UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K07A1.13K07A1.138e-89chrI 9,584,354contains similarity to White spot syndrome virus Wsv319.; TR:Q8VAS3
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F20H11.5F20H11.5n/achrIII 6,588,571F20H11.5 encodes a putative secreted D-aspartate oxidase (DASPO), paralogous to C47A10.5 and F18E3.7; recombinant F20H11.5 protein is insoluble when expressed in E. coli, and thus has not yet been tested in vitro for activity; F20H11.5 is expressed in a head mesodermal cell, hypodermis, other head cells, and vulva.
4srj-25C05E4.10n/achrV 735,347C. elegans SRJ-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
5srbc-29C02A12.2n/achrV 3,470,161C. elegans SRBC-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
6Y40H7A.10Y40H7A.10n/achrIV 15,212,835contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
7W02B12.4W02B12.4n/achrII 11,457,473contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
8K08F4.3K08F4.3n/achrIV 10,129,732contains similarity to Pfam domain PF05753 Translocon-associated protein beta (TRAPB) contains similarity to Interpro domain IPR008856 (Translocon-associated beta)
9hex-5Y70D2A.2n/achrX 14,903,528hex-5 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
10vha-18F52E1.10n/achrV 8,412,615vha-18 encodes an an ortholog of subunit H of the cytoplasmic (V1) domain of vacuolar proton-translocating ATPase (V-ATPase); VHA-18 and VHA-15 are co-orthologs; VHA-18 is a predicted cytosolic stator (stalk) component.
11W02D7.4W02D7.4n/achrV 8,297,041contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
12ugt-27C10H11.5n/achrI 4,725,415C. elegans UGT-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
13B0244.9B0244.9n/achrIII 5,730,515contains similarity to Interpro domains IPR005838 (Type III secretion system inner membrane P protein), IPR001865 (Ribosomal protein S2)
14F47B8.6F47B8.6n/achrV 14,329,569contains similarity to Drosophila heteroneura Aminopeptidase N (Fragment).; TR:O61534
15C03D6.6C03D6.6n/achrI 9,657,459contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Involved in cell cycle control and ion homeostasis; SGD:YKR072C
16F17C11.4F17C11.4n/achrV 10,952,702contains similarity to Mus musculus Desmoglein 2 precursor.; SW:DSG2_MOUSE
17F35C11.5F35C11.5n/achrII 8,254,199contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
18C16A11.6C16A11.6n/achrII 4,237,141
19W02D9.5W02D9.5n/achrI 12,561,291contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
20T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
21mex-5W02A2.7n/achrIV 13,354,881mex-5 encodes a novel protein that contains two CCCH zinc finger motifs; maternally provided MEX-5, which functions partly redundantly with the highly similar CCCH finger protein MEX-6, is essential for transducing polarity cues and establishing soma/germline asymmetry in the early embryo; in regulating soma/germline asymmetry, MEX-5 interacts with, and activates, the SOCS-box protein ZIF-1, which functions as part of an E3 ubiquitin ligase complex that degrades germ plasm proteins in somatic blastomeres; accordingly, ectopic expression of MEX-5 throughout the early embryo results in reduced expression of germline proteins in germline blastomeres; MEX-5 is a cytoplasmic protein expressed at uniform levels in oocytes and newly fertilized eggs; from the 1-cell to 4-cell stages of embryogenesis, MEX-5 expression is dynamic, with highest levels seen in the anterior AB blastomere and, for a time, its daughters, the anterior portion of the P1 blastomere, P1 centrosomes (both, then posterior only), and the EMS and C blastomeres; the asymmetric distribution of MEX-5 in early embryos depends upon wild-type activity of the PAR and OMA-1 proteins.
22W05B2.4W05B2.4n/achrIII 10,975,818contains similarity to Pfam domain PF08393 Dynein heavy chain, N-terminal region 2 contains similarity to Interpro domains IPR011010 (DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core), IPR013602 (Dynein heavy chain, N-terminal region 2)
23C13A2.10C13A2.10n/achrV 7,274,350contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
24str-182C12D8.12n/achrV 10,232,595C. elegans STR-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25C04E6.11C04E6.11n/achrV 5,915,960contains similarity to Homo sapiens Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial precursor; ENSEMBL:ENSP00000260665
26C03G6.5C03G6.5n/achrV 7,365,571contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
27F40F8.3F40F8.3n/achrII 11,129,630contains similarity to Homo sapiens 17 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000373249
28nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29tag-68F37D6.6n/achrI 10,503,512C. elegans TAG-68 protein; contains similarity to Pfam domains PF03166 (MH2 domain) , PF03165 (MH1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR013019 (MAD homology, MH1), IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001132 (SMAD domain, Dwarfin-type), IPR017855 (SMAD domain-like), IPR013790 (Dwarfin), IPR003619 (MAD homology 1, Dwarfin-type)
30H02I12.1H02I12.1n/achrIV 11,375,266H02I12.1 encodes a large (1319-residue) protein with 12 chitin-binding peritrophin-A domains; H02I12.1(RNAi) animals have an osmotically-sensitive embryonic lethal phenotype, perhaps because of defects in chitin and eggshell synthesis; like CEJ-1 and CPG-2, H02I12.1 may participate in eggshell synthesis and early embryonic development; H02I12.1's multiple peritrophin-A domains might enable mechanical cross-linking of chitin.
31dod-23F49E12.2n/achrII 8,398,700C. elegans DOD-23 protein ;
32C14B1.2C14B1.2n/achrIII 3,702,706contains similarity to Bacillus anthracis Hypothetical protein.; TR:Q81T15
33btb-7F45C12.12n/achrII 1,713,745C. elegans BTB-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
34T12D8.5T12D8.5n/achrIII 13,626,155contains similarity to Treponema pallidum Nuclease sbcCD subunit C.; SW:SBCC_TREPA
35C06A5.6C06A5.6n/achrI 5,984,551
36VC27A7L.1VC27A7L.1n/achrV 12,165,914contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37D1054.11D1054.11n/achrV 10,794,334contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
38F58A4.2F58A4.2n/achrIII 9,600,293contains similarity to Musca domestica Hexamerin (Fragment).; TR:Q9U6B2
39F57C2.3F57C2.3n/achrII 14,524,512contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000265391
40pqn-73W01C9.3n/achrII 8,543,297The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
41F53A9.8F53A9.8n/achrX 8,718,676contains similarity to Plasmodium chabaudi Pc-fam-3 protein putative (Fragment).; TR:Q4XGP3
42mei-2F57B10.12n/achrI 6,565,308mei-2 encodes a novel protein that contains a region similar to the p80-targeting subunit of katanin that is required for embryonic viability, alignment of chromosomes at the metaphase plate, and establishment of the oocyte meiotic spindle together with MEI-1; can interact with MEI-1 in HeLa cells and this complex can function to disassemble microtubules, expressed in the germ line, throughout the cytoplasm of most mature oocytes within the proximal gonad, and localization is mutually dependent upon MEI-1
43W02D9.7W02D9.7n/achrI 12,559,462contains similarity to Vibrio vulnificus Septum formation inhibitor-activating ATPase.; TR:Q8DFS3
44mex-6AH6.5n/achrII 9,525,192mex-6 encodes a CCCH zinc-finger protein highly similar to MEX-5 that functions with MEX-5 to affect embryonic viability, establish soma germline asymmetry in embryos and establish PIE-1, MEX-1, and POS-1 asymmetry in embryos, and also affects formation of intestinal cells; MEX-6 and MEX-5 may act downstream of the PAR proteins.
45gln-6C28D4.3n/achrIV 9,740,184C. elegans GLN-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF03951 (Glutamine synthetase, beta-Grasp domain) , PF00120 (Glutamine synthetase, catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR008147 (Glutamine synthetase, beta-Grasp), IPR014746 (Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic region), IPR008146 (Glutamine synthetase, catalytic region)
46let-502C10H11.9n/achrI 4,741,246let-502 encodes a Rho-binding Ser/Thr kinase orthologous to human myotonic dystrophy kinase (DM-kinase); let-502 is required for early embryonic cleavages, embryonic elongation, migration of hypodermal P cells to a ventral position, normal spermathecal contraction, and fertility; LET-502 is required for hypodermal cells to properly change their shape, and is expressed in those cells, during embryonic elongation; let-502 mutations are suppressed by mel-11 mutations, and the pattern of LET-502 expression in the embryonic epidermis and the spermatheca is opposite to that of MEL-11, indicating that LET-502 and MEL-11 have opposing functions (presumably tissue contraction and relaxation); MEL-11 requires LET-502 (along with the nonmuscle myosin NMY-1) for proper localization.
47F31C3.5F31C3.5n/achrI 15,053,308contains similarity to Pfam domain PF04128 Partner of SLD five, PSF2 contains similarity to Interpro domains IPR016906 (GINS complex, PSF2 component, subgroup), IPR007257 (GINS complex, Psf2 component)
48mat-2W10C6.1n/achrII 11,116,985mat-2 encodes a subunit of the anaphase-promoting complex or cyclosome (APCC) which is a multi-subunit E3 ubiquitin ligase that targets proteins for degradation during the metaphase-to-anaphase transition of the cell cycle; mat-2 is required for chromosome segregation during meiosis I and is involved in polarity specification of the anterior/posterior axis in the developing embryo.
49T25C8.1T25C8.1n/achrIII 13,611,268contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000577 (Carbohydrate kinase, FGGY)
50nas-20T11F9.3n/achrV 11,471,595nas-20 encodes an astacin-like metalloprotease.