UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K07H8.3K07H8.39e-97chrIV 8,290,863contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
2B0416.1B0416.1n/achrX 9,307,010contains similarity to Pfam domain PF07810 TMC domain contains similarity to Interpro domain IPR012496 (TMC)
3B0393.5B0393.5n/achrIII 4,772,641contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (6), PF06119 (Nidogen-like) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003886 (Nidogen, extracellular region), IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR013091 (EGF calcium-binding), IPR006210 (EGF)
4hum-5T02C12.1n/achrIII 4,032,950C. elegans HUM-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF06017 (Myosin tail) , PF00063 (Myosin head (motor domain)) contains similarity to Interpro domains IPR010926 (Myosin tail 2), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region), IPR001609 (Myosin head, motor region)
5maoc-1E04F6.3n/achrII 7,196,834maoc-1 encodes an ortholog of human HSD17B4 (OMIM:601860, mutated in D-bifunctional protein deficiency); MAOC-1 contains a MaoC-like domain found in diverse enzymes (HSD17B4, peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase, and the fatty acid synthase beta subunit) and by homology, is predicted to function in peroxisomal fatty acid beta-oxidation; loss of maoc-1 activity via RNAi results in lifespan extension, increased fat content, and an increased susceptibility to pathogens.
6pmp-4T02D1.5n/achrIV 17,404,001The pmp-4 gene encodes a homolog of human ALD, which when mutated leads to X-linked adrenoleukodystrophy (OMIM:300100).
7T07C12.9T07C12.9n/achrV 9,957,579contains similarity to Pfam domain PF01234 NNMT/PNMT/TEMT family contains similarity to Interpro domain IPR000940 (Methyltransferase, NNMT/PNMT/TEMT)
8col-68C50D2.4n/achrII 105,181C. elegans COL-68 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
9K08E3.4K08E3.4n/achrIII 13,760,645contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00241 (Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein) contains similarity to Interpro domains IPR002108 (Actin-binding, cofilin/tropomyosin type), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
10T26E3.7T26E3.7n/achrI 12,655,698contains similarity to Pfam domain PF00006 ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain contains similarity to Interpro domain IPR000194 (ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding)
11dhs-7E04F6.7n/achrII 7,207,642dhs-7 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
12Y37D8A.10Y37D8A.10n/achrIII 12,875,275contains similarity to Pfam domain PF06703 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25) contains similarity to Interpro domain IPR009582 (Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit)
13cyp-33A1C12D5.7n/achrV 7,680,386C. elegans CYP-33A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
14cdr-2C54D10.1n/achrV 12,415,171C. elegans CDR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
15K02B12.7K02B12.7n/achrI 8,528,009contains similarity to Pfam domain PF01412 Putative GTPase activating protein for Arf contains similarity to Interpro domain IPR001164 (Arf GTPase activating protein)
16T01E8.5T01E8.5n/achrII 10,245,041contains similarity to Pfam domain PF08424 Protein of unknown function (DUF1740) contains similarity to Interpro domain IPR013633 (Protein of unknown function DUF1740)
17gpa-12F18G5.3n/achrX 9,247,895gpa-12 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in the pharynx and in the hypodermis.
18W02B12.11W02B12.11n/achrII 11,474,835contains similarity to Pfam domain PF02709 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR003859 (Metazoa galactosyltransferase)
19F35C11.4F35C11.4n/achrII 8,250,751contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C9orf125; ENSEMBL:ENSP00000363980
20M03B6.2M03B6.2n/achrX 13,855,038contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
21W06A7.2W06A7.2n/achrV 14,822,585contains similarity to Salmonella typhi;Salmonella typhimurium Hypothetical protein (Putative inner membrane protein).; TR:Q8XEW6
22H03A11.1H03A11.1n/achrX 15,211,201H03A11.1 encodes an FAM20 ortholog; murine FAM20A is a secreted protein expressed in hematopoietic cells.
23C15H9.7C15H9.7n/achrX 6,108,092contains similarity to Interpro domains IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR010111 (Kynureninase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
24col-69K01A2.7n/achrII 304,726C. elegans COL-69 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
25F38E1.9F38E1.9n/achrV 8,358,662contains similarity to Pfam domain PF04193 PQ loop repeat contains similarity to Interpro domains IPR006603 (Cystinosin/ERS1p repeat), IPR016817 (Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein)
26kqt-2M60.5n/achrX 8,244,691kqt-2 encodes one of three C. elegans KCNQ-like potassium channel subunits for which mutations in humans are associated with heredity diseases that affect epithelial cells, cardiac muscle and neurons; a KQT-2::GFP fusion protein is expressed exclusively in the intestine.
27Y54E5A.1Y54E5A.1n/achrI 14,690,180contains similarity to Pfam domains PF00487 (Fatty acid desaturase) , PF08557 (Sphingolipid Delta4-desaturase (DES)) contains similarity to Interpro domains IPR013866 (Sphingolipid delta4-desaturase, N-terminal), IPR010257 (Fatty acid desaturase, type 1, N-terminal), IPR011388 (Sphingolipid delta4-desaturase), IPR005804 (Fatty acid desaturase, type 1)
28lst-2R160.7n/achrX 4,380,673C. elegans LST-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01363 FYVE zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
29asg-2C53B7.4n/achrX 6,841,624asg-2 encodes a homolog of subunit G of the membrane-bound F0 proton channel portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); asg-2 activity is required for growth at a normally high rate and for normal osmoregulation; in addition, asg-2 activity is required for response to hermaphrodite contact, the first step in a series of stereotypical male mating behaviors; an ASG-2::GFP fusion localizes to mitochondria and to cilia of the male-specific CEM neurons.
30T08D10.3T08D10.3n/achrX 11,956,831contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA1681; ENSEMBL:ENSP00000316543
31spon-1F10E7.4n/achrII 7,118,495C. elegans SPON-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF06468 (Spondin_N) , PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) (5), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) , PF02014 (Reeler domain) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR003067 (Plasmodium circumsporozoite protein), IPR009465 (Spondin, N-terminal), IPR002861 (Reeler region)
32fbxa-58C29F9.11n/achrIII 110,182C. elegans FBXA-58 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
33vha-19Y55H10A.1n/achrIV 3,371,328vha-19 encodes an ortholog of subunit Ac45 of the membrane-bound (V0) domain of vacuolar proton-translocating ATPase (V-ATPase); VHA-19 is a predicted V-ATPase transmembrane rotor component; Ac45 is a nonhomologous replacement for subunit c', which is found in fungi but not in animals; conversely, orthologs of Ac45 are only found in animals; VHA-19 is predicted to help carry protons from the cytosol to a-subunits (VHA-5, VHA-6, VHA-7, or UNC-32) for transmembrane export.
34tre-4F15A2.2n/achrX 13,473,950C. elegans TRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
35atf-5T04C10.4n/achrX 14,809,925atf-5 encodes a homolog of the mammalian bZIP transcription factors ATF4 and ATF5, analogous to GCN4 in S. cerevisiae; like like ATF4 and GCN4, atf-5 has an extensive 5' UTR with one 37-residue uORF; ATF4 is poorly translated in unstressed cells but well-translated during ER stress, amino acid starvation, or arsenite treatment; possibly atf-5 is also translationally regulated in a way similar to ATF4.
36W10G11.19W10G11.19n/achrII 3,552,038contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence)
37C13C4.5C13C4.5n/achrV 12,116,190contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38F58A6.1F58A6.1n/achrII 5,143,154contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domains IPR014748 (Crontonase, C-terminal), IPR001753 (Crotonase, core)
39C34C6.4C34C6.4n/achrII 8,697,694contains similarity to Pfam domains PF00732 (GMC oxidoreductase) , PF05199 (GMC oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR012132 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase), IPR007867 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase, C-terminal), IPR000172 (Glucose-methanol-choline oxidoreductase, N-terminal), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
40tre-1F57B10.7n/achrI 6,556,662C. elegans TRE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
41Y49G5A.1Y49G5A.1n/achrV 5,286,867contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
42ugt-16ZC443.6n/achrV 12,826,207C. elegans UGT-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
43nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44T04F3.1T04F3.1n/achrV 11,747,105contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR001176 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
45F42E8.1F42E8.1n/achrV 13,063,254contains similarity to Campylobacter jejuni DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7).; SW:DP3A_CAMJE
46K10C2.4K10C2.4n/achrX 6,447,827K10C2.4 encodes a putative fumarylacetoacetate hydrolase, orthologous to human FAH (OMIM:276700, mutated in type I tyrosinemia), that is required for tyrosine metabolism, resistance to oxidative and protein-folding stresses, and more generally for normally rapid growth, normal locomotion, fertility, and viability; K10C2.4 is expressed in hypodermis and intestine; the intestines of K10C2.4(RNAi) animals atrophy rapidly, and show an abnormally active oxidative stress response (seen via gst-4::GFP) and ER stress response (seen via hsp-4::GFP); while RNAi against enzymes upstream of K10C2.4 suppresses the K10C2.4(RNAi) phenotype, excess dietary tyrosine or homogentisic acid enhances it, and exogenous succinylacetone (SA) mimics it, consistent with the hypothesis that blocked SA metabolism is toxic in K10C2.4(RNAi) animals.
47prx-13F32A5.6n/achrII 7,251,051prx-13 is orthologous to the human gene PEX13 (OMIM:601789), which when mutated leads to Zellweger syndrome or neonatal adrenoleukodystrophy.
48gsp-1F29F11.6n/achrV 10,684,438C. elegans GSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
49F53B6.5F53B6.5n/achrI 8,950,742contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
50prp-8C50C3.6n/achrIII 8,168,465prp-8 is orthologous to the human gene SIMILAR TO U5 SNRNP-SPECIFIC PROTEIN (220 KD), ORTHOLOG OF S.