Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein)
36ttm-2F26G1.4n/achrII 4,765,267C. elegans TTM-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
37T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39ttr-30T08A9.2n/achrX 7,331,455C. elegans TTR-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
40W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
41btb-16F39E9.2n/achrII 3,297,442C. elegans BTB-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
42T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
43nhr-269R08H2.9n/achrV 15,369,318C. elegans NHR-269 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44K09H9.1K09H9.1n/achrI 3,154,202contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
45F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
46C16A3.6C16A3.6n/achrIII 6,379,994contains similarity to Pfam domain PF04874 Mak16 protein contains similarity to Interpro domain IPR006958 (Mak16 protein)
47ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
48spp-11T25D10.3n/achrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
49F36F2.2F36F2.2n/achrI 9,017,387contains similarity to Procambarus clarkii I-connectin.; TR:Q95YM2
50Y37A1B.8Y37A1B.8n/achrIV 14,022,381contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)