UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04H8.2K04H8.20chrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
2C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
3F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
4nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
5F58A3.4F58A3.4n/achrX 11,010,149contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
6C46H11.3C46H11.3n/achrI 5,041,773contains similarity to Pfam domain PF04699 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) contains similarity to Interpro domains IPR006789 (ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
7F53E10.5F53E10.5n/achrV 2,597,474
8clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
9T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
11srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12osm-12Y75B8A.12n/achrIII 12,196,633C. elegans OSM-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016575 (Bardet-Biedl syndrome 7 protein)
13srw-26T05G11.3n/achrV 15,931,865C. elegans SRW-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
14C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
15srh-18C50B6.5n/achrV 13,319,254C. elegans SRH-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
17srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
19C32B5.7C32B5.7n/achrII 962,400contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
20ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
21srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
24srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
25R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
26Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
27T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
28K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
31C15C8.5C15C8.5n/achrV 12,749,106contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
32C05D9.3C05D9.3n/achrX 1,114,346contains similarity to Pfam domain PF07974 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR002369 (Integrin beta subunit, N-terminal), IPR001169 (Integrin beta subunit, C-terminal), IPR015812 (Integrin beta subunit), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
33srbc-58R09E12.2n/achrV 776,135C. elegans SRBC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34bath-23Y49F6C.5n/achrII 3,371,722C. elegans BATH-23 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
35srw-65Y38H6C.2n/achrV 20,497,408C. elegans SRW-65 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36str-14T08G3.2n/achrV 16,454,252C. elegans STR-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
38T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
39gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40C17C3.13C17C3.13n/achrII 5,568,064
41F09C11.1F09C11.1n/achrIV 543,658
42K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43C17A2.5C17A2.5n/achrII 3,834,625contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
44M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
45H04D03.3H04D03.3n/achrIII 10,443,934contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
46ZK512.2ZK512.2n/achrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
47scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
48F53H2.3F53H2.3n/achrV 20,399,182contains similarity to Interpro domain IPR006034 (Asparaginase/glutaminase)
49R06B9.2R06B9.2n/achrII 13,767,269contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
50C18A11.4C18A11.4n/achrX 8,046,427contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)