UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K03H9.1K03H9.12e-97chrII 6,431,519
2T06C12.12T06C12.12n/achrV 15,892,264contains similarity to Pyrococcus horikoshii Hypothetical protein PH0933.; TR:O58684
3Y7A5A.3Y7A5A.3n/achrX 15,783,069
4C16D9.6C16D9.6n/achrV 8,249,274contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9520-PA;; FLYBASE:CG9520
5srd-36R04D3.6n/achrX 13,294,014C. elegans SRD-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6srt-25C16D9.7n/achrV 8,257,371C. elegans SRT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7bath-25T27C10.4n/achrI 10,877,883C. elegans BATH-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00036 (EF hand) (2), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
8E02C12.12E02C12.12n/achrV 9,380,457contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domain IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
9R04F11.1R04F11.1n/achrV 12,309,572R04F11.1 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; R04F11.1 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; R04F11.1 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
10srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F16F9.1F16F9.1n/achrX 8,448,780contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
12C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
13srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
14srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15T24D5.1T24D5.1n/achrX 12,575,561contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV156 hypothetical protein.; TR:Q9YVT6
16tag-194W02D3.6n/achrI 6,730,509C. elegans TAG-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
17F01D4.8F01D4.8n/achrIV 10,451,925contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domain IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit)
18K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
19srh-142T08G3.3n/achrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F42A6.2F42A6.2n/achrIV 3,341,612
21T05A7.7T05A7.7n/achrII 4,680,482contains similarity to Interpro domain IPR000118 (Granulin)
22T23G4.2T23G4.2n/achrIV 13,688,527contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
23cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
24clec-55F08H9.9n/achrV 14,480,717C. elegans CLEC-55 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25Y70C5B.1Y70C5B.1n/achrV 16,662,837
26F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
27amt-2F49E11.3n/achrIV 13,044,619amt-2 encodes a transmembrane protein that is one of four C. elegans members of the ammonium transporter AMT/Rh family of proteins predicted to function in transport of ammonium ions across the plasma membrane.
28C30B5.5C30B5.5n/achrII 6,204,855contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013806 (Kringle-like fold), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
30C30F2.2C30F2.2n/achrX 16,080,929contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
31C01A2.6C01A2.6n/achrI 13,382,132contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54BK4
32C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
33Y43F8B.10Y43F8B.10n/achrV 19,475,668
34F56C4.2F56C4.2n/achrIV 10,642,026contains similarity to Oryza sativa DNA binding protein S1FA.; SW:S1FA_ORYSA
35ZC155.2ZC155.2n/achrIII 5,219,635contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold)
36K02D10.3K02D10.3n/achrIII 8,771,549
37str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38ilys-4C55F2.2n/achrIV 7,896,569C. elegans ILYS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
39F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
40Y6B3B.3Y6B3B.3n/achrI 13,716,143contains similarity to Interpro domain IPR010133 ()
41K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
42srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F10G8.2F10G8.2n/achrI 10,022,221contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
44F49F1.6F49F1.6n/achrIV 4,122,198contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
45clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
47K03A11.4K03A11.4n/achrX 13,080,030contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
48Y49E10.24Y49E10.24n/achrIII 12,486,416contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
49acr-21F27B3.2n/achrIII 6,584,504acr-21 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR); ACR-21 is a highly divergent member of the 'ACR-16' class of nAChR subunits, which includes ACR-7, ACR-9, ACR-10, ACR-11, ACR-14, ACR-15, ACR-16, and ACR-19, and is most closely related to the alpha-7 subunits of vertebrate nAChRs.
50Y43F8C.11Y43F8C.11n/achrV 19,670,774contains similarity to Mus sp Interleukin-3 receptor beta subunit (Fragment).; TR:Q64130