UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K06A5.2K06A5.24e-169chrI 6,468,758contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
2F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
3F36A2.10F36A2.10n/achrI 8,819,797contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR005819 (Histone H5)
4ZC317.6ZC317.6n/achrV 5,467,199
5C14C11.1C14C11.1n/achrV 5,664,396
6T08B2.12T08B2.12n/achrI 6,231,810contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
7F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
8Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
9C18G1.9C18G1.9n/achrV 4,768,777contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
10F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
11T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
12R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
13F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
14C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
15C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
16F26F4.2F26F4.2n/achrIII 4,911,567F26F4.2 encodes a novel protein with high similarity to C. elegans F37A8.1 and C. briggsae CBG18186.
17C05C12.5C05C12.5n/achrIV 11,260,772contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ10106 fis, clone HEMBA1002569, highly similar to Homo sapiens protein associated with Myc mRNA (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000353197
18C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
19Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
20K05F1.3K05F1.3n/achrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
21C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
22W03D8.9W03D8.97.000000000000001e-23chrI 2,785,349contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
23C09B9.2C09B9.2n/achrIV 5,030,143
24C35E7.9C35E7.9n/achrI 10,807,562contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
25Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
26F42G4.6F42G4.6n/achrII 13,079,994F42G4.6 encodes a nematode-specific sperm protein; F42G4.6 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); F42G4.6(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; F42G4.6 expression is enriched in spermatogenesis.
27snf-9C49C3.1n/achrIV 17,313,754C. elegans SNF-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
28C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
29F26B1.1F26B1.1n/achrI 6,328,529contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
30F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31C18A3.7C18A3.7n/achrII 5,730,004contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Arginine/serine-rich coiled-coil protein 1; ENSEMBL:ENSP00000295930
32R10E4.7R10E4.7n/achrIII 4,295,916contains similarity to Interpro domain IPR015813 (Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core)
33T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
34K01H12.4K01H12.4n/achrIV 9,714,029contains similarity to Simian T-lymphotropic virus 1 Rex p27 protein (Fragment).; TR:O12387
35M7.7M7.7n/achrIV 11,090,870contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36R10E9.2R10E9.2n/achrIII 3,963,390contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein (At2g34570).; TR:Q8GWS9
37F37A8.1F37A8.1n/achrIII 3,928,769contains similarity to Rattus norvegicus Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta.; TR:O54875
38gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
39F47D12.7F47D12.7n/achrIII 6,294,525contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07646 (Kelch motif) contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013069 (BTB/POZ), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
40ZK354.3ZK354.3n/achrIV 5,310,807contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
41ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
42C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
43C10G11.8C10G11.8n/achrI 6,272,876contains similarity to Pfam domain PF00004 ATPase family associated with various cellular activities (AAA) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR001270 (Chaperonin clpA/B), IPR003960 (AAA ATPase, conserved site), IPR005937 (26S proteasome subunit P45), IPR001957 (Bacterial chromosomal replication initiator protein, DnaA), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
44C28D4.5C28D4.5n/achrIV 9,746,156contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
45Y106G6G.4Y106G6G.4n/achrI 10,322,489contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:P28968
46F58A6.5F58A6.50.0000000004chrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
47F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
48C03C11.1C03C11.1n/achrI 10,015,075contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR002952 (Eggshell protein)
49F35H8.4F35H8.4n/achrII 9,559,658contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein.; TR:Q8P0S2
50W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7