UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04F1.10K04F1.100chrV 1,663,542contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR000494 (EGF receptor, L domain)
2srb-3C27D6.8n/achrII 5,166,058C. elegans SRB-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3B0416.3B0416.3n/achrX 9,292,441
4srbc-7C18B10.4n/achrV 7,486,852C. elegans SRBC-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
5F41C6.4F41C6.4n/achrX 6,874,202
6T19H5.2T19H5.2n/achrII 9,475,595contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001176 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
7F57G8.7F57G8.7n/achrV 16,329,811contains similarity to Antarctic bacterium str 643 Metalloproteinase precursor.; TR:Q9KH34
8F28A10.5F28A10.5n/achrII 850,172contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
9snf-6M01G5.5n/achrIII 1,526,486snf-6 encodes a member of the sodium:neurotransmitter symporter family.
10T24E12.3T24E12.3n/achrII 3,776,733
11ZC412.8ZC412.8n/achrV 14,879,632contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
12nhr-185F47C10.1n/achrV 3,845,862C. elegans NHR-185 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13F36H12.2F36H12.2n/achrIV 5,275,375
14twk-32F53C11.6n/achrV 13,798,574C. elegans TWK-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF00041 (Fibronectin type III domain) (2), PF07885 (Ion channel) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR009147 (Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), IPR013099 (Ion transport 2)
15F36A4.11F36A4.11n/achrIV 4,245,281
16pop-1W10C8.2n/achrI 2,826,881pop-1 encodes an HMG box-containing protein that is the sole C. elegans member of the TCF/LEF family of transcription factors; in C. elegans, POP-1 functions as a component of the canonical and noncanonical Wnt signaling pathways that are required for cell migrations and binary cell fate decisions associated with asymmetric cell division, respectively; in yeast two-hybrid assays, the POP-1 N-terminal beta-catenin binding domain interacts with BAR-1/beta-catenin as well as with the more divergent beta-catenin, SYS-1; when coexpressed with SYS-1, POP-1 is able to activate transcription from a promoter with TCF binding sites; during development, maternally provided POP-1 is first detected in the nuclei of maturing oocytes and then in nearly all cells of the early embryo; in sister blastomeres in the early embryo, POP-1 is detected at lower levels in posterior blastomeres, such as E and P3, than in corresponding anterior blastomeres, MS and C; in later developmental stages, POP-1 is detected in a subset of tissues including hypodermal seam cells, gonadal precursors, and the developing vulva; in the vulva, POP-1 also exhibits an asymmetric staining pattern, with sister cells showing high or low levels of POP-1 depending upon their orientation along the anterior/posterior axis of the vulva.
17C56A3.4C56A3.4n/achrV 13,551,128contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
18C46A5.8C46A5.8n/achrIV 7,769,193
19D1044.5D1044.5n/achrIII 5,524,267
20R09D1.3R09D1.3n/achrII 9,439,305contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
21ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
22srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23F01F1.13F01F1.13n/achrIII 5,877,744contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
24ZK1127.3ZK1127.3n/achrII 7,055,637contains similarity to Pfam domain PF07904 CT20 family contains similarity to Interpro domain IPR012423 (CT20)
25C48C5.3C48C5.3n/achrX 8,959,409contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26ZK856.11ZK856.11n/achrV 10,204,273contains similarity to Pfam domain PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR006196 (S1, IF1 type), IPR001253 (Eukaryotic initiation factor 1A (eIF-1A))
27F20G4.2F20G4.2n/achrI 7,914,259contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YER190W
28D1014.2D1014.2n/achrV 8,145,287contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29srh-36T03D3.4n/achrV 2,820,623C. elegans SRH-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30srb-12F58A6.10n/achrII 5,153,860C. elegans SRB-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
31F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
32C02F4.5C02F4.5n/achrIV 10,523,762contains similarity to Rattus norvegicus Collagen type XXVII proalpha 1 chain.; TR:Q80ZF0
33str-84F59E11.13n/achrV 8,980,200C. elegans STR-84 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
35B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
36T05A8.6T05A8.6n/achrII 2,739,156contains similarity to Xenopus laevis Integumentary mucin C.1 (FIM-C.1) (Fragment).; SW:Q05049
37srx-135F09F3.11n/achrV 13,860,290C. elegans SRX-135 protein ;
38K01G12.3K01G12.3n/achrIV 14,194,711contains similarity to Homo sapiens Acidic (Leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member E; ENSEMBL:ENSP00000358111
39srw-94H06H21.1n/achrIV 4,815,890C. elegans SRW-94 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
40C46E10.8C46E10.8n/achrII 3,726,646contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
41pqn-11C09G1.1n/achrX 15,969,125PQN-11 encodes an unfamiliar protein with a glutamine/asparagine-rich domain that is dispensable for viability and gross morphology.
42M01E11.1M01E11.1n/achrI 5,582,772contains similarity to Pfam domain PF04140 Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family contains similarity to Interpro domain IPR007269 (Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase)
43F49C12.4F49C12.4n/achrIV 9,303,356contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
44mes-1F54F7.5n/achrX 11,859,856The mes-1 gene encodes a receptor tyrosine kinase-like protein that is required for unequal cell divisions in the early embryonic germline; during embryonic cell divisions, mes-1 is involved in positioning of the early mitotic spindle and of associated P granules.
45F54C1.1F54C1.1n/achrI 5,011,081contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
46srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F36D4.1F36D4.1n/achrV 9,418,520
48ZC266.1ZC266.1n/achrV 4,700,209
49F41G4.1F41G4.1n/achrX 16,841,928contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus 33 kDa inner dynein arm light chain, axonemal (p33).; SW:Q26630
50ZC477.4ZC477.4n/achrIV 7,098,647