UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1K02E10.6K02E10.62.9999999999999997e-87chrX 2,481,834contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3fbxb-53F36H5.5n/achrII 1,759,512This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
4B0302.2B0302.2n/achrX 17,178,681
5K01A11.1K01A11.1n/achrIII 3,429,872contains similarity to Dictyostelium discoideum PAXILLIN-like protein.; TR:Q8MML5
6K11D12.9K11D12.9n/achrV 5,044,302contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
7Y76A2B.2Y76A2B.2n/achrIII 13,533,575contains similarity to Homo sapiens Reticulon-4 receptor precursor; ENSEMBL:ENSP00000043402
8F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
9ceh-16C13G5.1n/achrIII 8,624,237ceh-16 encodes a homeodomain protein orthologous to Drosophila and vertebrate Engrailed proteins involved in segment and appendage development; ceh-16 is an essential gene required for proper specification and differentiation of the lateral seam cells during embryonic development; in specifying seam cell fates, CEH-16 appears to act as a transcriptional regulator, repressing expression of the eff-1 gene required for cell fusion and inducing expression of seam cell-specific genes such as elt-5/GATA, nhr-73, and nhr-74; a rescuing CEH-16::GFP fusion protein is first expressed in the early embryo in cells of the AB lineage; in later embryonic stages CEH-16::GFP is seen in all lateral seam cell nuclei as well as in some anterior neurons; during postembryonic development, CEH-16::GFP is expressed in the DA1 and DD1 motorneurons.
10ZC416.2ZC416.2n/achrIV 3,634,511n/a
11Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
12cut-5R07E3.3n/achrX 10,336,033C. elegans CUT-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
13LLC1.2LLC1.2n/achrIV 14,460,481contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
14sra-39T21H8.4n/achrX 13,902,169C. elegans SRA-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
15sre-31F57G9.1n/achrII 12,407,787C. elegans SRE-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
16srh-297C17F4.4n/achrII 3,229,698C. elegans SRH-297 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR006084 (DNA repair protein (XPGC)/yeast Rad), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
18ZK84.4ZK84.4n/achrII 6,008,570
19Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20R57.2R57.2n/achrX 298,212contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
21C35D6.3C35D6.3n/achrIV 16,347,259contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
22srd-9T09D3.1n/achrV 5,352,409C. elegans SRD-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24ZK896.9ZK896.9n/achrIV 12,857,434ZK896.9 encodes a putative transporter of UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) and UDP-N-acetylgalactosamine (UDP-GalNAc), orthologous to human SLC35A3 (OMIM:605632) and paralogous to C03H5.2 and SRF-3; ZK896.9 has no obvious function in RNAi assays, but this could reflect genetic redundancy with its paralogs.
25nhr-251ZK488.4n/achrV 601,466C. elegans NHR-251 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26T20D4.19T20D4.19n/achrV 3,431,055contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
27C46A5.4C46A5.4n/achrIV 7,752,034contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal)
28C12D12.4C12D12.4n/achrX 3,486,561
29C11H1.2C11H1.2n/achrX 14,306,277contains similarity to Interpro domain IPR015672 (G-protein coupled receptor 89-related)
30C06E4.1C06E4.1n/achrIV 7,283,548
31srh-80DC2.1n/achrV 221,355C. elegans SRH-80 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
33M03B6.4M03B6.4n/achrX 13,859,911contains similarity to Halobacterium sp Vng0659h.; TR:Q9HRK3
34F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
35srh-219C06B8.6n/achrV 15,496,906C. elegans SRH-219 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srh-251R08H2.4n/achrV 15,379,118C. elegans SRH-251 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
38T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39lgc-13T01H10.1n/achrX 12,110,105C. elegans LGC-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
40C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
41T16H12.1T16H12.1n/achrIII 10,084,745contains similarity to Human papillomavirus type 70 E7 protein.; SW:VE7_HPV70
42F21D12.2F21D12.2n/achrII 7,318,858
43nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
44T15H9.6T15H9.6n/achrII 9,608,386contains similarity to Pfam domains PF04926 (Poly(A) polymerase predicted RNA binding domain) , PF01909 (Nucleotidyltransferase domain) , PF04928 (Poly(A) polymerase central domain) contains similarity to Interpro domains IPR007012 (Poly(A) polymerase, central region), IPR002934 (Nucleotidyltransferase), IPR007010 (Poly(A) polymerase, RNA-binding region), IPR014492 (Poly(A) polymerase), IPR011068 (Nucleotidyltransferase, class I, C-terminal-like)
45sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
46C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
47D1086.1D1086.1n/achrV 14,099,606contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
48Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005
49F55C5.6F55C5.6n/achrV 12,280,460contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
50ast-1T08H4.3n/achrII 4,131,358ast-1 encodes a novel ETS-box transcription factor; AST-1 is required for the proper navigation of some interneuron axons to their targets, for differentiation of the ventral cord pioneer neuron AVG, and for pharyngeal morphogenesis; AST-1 is transiently expressed in many head neurons late in their differentiation and axon outgrowth, and in a few pharyngeal cells; AST-1 is at first nuclear, but then relocates to spots in cell bodies and even neuronal processes; hypomorphic ast-1 mutants have axons extending laterally, and crossing over from the right axon tract to the left axon bundle; null ast-1(hd92) mutants are inviable, failing to attach a working pharynx to their cuticle during development and then starving as L1 larvae; behaviorally, hypomorphic ast-1 animals are at least superficially normal, indicating that the ventral nerve cord can tolerate at least some miswiring; AST-1 regulates odr-2 expression, while ast-1 expression is itself regulated by lin-11.