UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ceeh-1K02F3.60chrIII 830,425ceeh-1 encodes a soluble epoxide hydrolase (sEH) orthologous to human ABHD7 and ABHD9; recombinant CEEH-1 is biochemically active in vitro on epoxyeicosatrienoic acids and leukotoxins (EpOMEs); conversely, CEEH-1 is inhibited by urea-based antagonists of mammalian sEH that elevate EpOME levels when fed to C. elegans; perhaps because of genetic redundancy with its paralog CEEH-2, CEEH-1 has no obvious function in mass RNAi assays.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3grl-13F32D1.4n/achrV 4,363,652grl-13 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-13 is expressed in larval arcade cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
4C34D4.1C34D4.1n/achrIV 7,158,487contains similarity to Interpro domain IPR000956 (Stathmin)
5ubc-12R09B3.4n/achrI 11,911,676The ubc-12 gene encodes a ubiquitin-conjugating enzyme whose substrate is NED-8, and which is required for both embryogenesis and terminal hypodermal differentiation; ubc-12(RNAi) mutants either arrest during embryonic development or show pleotropic defects (e.g., vulval eversion during the L4 stage), as well as defective alae.
6Y49G5B.1Y49G5B.1n/achrV 5,228,330contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
7W10G6.1W10G6.1n/achrX 16,245,293contains similarity to Babesia bovis Merozoite surface antigen-2a2.; TR:Q95UH0
8M01G5.3M01G5.3n/achrIII 1,513,690contains similarity to Pfam domain PF07851 TMPIT-like protein contains similarity to Interpro domain IPR012926 (TMPIT-like)
9M02G9.3M02G9.3n/achrII 10,319,023contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
10srv-17C06E7.7n/achrIV 5,868,915C. elegans SRV-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11T08G5.9T08G5.9n/achrV 14,045,861contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
12K05G3.2K05G3.2n/achrX 16,497,319
13C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
14btb-5W05G11.5n/achrIII 60,257C. elegans BTB-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
15C01B10.9C01B10.9n/achrIV 6,633,581contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
16R11.3R11.3n/achrX 16,198,339contains similarity to Haemophilus influenzae Hypothetical protein HI0386.; SW:YBGC_HAEIN
17F28C6.5F28C6.5n/achrII 8,599,990contains similarity to Mus musculus Activity-dependent neuroprotector (Activity-dependent neuroprotectivesprotein).; SW:ADNP_MOUSE
18nhr-178F16B4.9n/achrV 1,605,896C. elegans NHR-178 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
19Y7A5A.7Y7A5A.7n/achrX 15,802,663contains similarity to Murine herpesvirus 72 Membrane virion glycoprotein 150.; TR:Q9DYE3
20C04C3.6C04C3.6n/achrIV 3,421,207contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21K12H4.2K12H4.2n/achrIII 8,047,973contains similarity to Pfam domain PF02410 Domain of unknown function DUF143 contains similarity to Interpro domain IPR004394 (Iojap-related protein)
22srh-257T06E6.6n/achrV 15,409,280C. elegans SRH-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR013333 (Ryanodine receptor, N-terminal)
23srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
25ZK697.8ZK697.8n/achrV 1,748,793contains similarity to Pfam domain PF00576 HIUase/Transthyretin family contains similarity to Interpro domain IPR000895 (Transthyretin)
26C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
27Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
28F28G4.5F28G4.5n/achrV 16,290,444contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
29JC8.7JC8.7n/achrIV 13,248,845contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C4orf27; ENSEMBL:ENSP00000261511
30Y75B8A.7Y75B8A.7n/achrIII 12,156,145contains similarity to Pfam domain PF04006 Mpp10 protein contains similarity to Interpro domains IPR012173 (U3 small nucleolar ribonucleoprotein complex, subunit Mpp10p), IPR007151 (Mpp10 protein)
31Y17G7B.3Y17G7B.3n/achrII 11,990,838Y17G7B.3 is orthologous to the human gene HYDROXYACYLGLUTATHIONE HYDROLASE (HAGH; OMIM:138760), which when mutated leads to disease.
32F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
33tag-179T24D1.4n/achrI 9,961,143C. elegans TAG-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF04922 DIE2/ALG10 family contains similarity to Interpro domains IPR016900 (Alpha-1, 2 glucosyltransferase Alg10), IPR007006 (DIE2/ALG10)
34str-61F14F8.1n/achrV 16,670,286C. elegans STR-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35C15B12.6C15B12.6n/achrX 6,498,835
36T10H4.4T10H4.4n/achrV 15,271,231contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
37M02F4.1M02F4.1n/achrX 3,028,999contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Splicing factor, arginine/serine-rich 12; ENSEMBL:ENSP00000284041
38Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
39W03C9.1W03C9.1n/achrII 11,961,452contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
40str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srbc-41F16B4.10n/achrV 1,613,815C. elegans SRBC-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
42str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43T06C12.14T06C12.14n/achrV 15,900,422contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
44srx-46E02C12.2n/achrV 9,353,867C. elegans SRX-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45C05C10.1C05C10.1n/achrII 9,918,735contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
46tmbi-4B0563.4n/achrX 9,155,606C. elegans TMBI-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01027 Uncharacterised protein family UPF0005 contains similarity to Interpro domain IPR006214 (Protein of unknown function UPF0005)
47nas-8C34D4.9n/achrIV 7,117,415nas-8 encodes an astacin-like metalloprotease.
48F48G7.4F48G7.4n/achrV 620,860
49srz-90C18D4.9n/achrV 17,528,936C. elegans SRZ-90 protein
50Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)