UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K04A8.3K04A8.32e-64chrV 6,559,849
2F58F9.1F58F9.1n/achrIV 6,251,691contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
3F32B5.2F32B5.2n/achrI 2,698,698
4T26C11.4T26C11.4n/achrX 1,843,047contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
5srt-2Y45G12C.5n/achrV 2,545,033C. elegans SRT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
6fbxa-148Y102A5C.9n/achrV 16,939,509C. elegans FBXA-148 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
7lgc-38F11H8.2n/achrIII 7,014,295F11H8.2 encodes an UNC-49-like GABA receptor subunit.
8nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
9clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10Y37E11B.9Y37E11B.9n/achrIV 3,602,566
11F16H11.2F16H11.2n/achrX 4,662,854contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q23LR2
12tag-96M01D7.4n/achrI 1,847,837tag-96 encodes a galactokinase that is a member of the GHMP family of kinases and closely related to the vertebrate galactokinase 2 (GALK2) carbohydrate kinases.
13F55D12.1F55D12.1n/achrI 7,884,957contains similarity to Brachydanio rerio Hypothetical protein.; TR:Q803L4
14C24A8.1C24A8.1n/achrX 4,323,582C24A8.1 encodes an homolog of mammalian D2 or D3 dopamine receptors, and a paralog of DOP-2/-3; C24A8.1 is expressed in the nervous system; because of its paralogy, C24A8.1 might act redundantly with DOP-2 to promote the basal slowing response to bacterial feeding, or it might account for the residual response to excess dopamine seen in triple dop-1/-2/-3 mutants; but C24A8.1 otherwise has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
15R08C7.4R08C7.4n/achrIV 4,436,206contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
16B0198.2B0198.2n/achrX 12,030,645contains similarity to Dictyostelium discoideum Non-receptor tyrosine kinase spore lysis A (EC 2.7.1.112) (Tyrosine-sprotein kinase 1).; SW:KYK1_DICDI
17F38C2.4F38C2.4n/achrIV 16,270,980contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
18dhs-16C10F3.2n/achrV 5,984,592dhs-16 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
19C37C3.7C37C3.7n/achrV 7,836,124contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
20math-5C16C4.10n/achrII 1,882,210C. elegans MATH-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
21M176.4M176.4n/achrII 9,421,150contains similarity to Pfam domain PF07947 YhhN-like protein contains similarity to Interpro domains IPR012506 (YhhN-like), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3)
22ZK721.4ZK721.4n/achrX 8,780,140contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
24C06B3.7C06B3.7n/achrV 13,910,615contains similarity to Streptococcus agalactiae Tn5252, relaxase.; TR:Q8DZ67
25C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
26nhr-150C06B8.1n/achrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27sprr-1R03A10.6n/achrX 15,467,342C. elegans SPRR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28F54G8.1F54G8.1n/achrIII 9,156,050contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29ZK1067.4ZK1067.4n/achrII 9,211,645ZK1067.4 is orthologous to the human gene PROTEOLIPID PROTEIN 1 (PLP1; OMIM:300401), encoding the primary constituent of myelin, which when mutated leads to Pelizaeus-Merzbacher disease (OMIM:312080).
30ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
31dod-22F55G11.5n/achrIV 12,966,321C. elegans DOD-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
32srx-23F31F4.2n/achrV 683,114C. elegans SRX-23 protein ;
33C01A2.4C01A2.4n/achrI 13,393,035contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
34sri-10C54E10.4n/achrV 18,805,260C. elegans SRI-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR016040 (NAD(P)-binding)
35C27F2.1C27F2.1n/achrIII 4,989,295contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
36C39F7.1C39F7.1n/achrV 1,261,350
37F43B10.1F43B10.1n/achrX 16,662,035
38srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srsx-35F53F8.2n/achrV 20,677,605C. elegans SRSX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
41C32H11.1C32H11.1n/achrIV 12,913,842contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
42T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
43zig-8Y39E4B.8n/achrIII 13,126,726zig-8 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-8::gfp reporter fusion is expressed in the PVT neuron and in pharyngeal muscle.
44C40A11.5C40A11.5n/achrII 2,134,686contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
45E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
46fkh-5F26A1.2n/achrIII 4,845,567fkh-5 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.
47ZK512.2ZK512.2n/achrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
48F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
49srb-6R05H5.6n/achrII 10,195,792C. elegans SRB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
50T05C12.8T05C12.8n/achrII 8,189,001contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)