UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04C2.5K04C2.52e-52chrIII 6,891,261
2R07E5.4R07E5.4n/achrIII 4,395,532contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
3C06E8.5C06E8.5n/achrIII 7,003,767contains similarity to Pfam domain PF02886 LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
4R07E4.3R07E4.3n/achrX 5,953,576contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
5T28C12.6T28C12.6n/achrV 6,335,928contains similarity to Pfam domain PF00095 WAP-type (Whey Acidic Protein) 'four-disulfide core' contains similarity to Interpro domain IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core)
6R12E2.7R12E2.7n/achrI 4,154,200contains similarity to Homo sapiens Galectin-3; ENSEMBL:ENSP00000254301
7R74.2R74.2n/achrIII 4,188,552contains similarity to Interpro domains IPR008376 (Synembryn), IPR002952 (Eggshell protein)
8K10H10.4K10H10.4n/achrII 14,500,979contains similarity to Saccharomyces cerevisiae topoisomerase I; SGD:YOL006C
9H25K10.5H25K10.5n/achrIV 16,231,750contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10nspb-4F38A5.10n/achrIV 6,598,366C. elegans NSPB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
11K06A5.1K06A5.1n/achrI 6,475,395contains similarity to Xenopus laevis MGC52985 protein.; TR:Q7ZWX1
12T22C8.6T22C8.6n/achrII 8,628,922contains similarity to Xenopus laevis Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2 homolog 1 (hnRNP A2(A)).; SW:RO21_XENLA
13T02C1.1T02C1.1n/achrIII 9,248,028contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR003613 (U box), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
14F55G11.10F55G11.10n/achrIV 12,949,482contains similarity to Tritrichomonas foetus Superoxide dismutase 1 (Iron superoxide dismutase) (EC 1.15.1.1)s(Superoxide dismutase [Mn/Fe]).; TR:Q95051
15T09B4.4T09B4.4n/achrI 6,168,285contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
16hnd-1C44C10.8n/achrX 11,685,111hnd-1 encodes a Hand bHLH transcription factor required for normal viability, gonadogenesis, and posterior body morphology; HND-1 is required for the formation of both somatic gonadal precursors and primordial germ cells, but not for later gonadogenesis; HND-1 is expressed embryogenesis in embryonic mesodermal precursor cells generating (mostly) body wall muscle, in somatic gonad precursor cells, and in some unidentified head cells; the primary defect in hnd-1 mutants may be, nonautonomously, in mesodermal precursor cells; somatic gonad precursor cells are normally generated in hnd-1 mutants, but not maintained.
17K08H10.6K08H10.6n/achrV 9,994,779contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
18srx-29K06B4.9n/achrV 15,697,466C. elegans SRX-29 protein ;
19his-11ZK131.5n/achrII 13,821,955his-11 encodes an H2B histone; by homology, HIS-11 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-11 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
20B0034.1B0034.1n/achrII 5,971,250contains similarity to Interpro domain IPR003951 (Peptidase C58, Yersinia/Haemophilus virulence surface antigen)
21C24B5.4C24B5.4n/achrV 9,196,537contains similarity to Pfam domain PF08925 Domain of Unknown Function (DUF1907) contains similarity to Interpro domain IPR015021 (Region of unknown function DUF1907)
22his-15ZK131.9n/achrII 13,818,464his-15 encodes an H2B histone.
23H12D21.10H12D21.10n/achrV 14,905,809contains similarity to Pfam domain PF04577 Protein of unknown function (DUF563) contains similarity to Interpro domain IPR007657 (Protein of unknown function DUF563)
24his-66H02I12.6n/achrIV 11,400,571his-66 encodes an H2B histone.
25nspb-10C01G12.6n/achrII 14,588,002C. elegans NSPB-10 protein ;
26F32E10.2F32E10.2n/achrIV 7,576,735contains similarity to Pfam domain PF00385 'chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR016197 (Chromo domain-like)
27his-13ZK131.7n/achrII 13,820,324his-13 encodes an H3 histone; his-13 is contained within the histone gene cluster HIS3.
28srz-64Y57G7A.7n/achrII 1,291,002C. elegans SRZ-64 protein ;
29acbp-6Y17G7B.1n/achrII 11,972,918C. elegans ACBP-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00887 Acyl CoA binding protein contains similarity to Interpro domains IPR014352 (FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle), IPR000582 (Acyl-CoA-binding protein, ACBP)
30T01D1.3T01D1.3n/achrII 175,055
31dnj-21T19B4.4n/achrI 5,677,239This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
32K03H1.11K03H1.11n/achrIII 9,951,334contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
33cut-4E04D5.3n/achrII 10,437,905C. elegans CUT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
34C45G9.12C45G9.12n/achrIII 5,070,975
35rnh-1.3C04F12.9n/achrI 9,710,453C. elegans RNH-1.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
36set-4C32D5.5n/achrII 6,330,534set-4 encodes a putative histone H4 lysine-20 methyltransferase; SET-4 is orthologous to Drosophila SUV4-20, and to human SUV420H1 (OMIM:610881) and SUV420H2; neither set-4(n4600) nor set-4(RNAi) have any obvious phenotypes.
37F49D11.6F49D11.6n/achrI 10,907,943contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
38tag-203K02F2.3n/achrI 6,824,603C. elegans TAG-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF03178 CPSF A subunit region contains similarity to Interpro domains IPR004871 (Cleavage and polyadenylation specificity factor, A subunit, C-terminal), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
39C25H3.3C25H3.3n/achrII 5,694,437contains similarity to Pfam domain PF03061 Thioesterase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006683 (Thioesterase superfamily), IPR003736 (Phenylacetic acid degradation-related protein)
40F33E11.3F33E11.3n/achrV 302,371contains similarity to Interpro domain IPR015988 (STAT transcription factor, coiled coil)
41ceh-60F22A3.5n/achrX 6,527,181ceh-60 encodes a homeodomain-containing protein that is a member of the PBX family of homeodomain transcription factors; loss of ceh-60 activity via large-scale RNAi results in reduced fat content, sterility, and variable embryonic lethality.
42R12E2.14R12E2.14n/achrI 4,150,308contains similarity to Interpro domain IPR004051 (Potassium channel, voltage dependent, Kv1.4)
43D1054.1D1054.1n/achrV 10,769,166contains similarity to Pfam domain PF01734 Patatin-like phospholipase contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin)
44F49E12.10F49E12.10n/achrII 8,391,583contains similarity to Pfam domain PF01598 contains similarity to Interpro domain IPR006088 (Sterol desaturase)
45C40H1.2C40H1.2n/achrIII 9,318,561contains similarity to Eikenella corrodens Cpn60 (Fragment).; TR:Q8KP64
46cpin-1F38E11.3n/achrIV 9,452,280cpin-1 is orthologous to a mammalian protein variously identified as guanine aminohydrolase (or guanine deaminase, or guanase), cypin, or p51-nedasin.
47C31E10.6C31E10.6n/achrX 13,997,720contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
48sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
49T05H10.4T05H10.4n/achrII 8,053,981contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Involved in cell-type-specific transcription and pheromone response; SGD:YMR043W
50Y37E11B.2Y37E11B.2n/achrIV 3,578,985