UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K03H9.3K03H9.30chrII 6,423,912
2C01H6.2C01H6.2n/achrI 7,206,143contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
3fbxa-218Y49E10.17n/achrIII 12,438,684C. elegans FBXA-218 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
4nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5T19D2.1T19D2.1n/achrX 3,935,349contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) (4), PF01421 (Reprolysin (M12B) family zinc metalloprotease) contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR013273 (Peptidase M12B, ADAM-TS), IPR001590 (Peptidase M12B, ADAM/reprolysin)
6C35D10.12C35D10.12n/achrIII 4,873,622contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
7str-30T27C4.3n/achrV 3,725,910C. elegans STR-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8lin-52ZK632.13n/achrIII 9,824,348lin-52 encodes a novel protein that is most closely related to the Drosophila melanogaster CG15929 protein and the human protein XP_040376; lin-52 is a class B synthetic multivulva (synMuv) gene that appears to function with lin-35/Rb to negatively regulate vulval development; in addition, lin-52 is also required for germline and larval development.
9C55C3.1C55C3.1n/achrIV 5,711,705contains similarity to Pfam domains PF02886 (LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain) , PF01273 (LBP / BPI / CETP family, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
10C49G7.7C49G7.7n/achrV 4,036,291
11ubc-17B0403.2n/achrX 7,052,951C. elegans UBC-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
12F20B4.3F20B4.3n/achrX 17,706,033
13M163.2M163.2n/achrX 14,497,680contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
14C34H4.1C34H4.1n/achrIV 1,556,565contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
15E03H4.12E03H4.12n/achrI 12,436,494contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
16D1007.15D1007.15n/achrI 4,560,680contains similarity to Mus musculus Uncharacterized protein KIAA0195.; SW:Q7TSH8
17nxf-1C15H11.3n/achrV 14,414,076nxf-1 encodes a homolog of human TAP protein, a member of the NXF family of shuttling transport receptors for nuclear export of mRNA; binds RNA directly and its function has been shown to be conserved with the NXF family.
18T26E4.4T26E4.4n/achrV 15,791,503contains similarity to Oryctolagus cuniculus Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 2 (EC 2.4.1.69) (Secretorsblood group alpha-2-fucosyltransferase) (GDP-L-fucose:beta-D-sgalactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 2) (Alpha(1,2)FT 2)s(Fucosyltransferase 2).; SW:FUT2_RABIT
19osm-6R31.3n/achrV 11,925,995osm-6 encodes a novel protein that is orthologous to the IFT52 component of the intraflagellar transport particle; osm-6 activity is required cell autonomously for proper sensory cilium structure and thus for normal ciliated sensory neuron function; OSM-6 is a component of the intraflagellar transport particle subcomplex B, and OSM-6::GFP reporter fusions are expressed exclusively in ciliated sensory neurons.
20C49A1.10C49A1.10n/achrI 14,243,227contains similarity to Mus musculus Proteinase activated receptor 3 precursor (PAR-3) (Thrombin receptor-slike 2) (Coagulation factor II receptor-like 2).; SW:PAR3_MOUSE
21E01G6.2E01G6.2n/achrX 12,257,730contains similarity to Streptomyces coelicolor;Streptomyces lividans Putative secreted protein (Putative TWIN ARGININ translocationsreceptor).; TR:Q9RJ68
22C28G1.2C28G1.2n/achrX 8,837,092contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
23nhr-215T07C5.4n/achrX 12,699,419C. elegans NHR-215 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24T22D1.1T22D1.1n/achrIV 6,924,455contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR001711 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific, Y domain), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
25osm-9B0212.5n/achrIV 3,554,256The osm-9 gene encodes a capsaicin receptor homolog involved in sensory responses to a subset of chemical stimuli and to ASH neuron-mediated osmotic and mechanical stimuli; OSM-9 is also involved in adaptation to volatile odorants and salts.
26F48F5.2F48F5.2n/achrV 20,441,470contains similarity to Homo sapiens Intestinal mucin; TR:O43420
27pqn-66T16A1.7n/achrII 2,088,014The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
28T26A8.2T26A8.2n/achrIV 8,427,897contains similarity to Homo sapiens UPF0513 membrane protein; ENSEMBL:ENSP00000258173
29W07E11.1W07E11.1n/achrX 10,093,967contains similarity to Pfam domains PF04898 (Glutamate synthase central domain) , PF01645 (Conserved region in glutamate synthase) , PF01266 (FAD dependent oxidoreductase) , PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF01493 (GXGXG motif) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR006005 (Glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 1), IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR006982 (Glutamate synthase, central-N), IPR002932 (Glutamate synthase, central-C), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR002489 (Glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal), IPR012285 (Fumarate reductase, C-terminal), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR012220 (Glutamate synthase, eukaryotic), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
30fbxb-65C43D7.2n/achrV 19,330,120This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
31ceh-31C33D12.1n/achrX 3,069,626ceh-31 encodes a protein containing a homeobox domain.
32T03F7.5T03F7.5n/achrV 11,297,691contains similarity to Staphylococcus aureus YdbT-like protein.; TR:Q8GPI5
33T16A9.4T16A9.4n/achrV 14,218,017T16A9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T16A9.4 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
34sdz-4C32B5.16n/achrII 959,537C. elegans SDZ-4 protein ;
35T22D1.12T22D1.12n/achrIV 6,930,087contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
37cyp-13A1T10B9.8n/achrII 9,780,487C. elegans CYP-13A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
38C06A5.10C06A5.10n/achrI 5,982,746
39T16A1.3T16A1.3n/achrII 2,084,511
40F41F3.1F41F3.1n/achrV 4,655,174
41srg-25T09D3.5n/achrV 5,343,042C. elegans SRG-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
42F29B9.11F29B9.11n/achrIV 4,659,939
43fbxb-107F29A7.2n/achrII 2,760,240C. elegans FBXB-107 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
44twk-30F36A2.4n/achrI 8,810,320C. elegans TWK-30 protein; contains similarity to Pfam domains PF00041 (Fibronectin type III domain) (2), PF07885 (Ion channel) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013099 (Ion transport 2)
45F56H1.3F56H1.3n/achrI 5,732,820contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR015988 (STAT transcription factor, coiled coil), IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
46str-33C24B9.1n/achrV 2,729,388C. elegans STR-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F57G4.9F57G4.9n/achrV 17,644,291contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
48F01G12.6F01G12.6n/achrX 16,401,117contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG11727-PA;; FLYBASE:CG11727
49C04G6.2C04G6.2n/achrII 5,093,709contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
50Y45F10A.3Y45F10A.3n/achrIV 13,511,278contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1