UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nas-33K04E7.30chrX 6,453,429C. elegans NAS-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
2clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
3str-256T01G6.9n/achrV 500,551C. elegans STR-256 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4clec-212F19F10.7n/achrV 7,566,626C. elegans CLEC-212 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
5str-136F21F8.9n/achrV 8,278,202C. elegans STR-136 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F31B9.1F31B9.1n/achrX 15,912,318contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7F21C10.5F21C10.5n/achrV 9,125,800contains similarity to Xenopus tropicalis H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein.; SW:Q5RJV1
8Y43F8C.6Y43F8C.6n/achrV 19,636,948contains similarity to Interpro domains IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR009057 (Homeodomain-like)
9clec-140T05A7.2n/achrII 4,675,089C. elegans CLEC-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10F26H9.2F26H9.2n/achrI 9,292,112contains similarity to Pfam domain PF02755 RPEL repeat contains similarity to Interpro domain IPR004018 (RPEL repeat)
11F52G3.4F52G3.4n/achrX 16,950,151
12srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13nhr-208R07B7.15n/achrV 12,095,111C. elegans NHR-208 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14sre-7K02E11.2n/achrV 14,245,132C. elegans SRE-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
15srh-190C17E7.2n/achrV 3,903,811C. elegans SRH-190 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16srh-207ZK262.1n/achrV 18,409,607C. elegans SRH-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17C18B2.2C18B2.2n/achrX 3,625,928contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
18R09H3.1R09H3.1n/achrX 1,660,650contains similarity to Sulfolobus solfataricus DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q97WH0
19srh-278T09F5.8n/achrV 15,171,028C. elegans SRH-278 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20col-148C12D8.8n/achrV 10,242,222C. elegans COL-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
21ift-81F32A6.2n/achrX 5,302,501C. elegans IFT-81 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000533 (Tropomyosin)
22K07G6.1K07G6.1n/achrII 1,741,871
23T18D3.7T18D3.7n/achrX 12,442,974contains similarity to Pfam domain PF01166 TSC-22/dip/bun family contains similarity to Interpro domain IPR000580 (TSC-22 / Dip / Bun)
24srt-16C50H11.11n/achrV 3,064,037C. elegans SRT-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25ztf-9ZK287.6n/achrV 9,691,558C. elegans ZTF-9 protein; contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
26srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27C33E10.8C33E10.8n/achrX 17,293,743This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28scrm-3C04E12.7n/achrV 3,356,584scrm-3 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); SCRM-3 is expressed in neurons, anal depressor muscle, and occasionally in body wall muscle cells; however, in apoptotic germline cells, SCRM-3 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-3 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-3(tm631) mutants have no obvious phenotype.
29wrn-1F18C5.2n/achrII 6,557,068wrn-1 encodes an ortholog of human WRN, which when mutated leads to Werner syndrome (OMIM:277700), and one of four C. elegans homologs of the RecQ DNA helicase family that includes E. coli RecQ; by homology, WRN-1 is predicted to function as a helicase, DNA-dependent ATPase, and exonuclease that plays a key role in DNA replication, recombination, and repair; RNA interference studies in C. elegans and the enhancement of many of the resulting phenotypes by ionizing radiation indicate that wrn-1 affects life span and aging and acts at a DNA damage checkpoint; the wrn-1 phenotypes such as premature aging are similar to those of Werner syndrome; immunolocalization studies indicate that WRN-1 expression is nuclear in cells at the embryonic, larval and adult stages.
30str-6T23D5.10n/achrV 15,749,587C. elegans STR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
31srj-29F22B8.1n/achrV 16,076,456C. elegans SRJ-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00060 (Ligand-gated ion channel) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) contains similarity to Interpro domains IPR001638 (Bacterial extracellular solute-binding protein, family 3), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001320 (Ionotropic glutamate receptor), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR001508 (NMDA receptor)
32nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
33ZK262.9ZK262.9n/achrV 18,440,924contains similarity to Brachydanio rerio Similar to formin binding protein 3.; TR:Q7ZUE4
34F58E2.3F58E2.3n/achrIV 3,468,626This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
35F58A3.3F58A3.3n/achrX 11,012,975contains similarity to Mus musculus Glucosidase II beta-subunit (Fragment).; TR:Q9R1N5
36nhr-233Y32B12B.6n/achrV 16,570,335C. elegans NHR-233 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
37AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
38C47A10.5C47A10.5n/achrV 17,775,721C47A10.5 encodes a D-aspartate oxidase (DASPO), paralogous to F18E3.7 and F20H11.5; recombinant C47A10.5 protein has DASPO acvitity on acidic D-amino acid substrates (e.g., D-aspartate, D-glutamate, or N-methyl-D-aspartate/NMDA), with highest catalytic efficiency on D-glutamate; since the C-terminal residues of C47A10.5 match the PTS1 consensus sequence, C47A10.5 is predicted to be peroxisomal.
39C54G10.1C54G10.1n/achrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
40M02A10.1M02A10.1n/achrX 707,178
41Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
42B0496.5B0496.5n/achrIV 7,421,847contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43C04F12.1C04F12.1n/achrI 9,676,100contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
44R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
45K03H6.2K03H6.2n/achrIV 1,512,894contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR008262 (Lipase, active site), IPR016201 (Plexin-like fold)
46srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47acy-2C10F3.3n/achrV 5,978,731acy-2 encodes an adenylyl cyclase; an intragenic deletion of acy-2 is lethal at the first larval stage of development; the terminal phenotype resembles that seen in loss-of-function gsa-1 mutants.
48C27D6.1C27D6.1n/achrII 5,174,657contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
49D2024.2D2024.2n/achrIV 7,244,813contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1
50D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058