UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1H39E20.1H39E20.12e-24chrX 1,396,448
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3T10B10.3T10B10.3n/achrX 15,179,981contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR004012 (RUN)
4nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
5F59E11.6F59E11.6n/achrV 8,992,414contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
6R13D11.1R13D11.1n/achrV 818,109
7R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
8F56F10.4F56F10.4n/achrX 867,910contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein)
9R07C3.3R07C3.3n/achrII 939,772contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
10twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
11F59A7.8F59A7.8n/achrV 2,010,108contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
12R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
13fbxa-167C31C9.3n/achrII 13,642,551This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
14T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
15R11D1.7R11D1.7n/achrV 12,721,371contains similarity to Mycoplasma capricolum Hypothetical 37.9 kDa protein in ptsH 3'region (ORF1).; SW:YPH1_MYCCA
16C14C6.7C14C6.7n/achrV 549,678contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
17K02E7.10K02E7.10n/achrII 1,066,288contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
18srz-12K08G2.7n/achrV 15,862,049C. elegans SRZ-12 protein ;
19ZK899.3ZK899.3n/achrX 9,454,242contains similarity to Homo sapiens C10ORF6; ENSEMBL:ENSP00000238961
20F17H10.4F17H10.4n/achrX 13,126,169contains similarity to Macaca fascicularis Cytochrome oxidase subunit VIII.; TR:Q8SPI5
21C02F12.8C02F12.8n/achrX 3,691,690contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
22R03G8.3R03G8.3n/achrX 13,092,699contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
23F16B4.3F16B4.3n/achrV 1,597,417contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
24C30B5.6C30B5.6n/achrII 6,220,573
25ugt-49AC3.2n/achrV 10,373,259C. elegans UGT-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
26F27D9.2F27D9.2n/achrX 7,674,579contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR000576 (Proton/sugar symporter, LacY), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27T07G12.2T07G12.2n/achrIV 10,531,796contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
28C18H9.1C18H9.1n/achrII 6,699,771
29ZC84.6ZC84.6n/achrIII 9,196,038contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
30srx-64K07C6.7n/achrV 3,930,085C. elegans SRX-64 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31C12D5.10C12D5.10n/achrV 7,692,770contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
32fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33F15E11.4F15E11.4n/achrV 2,340,462contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
34K07E8.10K07E8.10n/achrII 666,102
35srj-49T03D3.12n/achrV 2,847,294C. elegans SRJ-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srt-9C50H11.5n/achrV 3,078,685C. elegans SRT-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37T11F9.8T11F9.8n/achrV 11,477,624contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
38sri-18Y22F5A.2n/achrV 10,259,578C. elegans SRI-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39ZK1320.9ZK1320.9n/achrII 9,685,397contains similarity to Pfam domain PF02550 Acetyl-CoA hydrolase/transferase N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
40C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
41F36G9.12F36G9.12n/achrV 15,980,154contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR001356 (Homeobox), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
42srj-57T03D3.14n/achrV 2,854,982C. elegans SRJ-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43apt-9W04G3.4n/achrX 11,070,152apt-9 gene encodes an ortholog of GGA (Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology, ARF-binding protein), which contains a domain paralogous to the gamma-adaptin subunits of adaptor protein complexes; based on structural similarity, APT-9 may beinvolved in the formation of intracellular transport vesicles.
44glb-8C26C6.7n/achrI 7,510,602glb-8 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays; glb-8 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background; glb-8 expression is downregulated in a daf-2(e1370) mutant background under normoxic conditions; glb-8 expression is lower in L3 larvae than in young adults or dauers.
45C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
46ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
47srt-22ZK1037.3n/achrV 15,315,273C. elegans SRT-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
49F09B12.5F09B12.5n/achrX 15,086,421contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
50C42C1.6C42C1.6n/achrIV 12,294,581contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG16970-PA; FLYBASE:CG16970-PA