UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1rac-2K03D3.101.0000000000000001e-112chrIV 16,308,987rac-2 encodes a small Rho family GTPase that, along with CED-10 and MIG-2, is one of three C. elegans Rac-related proteins; genetic studies indicate that rac-2 functions redundantly with mig-2 and ced-10 to regulate CAN and PDE axon pathfinding and CAN cell migration; in addition, rac-2 functions slightly redundant with mig-2 during distal tip cell movement and slightly redundant with ced-10 during cell-corpse phagocytosis; as unc-73 mutations enhance rac-2 defects in axon pathfinding and CAN cell migration, UNC-73/Trio is a likely candidate to act upstream of RAC-2 and positively regulate its GTPase activity in vivo; further, as UNC-115 activity is required to mediate the morphogenetic effects of constitutively active RAC-2(G12V), UNC-115, an actin-binding protein, is likely to be a downstream effector of RAC-2; GFP::RAC-2 reporters expressed in neurons and neuroblasts reveal localization at cell margins and the nerve ring, the latter suggesting that GFP::RAC-2 associates with the axonal plasma membrane.
2srj-5F31F4.16n/achrV 652,439C. elegans SRJ-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F58E2.2F58E2.2n/achrIV 3,470,373
4clec-22F49A5.3n/achrV 16,859,205C. elegans CLEC-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5sru-25F31F4.14n/achrV 673,072C. elegans SRU-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
6clec-114C49A1.9n/achrI 14,233,796C. elegans CLEC-114 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
7srz-61K03D3.4n/achrIV 16,322,140C. elegans SRZ-61 protein ;
8W04G5.3W04G5.3n/achrI 11,629,776contains similarity to Arabidopsis thaliana Probable WRKY transcription factor 19 (WRKY DNA-binding protein 19).; SW:WR19_ARATH
9glr-3K10D3.1n/achrI 7,119,675glr-3 encodes a protein that contains a ligand-gated ion channel domain and a receptor family ligand binding domain with similarity to kainate-selective ionotropic glutamate receptor 2 (human GRIK2); expressed in the RIA neuron.
10nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
11Y6B3B.1Y6B3B.1n/achrI 13,699,504contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
12ham-1F53B2.6n/achrIV 12,543,852ham-1 encodes a novel protein with a winged helix DNA-binding motif; ham-1 is required for the asymmetric divisions of several neuroblasts in the developing embryo and may influence their spindle position; ham-1 mutations also exhibit HSN motor neuron migration defects; HAM-1 interacts with itself in a yeast two-hybrid screen and observations suggest that its multimerization is required for its proper localization; HAM-1 is cytoplasmic and is asymmetrically distributed to the posterior of the HSNPHB neuroblast.
13C24A8.1C24A8.1n/achrX 4,323,582C24A8.1 encodes an homolog of mammalian D2 or D3 dopamine receptors, and a paralog of DOP-2/-3; C24A8.1 is expressed in the nervous system; because of its paralogy, C24A8.1 might act redundantly with DOP-2 to promote the basal slowing response to bacterial feeding, or it might account for the residual response to excess dopamine seen in triple dop-1/-2/-3 mutants; but C24A8.1 otherwise has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
14Y40H7A.2Y40H7A.2n/achrIV 15,156,851contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
15C37C3.7C37C3.7n/achrV 7,836,124contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
16F16G10.1F16G10.1n/achrII 2,402,918contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
17ttr-13Y44A6B.4n/achrV 20,631,647C. elegans TTR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
18str-15T08G3.1n/achrV 16,458,013C. elegans STR-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19T07H6.4T07H6.4n/achrX 6,284,028contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
20T14G11.1T14G11.1n/achrX 2,690,488
21bbs-9C48B6.8n/achrI 6,920,270C. elegans BBS-9 protein ; contains similarity to Homo sapiens 95 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000346214
22D1081.4D1081.40.00005chrI 8,475,188contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
23Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
24flnb-1C23F12.2n/achrX 9,402,619C. elegans FLNB-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00630 (Filamin/ABP280 repeat) (2), PF00307 (Calponin homology (CH) domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR001298 (Filamin/ABP280 repeat), IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016146 (Calponin-homology), IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site), IPR001715 (Calponin-like actin-binding)
25F32D1.8F32D1.8n/achrV 4,377,156
26src-2F49B2.5n/achrI 14,325,568C. elegans SRC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
27E03A3.5E03A3.5n/achrIII 4,061,679contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold)
28B0286.1B0286.1n/achrII 4,382,555contains similarity to Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8; ENSEMBL:ENSP00000302239
29F38C2.4F38C2.4n/achrIV 16,270,980contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
30Y17D7B.2Y17D7B.2n/achrV 18,788,749contains similarity to Xenopus laevis Phosphoinositide-3-kinase.; TR:Q8UUU2
31clec-20T07H3.5n/achrII 1,594,363C. elegans CLEC-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32C08H9.11C08H9.11n/achrII 9,858,792contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
33B0001.4B0001.4n/achrIV 12,136,377contains similarity to Pfam domain PF00485 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR006083 (Phosphoribulokinase/uridine kinase), IPR006082 (Phosphoribulokinase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
34C07G3.8C07G3.8n/achrV 3,497,698contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
35F31A9.1F31A9.1n/achrX 1,797,616
36srh-298Y94A7B.5n/achrV 17,819,902C. elegans SRH-298 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37str-236K02H11.3n/achrV 1,527,292C. elegans STR-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein)
38srt-25C16D9.7n/achrV 8,257,371C. elegans SRT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39sra-1AH6.4n/achrII 9,520,857sra-1 encodes a predicted seven transmembrane receptor; expressed in the male SPD and SPV neurons.
40str-31C54F6.10n/achrV 7,507,570C. elegans STR-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000539 (Frizzled protein)
41F12A10.6F12A10.6n/achrII 5,494,268
42T05C12.8T05C12.8n/achrII 8,189,001contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
43T07D3.5T07D3.5n/achrII 886,263contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR009644 (Fukutin-related)
44srv-4F15E6.7n/achrIV 4,286,920C. elegans SRV-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
45F49E10.1F49E10.1n/achrX 5,899,725contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
46srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F40G12.2F40G12.2n/achrV 14,260,215contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
48T15B7.10T15B7.10n/achrV 6,811,130contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
49C38C5.1C38C5.1n/achrX 5,560,137
50srh-174F40D4.1n/achrV 17,179,348C. elegans SRH-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)