UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1elt-3K02B9.49e-127chrX 13,939,895The elt-3 gene encodes a GATA transcription factor expressed in the embryonic hypodermis; specifically, it is expressed in expressed in all of the major hypodermal cells except the lateral seam cells.
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3K10C8.2K10C8.2n/achrV 12,691,417K10C8.2 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that K10C8.2 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
4C09F12.2C09F12.2n/achrX 11,055,383contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q23C46
5F23F1.3F23F1.3n/achrII 32,686
6acc-1F58G6.4n/achrIV 9,660,974C. elegans ACC-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
7unc-130C47G2.2n/achrII 11,282,880A member of the forkhead domain family of transcription factors that affects the generation of the AWA and ASG chemosensory neurons and is partially required for male tail morphogenesis and embryogenesis; it is expressed in the AWA and ASG precursors; it is required for the graded spatial expression of the UNC-129 TGF-beta guidance factor.
8M03F8.4M03F8.4n/achrV 5,932,159contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
9C39F7.5C39F7.5n/achrV 1,267,440contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold)
10K08E7.6K08E7.6n/achrIV 12,580,060contains similarity to Aquifex aeolicus Probable DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:RA50_AQUAE
11asic-2T28F4.2n/achrI 7,481,759C. elegans ASIC-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive), IPR004726 (Degenerin)
12F23A7.5F23A7.5n/achrX 16,233,076contains similarity to Homo sapiens Isoform 3 of Cyclin-L1; VG:OTTHUMP00000173336
13sto-2F32A6.5n/achrX 5,309,627C. elegans STO-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01145 SPFH domain / Band 7 family contains similarity to Interpro domains IPR001107 (Band 7 protein), IPR001972 (Stomatin)
14nhr-207R07B7.14n/achrV 12,097,016C. elegans NHR-207 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR001728 (Thyroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15C50F2.8C50F2.8n/achrI 3,903,318contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) contains similarity to Interpro domains IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001452 (Src homology-3), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
16gcy-15ZC239.7n/achrII 3,194,642gcy-15 encodes a membrane guanylyl cyclase.
17ZC84.3ZC84.3n/achrIII 9,188,742contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
18F49E10.1F49E10.1n/achrX 5,899,725contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
19M03C11.1M03C11.1n/achrIII 10,394,622contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
20C38C3.6C38C3.6n/achrV 1,485,347contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
21F45E1.2F45E1.2n/achrX 8,003,850
22Y39A3B.3Y39A3B.3n/achrIII 1,986,275
23C01B12.2C01B12.2n/achrII 20,848contains similarity to Pfam domain PF01342 SAND domain contains similarity to Interpro domains IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
24F38C2.4F38C2.4n/achrIV 16,270,980contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
25F52F10.1F52F10.1n/achrV 1,560,979
26M05B5.6M05B5.6n/achrI 7,184,379contains similarity to Homo sapiens Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1; ENSEMBL:ENSP00000262209
27F53B1.8F53B1.8n/achrX 2,126,824contains similarity to Interpro domain IPR001441 (Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase)
28srh-174F40D4.1n/achrV 17,179,348C. elegans SRH-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29sto-6Y71H9A.2n/achrX 11,634,381C. elegans STO-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01145 SPFH domain / Band 7 family contains similarity to Interpro domains IPR001107 (Band 7 protein), IPR001972 (Stomatin)
30ndx-1T26E3.2n/achrI 12,680,484The ndx-1 gene encodes a NUDIX hydrolase.
31M01G4.1M01G4.1n/achrIII 6,665,107
32cyn-9T27D1.1n/achrIII 3,698,740cyn-9 encodes a peptidyl prolyl cis-trans isomerase most similar to human cyclophilin G (OMIM:606093); CYN-9 likely functions as a catalyst in the folding and modification of cuticle collagens; a cyn-9::lacZ reporter is expressed in the syncytial hypodermis from early larval through adult stages; cyn-9 mRNA is expressed most strongly at the mid-L3 and mid-L4 larval stages, the intermoult period when collagens are synthesized.
33C29F9.1C29F9.1n/achrIII 133,396
34cwp-4K11D12.1n/achrV 5,055,031cwp-4 encodes a protein with some similarity to mucins that is predicted to be secreted, and is alleged to be coexpressed with polycystins; CWP-4 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens.
35T14C1.1T14C1.1n/achrX 14,408,600T14C1.1 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that T14C1.1 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
36K01A6.6K01A6.6n/achrIV 11,738,764contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
37clec-89C09D1.2n/achrI 4,072,314C. elegans CLEC-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38sox-3F40E10.2n/achrX 14,692,543C. elegans SOX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG), IPR000135 (High mobility group box, HMG1/HMG2, subgroup)
39src-2F49B2.5n/achrI 14,325,568C. elegans SRC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
40F22E5.1F22E5.1n/achrII 2,676,663contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
41T23F4.2T23F4.2n/achrII 1,164,528
42T04B8.1T04B8.1n/achrII 635,951
43F07C6.3F07C6.3n/achrIV 12,789,701contains similarity to Coxiella burnetii Hypothetical protein.; TR:Q83D43
44F18A11.5F18A11.5n/achrII 13,010,794contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
45sra-1AH6.4n/achrII 9,520,857sra-1 encodes a predicted seven transmembrane receptor; expressed in the male SPD and SPV neurons.
46F08F3.1F08F3.1n/achrV 5,447,387
47H28G03.3H28G03.3n/achrX 5,221,191
48nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
49F56C3.9F56C3.9n/achrX 1,392,907contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
50T20D4.5T20D4.5n/achrV 3,414,578contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)