UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K06A5.1K06A5.10chrI 6,475,395contains similarity to Xenopus laevis MGC52985 protein.; TR:Q7ZWX1
2cgr-1T27A10.7n/achrX 3,598,867C. elegans CGR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
3F33E11.3F33E11.3n/achrV 302,371contains similarity to Interpro domain IPR015988 (STAT transcription factor, coiled coil)
4nspb-11F35C5.10n/achrII 12,907,461C. elegans NSPB-11 protein ;
5H12D21.10H12D21.10n/achrV 14,905,809contains similarity to Pfam domain PF04577 Protein of unknown function (DUF563) contains similarity to Interpro domain IPR007657 (Protein of unknown function DUF563)
6Y52B11A.7Y52B11A.7n/achrI 11,022,105contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
7srh-231C03G6.11n/achrV 7,351,540C. elegans SRH-231 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
8srg-3C18F10.6n/achrIII 6,269,673C. elegans SRG-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
9C14C11.7C14C11.7n/achrV 5,665,729
10Y38A10A.6Y38A10A.6n/achrV 6,098,058contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
11K09C4.2K09C4.2n/achrX 3,297,833
12C32B5.13C32B5.13n/achrII 961,636contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
13F53F4.12F53F4.12n/achrV 13,626,710contains similarity to Plasmodium falciparum Histidine-rich protein.; SW:HRP3_PLAFS
14snx-3W06D4.5n/achrI 9,064,058C. elegans SNX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00787 PX domain contains similarity to Interpro domain IPR001683 (Phox-like)
15W05H9.2W05H9.2n/achrX 6,269,009
16dnj-21T19B4.4n/achrI 5,677,239This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
17ZK822.1ZK822.1n/achrIV 11,920,082contains similarity to Homo sapiens myosin, heavy polypeptide 7B, cardiac muscle, beta; ENSEMBL:ENSP00000262873
18R07E4.3R07E4.3n/achrX 5,953,576contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
19srx-58C29F3.6n/achrV 15,353,194C. elegans SRX-58 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20his-5F45F2.3n/achrV 8,535,370his-5 encodes an H4 histone.
21T10B5.2T10B5.2n/achrV 1,849,449
22F25H9.1F25H9.1n/achrV 13,454,521contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
23R07E5.4R07E5.4n/achrIII 4,395,532contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
24C29F9.12C29F9.12n/achrIII 121,876
25B0034.1B0034.1n/achrII 5,971,250contains similarity to Interpro domain IPR003951 (Peptidase C58, Yersinia/Haemophilus virulence surface antigen)
26cdh-3ZK112.7n/achrIII 7,747,815cdh-3 encodes a member of the cadherin superfamily that affects morphogenesis of tail epithelia and excretory function; expressed predominantly in developing epithelial cells, and also expressed in the AC, excretory cell, various neurons, and vulval cells during different stages of development.
27R144.5R144.5n/achrIII 5,000,320contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Smith-Magenis syndrome chromosomal region candidate gene 8 protein; ENSEMBL:ENSP00000379048
28M01B2.8M01B2.8n/achrV 15,260,488contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
29ZK1240.3ZK1240.3n/achrII 2,321,141contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
30hnd-1C44C10.8n/achrX 11,685,111hnd-1 encodes a Hand bHLH transcription factor required for normal viability, gonadogenesis, and posterior body morphology; HND-1 is required for the formation of both somatic gonadal precursors and primordial germ cells, but not for later gonadogenesis; HND-1 is expressed embryogenesis in embryonic mesodermal precursor cells generating (mostly) body wall muscle, in somatic gonad precursor cells, and in some unidentified head cells; the primary defect in hnd-1 mutants may be, nonautonomously, in mesodermal precursor cells; somatic gonad precursor cells are normally generated in hnd-1 mutants, but not maintained.
31F21E9.2F21E9.2n/achrX 1,329,400
32H22K11.3H22K11.3n/achrX 6,783,682contains similarity to Candida albicans Hyphally-regulated protein precursor.; SW:P46591
33ceh-60F22A3.5n/achrX 6,527,181ceh-60 encodes a homeodomain-containing protein that is a member of the PBX family of homeodomain transcription factors; loss of ceh-60 activity via large-scale RNAi results in reduced fat content, sterility, and variable embryonic lethality.
34clec-238Y102A5C.17n/achrV 16,952,706C. elegans CLEC-238 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35F52H2.6F52H2.6n/achrX 2,561,931F52H2.6 is orthologous to the human gene 3BETA-HYDROXYSTEROL DELTA 24 REDUCTASE (DHCR24; OMIM:606418), which when mutated leads to disease.
36R11G1.1R11G1.1n/achrX 3,663,173contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
37R05D3.1R05D3.1n/achrIII 8,384,526contains similarity to Pfam domains PF00521 (DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A) , PF02518 (Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase) , PF00204 (DNA gyrase B) contains similarity to Interpro domains IPR002205 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit A or C-terminal), IPR013506 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B, region 2), IPR001241 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B or N-terminal), IPR011558 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B, conserved region), IPR013758 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit A or C-terminal, alpha-beta), IPR013757 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit A, alpha-helical), IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like), IPR013759 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B or N-terminal, alpha-beta), IPR001154 (DNA topoisomerase II, eukaryotic-type), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold), IPR013760 (DNA topoisomerase, type IIA, central)
38ZK402.5ZK402.5n/achrX 1,399,783contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
39rba-1K07A1.11n/achrI 9,617,307C. elegans RBA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
40C33H5.7C33H5.7n/achrIV 7,775,184contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
41ttr-35F22A3.2n/achrX 6,512,558C. elegans TTR-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
42ZK1290.5ZK1290.5n/achrII 7,530,168contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
43srw-12C41G6.2n/achrV 15,237,968C. elegans SRW-12 protein ;
44C25H3.3C25H3.3n/achrII 5,694,437contains similarity to Pfam domain PF03061 Thioesterase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006683 (Thioesterase superfamily), IPR003736 (Phenylacetic acid degradation-related protein)
45str-25F44G3.11n/achrV 16,116,262C. elegans STR-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46fbxa-193F59A1.9n/achrV 17,654,348C. elegans FBXA-193 protein; contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domains IPR001000 (Glycoside hydrolase, family 10), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
47R03G8.4R03G8.4n/achrX 13,102,677contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
48F16D3.4F16D3.4n/achrI 8,366,932F16D3.4 encodes a putative beta-tubulin folding cofactor D, orthologous to human TBCD (OMIM:604649); in early embryos, F16D3.4 is required for normally rapid microtubule elongation; F16D3.4 may be a ligand and effector of the ARL2 ortholog EVL-20; F16D3.4 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, and neurons; in mass RNAi assays, F16D3.4 is required for normal mitotic spindle elongation, embryonic and larval viability, fertility, locomotion, body shape, vulval development, and cuticular integrity.
49C31E10.6C31E10.6n/achrX 13,997,720contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
50mdt-4ZK546.13n/achrII 4,943,020C. elegans MDT-4 protein ; contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is MED4-PA;; FLYBASE:CG8609