UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K05F1.3K05F1.30chrII 5,795,290contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
2F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293
3ZK512.8ZK512.8n/achrIII 9,146,610contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CDC5 is dispensable for premeiotic DNA synthesis and recombination, but required for tripartite synaptonemal complexes, haploidization, and spores; SGD:YMR001C
4F32B5.4F32B5.4n/achrI 2,692,274
5F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
6Y43F8C.3Y43F8C.3n/achrV 19,618,472contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
7C54G4.3C54G4.3n/achrI 8,005,688contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, skeletal muscle, fetal; ENSEMBL:ENSP00000255381
8F36D1.4F36D1.4n/achrI 11,272,019contains similarity to Homo sapiens Splice isoform C-alpha of O95644 Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 1; SW:O95644
9T21G5.4T21G5.4n/achrI 6,873,167contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
10Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
11F58E6.5F58E6.5n/achrV 9,753,985contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
12gsp-3W09C3.6n/achrI 4,710,013C. elegans GSP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
13F36A4.3F36A4.3n/achrIV 4,269,952contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
14Y106G6A.4Y106G6A.4n/achrI 9,931,412contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q99963 SH3-containing GRB2-like protein 3; ENSEMBL:ENSP00000321799
15T27E7.1T27E7.1n/achrIV 14,520,345contains similarity to Bos taurus Annexin A7 (Annexin VII) (Synexin) (Fragment).; SW:ANX7_BOVIN
16E03H12.7E03H12.7n/achrIV 4,988,167contains similarity to Danio rerio Protein FAM133.; SW:A1A5I1
17rmd-3B0491.3n/achrII 11,338,942C. elegans RMD-3 protein ; contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54XR4
18R02D5.7R02D5.7n/achrV 14,480,818contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
19Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
20T22B3.3T22B3.3n/achrIV 11,703,476contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
21F40H6.1F40H6.1n/achrIII 6,057,696
22Y57A10B.7Y57A10B.7n/achrII 12,393,162contains similarity to Rattus norvegicus Merlin (Schwannomin) (Neurofibromin 2) (Fragment).; SW:MERL_RAT
23F36A2.10F36A2.10n/achrI 8,819,797contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR005819 (Histone H5)
24C03C11.1C03C11.1n/achrI 10,015,075contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR002952 (Eggshell protein)
25F26F4.2F26F4.2n/achrIII 4,911,567F26F4.2 encodes a novel protein with high similarity to C. elegans F37A8.1 and C. briggsae CBG18186.
26F47B3.5F47B3.5n/achrI 3,963,648contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
27F36D3.4F36D3.4n/achrV 16,517,063contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
28Y57G11A.2Y57G11A.2n/achrIV 14,518,253contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
29F13G11.2F13G11.2n/achrIV 14,633,712contains similarity to Rattus norvegicus Chondroadherin precursor (Cartilage leucine-rich protein).; SW:CHAD_RAT
30C45G9.4C45G9.4n/achrIII 5,063,224contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
31C35E7.9C35E7.9n/achrI 10,807,562contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
32C24D10.2C24D10.2n/achrIV 5,163,991contains similarity to Interpro domain IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
33C28D4.5C28D4.5n/achrIV 9,746,156contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
34W06D4.2W06D4.2n/achrI 9,057,051contains similarity to Pyrobaculum aerophilum PaREP2b.; TR:Q8ZWN7
35R05D3.5R05D3.5n/achrIII 8,349,282
36C01G12.8C01G12.8n/achrII 14,595,473contains similarity to Pfam domains PF00689 (Cation transporting ATPase, C-terminus) , PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) , PF00690 (Cation transporter/ATPase, N-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR005775 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit, eukaryotic), IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR004014 (ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR006068 (ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump)
37C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
38C15H7.3C15H7.3n/achrIII 9,651,090contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
39spe-11F48C1.7n/achrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
40T05F1.8T05F1.8n/achrI 9,643,072contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
41C41G7.6C41G7.6n/achrI 9,526,981contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
42T16A9.5T16A9.5n/achrV 14,214,256contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
43C01G10.14C01G10.14n/achrV 15,105,627contains similarity to Pfam domain PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain contains similarity to Interpro domain IPR005121 (Phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, ferrodoxin-fold anticodon-binding)
44Y37D8A.5Y37D8A.5n/achrIII 12,854,726contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
45C04F12.6C04F12.6n/achrI 9,693,209contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR013303 (Wnt-14 protein)
46C47A4.5C47A4.5n/achrIV 13,745,790contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
47F07A5.2F07A5.2n/achrI 7,353,071contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Serine/arginine repetitive matrix protein 2; ENSEMBL:ENSP00000371738
48C16A11.7C16A11.7n/achrII 4,256,423
49T28F4.3T28F4.3n/achrI 7,485,104contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
50ZC262.1ZC262.1n/achrIII 8,341,087