UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K05F6.8K05F6.82e-68chrII 1,567,541This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
2ZK262.9ZK262.9n/achrV 18,440,924contains similarity to Brachydanio rerio Similar to formin binding protein 3.; TR:Q7ZUE4
3str-136F21F8.9n/achrV 8,278,202C. elegans STR-136 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4lin-11ZC247.3n/achrI 10,251,797lin-11 encodes a predicted LIM homeodomain transcription factor that affects vulval development, neuronal development and fate specification, utse cell differentiation, and fertility; it is expressed in some neurons, the vulva, pi cells and their progeny, and the spermatheca.
5F21C10.5F21C10.5n/achrV 9,125,800contains similarity to Xenopus tropicalis H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein.; SW:Q5RJV1
6F58A3.3F58A3.3n/achrX 11,012,975contains similarity to Mus musculus Glucosidase II beta-subunit (Fragment).; TR:Q9R1N5
7scrm-3C04E12.7n/achrV 3,356,584scrm-3 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); SCRM-3 is expressed in neurons, anal depressor muscle, and occasionally in body wall muscle cells; however, in apoptotic germline cells, SCRM-3 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-3 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-3(tm631) mutants have no obvious phenotype.
8Y43F8C.6Y43F8C.6n/achrV 19,636,948contains similarity to Interpro domains IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR009057 (Homeodomain-like)
9F28H6.7F28H6.7n/achrX 14,116,353contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
10ift-81F32A6.2n/achrX 5,302,501C. elegans IFT-81 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000533 (Tropomyosin)
11lrp-2T21E3.3n/achrI 3,939,445C. elegans LRP-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF07974 (EGF-like domain) , PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) (14), PF00058 (Low-density lipoprotein receptor repeat class B) (7)contains similarity to Interpro domains IPR000033 (), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
12C25A1.5C25A1.5n/achrI 10,178,041contains similarity to Pfam domains PF04116 (Fatty acid hydroxylase superfamily) , PF00173 (Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR006694 (Fatty acid hydroxylase), IPR001199 (Cytochrome b5)
13F31B9.1F31B9.1n/achrX 15,912,318contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
14C44B12.6C44B12.6n/achrIV 1,131,250contains similarity to Interpro domain IPR010345 (Interleukin-17)
15F21C10.1F21C10.1n/achrV 9,132,804contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
16W09B6.5W09B6.5n/achrII 1,140,824
17nspc-14F42F12.7n/achrX 12,358,778C. elegans NSPC-14 protein ;
18Y32B12A.3Y32B12A.3n/achrV 16,494,024contains similarity to Pfam domain PF01596 O-methyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002935 (O-methyltransferase, family 3)
19B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
20clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
22sre-7K02E11.2n/achrV 14,245,132C. elegans SRE-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
23C54G10.1C54G10.1n/achrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
24Y40B1A.2Y40B1A.2n/achrI 13,348,157contains similarity to Pfam domain PF00397 WW domain contains similarity to Interpro domains IPR002349 (WW), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
25stdh-4F25G6.5n/achrV 8,550,589stdh-4 encodes a putative steroid dehydrogenase expressed in larval and adult pharynx; STDH-4 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767 and STDH-1/-3; STDH-4 has no obvious function in mass RNAi assays.
26F48E8.6F48E8.6n/achrIII 5,444,858contains similarity to Pfam domain PF00773 RNB domain contains similarity to Interpro domain IPR001900 (Ribonuclease II and R)
27C23F12.3C23F12.3n/achrX 9,393,106
28str-256T01G6.9n/achrV 500,551C. elegans STR-256 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29nhr-233Y32B12B.6n/achrV 16,570,335C. elegans NHR-233 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30C17C3.13C17C3.13n/achrII 5,568,064
31srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C06E1.11C06E1.11n/achrIII 8,615,394
33F55G1.12F55G1.12n/achrIV 7,494,554contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
34F48C1.3F48C1.3n/achrI 5,314,472
35Y75B8A.19Y75B8A.19n/achrIII 12,229,214contains similarity to Lactococcus lactis Signal peptidase I (EC 3.4.21.89).; TR:Q9CDG2
36ceh-14F46C8.5n/achrX 7,530,621ceh-14 encodes a LIM homeodomain protein orthologous to Drosophila Lim3 and the vertebrate Lhx3 and Lhx4 proteins; ceh-14 is required for specification of the AFD thermosensory neurons and for normal thermotactic behavior; a ceh-14::GFP reporter fusion is expressed in head and tail neurons, including the AFD thermosensory neurons, during late embryonic, larval, and adult stages. Animals triply mutant for the LIM homeobox genes ceh-14, lin-11, and ttx-3 which are required for function of the AFD, AIZ, and AIY neurons, respectively, exhibit a basic cryophilic thermotaxis response suggesting that, in C. elegans, there is more than one pathway for integration of thermosensory input.
37tbx-8T07C4.2n/achrIII 10,348,548C. elegans TBX-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
38dos-1ZK507.4n/achrIII 9,105,304C. elegans DOS-1 protein ;
39C41A3.1C41A3.1n/achrX 5,427,831contains similarity to Pfam domains PF02801 (Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain) (5), PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF08659 (KR domain) (2), PF00501 (AMP-binding enzyme) , PF00668 (Condensation domain) , PF00106 (short chain dehydrogenase) , PF00109 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain) (5), PF00550 (Phosphopantetheine attachment site) (8), PF00698 (Acyl transferase domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR006163 (Phosphopantetheine-binding), IPR001242 (Condensation domain), IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR013968 (Polyketide synthase, KR), IPR000794 (Beta-ketoacyl synthase), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR014031 (Beta-ketoacyl synthase, C-terminal), IPR014043 (Acyl transferase), IPR014030 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal), IPR008262 (Lipase, active site), IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site), IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016039 (Thiolase-like), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR009081 (Acyl carrier protein-like), IPR001227 (Acyl transferase region)
40hlh-8C02B8.4n/achrX 8,118,315The hlh-8 gene encodes a helix-loop-helix protein required for normal muscle development, and hence for normal defecation and egg-laying.
41F29D10.2F29D10.2n/achrI 8,842,038contains similarity to Interpro domains IPR000853 (Nematoda metallothionein, family 6), IPR000006 (Metallothionein, vertebrate), IPR002952 (Eggshell protein), IPR004035 (Endonuclease III, iron-sulphur binding, conserved site-1), IPR001396 (Echinodermata metallothionein, family 4), IPR001008 (Mollusc metallothionein, family 2)
42str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43T27E4.5T27E4.5n/achrV 9,069,053contains similarity to Pfam domain PF00095 WAP-type (Whey Acidic Protein) 'four-disulfide core' contains similarity to Interpro domain IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core)
44acy-2C10F3.3n/achrV 5,978,731acy-2 encodes an adenylyl cyclase; an intragenic deletion of acy-2 is lethal at the first larval stage of development; the terminal phenotype resembles that seen in loss-of-function gsa-1 mutants.
45C50F7.6C50F7.6n/achrIV 7,721,871contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of PDZ domain-containing RING finger protein 4; ENSEMBL:ENSP00000370169
46srt-16C50H11.11n/achrV 3,064,037C. elegans SRT-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47K07G6.1K07G6.1n/achrII 1,741,871
48K10H10.5K10H10.5n/achrII 14,502,114contains similarity to Interpro domain IPR001030 (Aconitase/3-isopropylmalate dehydratase large subunit, alpha/beta/alpha)
49srx-137F09F3.13n/achrV 13,863,436C. elegans SRX-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50C14E2.2C14E2.2n/achrX 1,808,144contains similarity to Pfam domain PF00155 Aminotransferase class I and II contains similarity to Interpro domains IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR004839 (Aminotransferase, class I and II), IPR000796 (Aspartate/other aminotransferase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)