UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1H25K10.2H25K10.27e-41chrIV 16,210,717contains similarity to Halobacterium sp ORF H0114.; TR:O51964
2R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
3R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5K11G9.5K11G9.5n/achrV 6,687,134contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6bbs-5R01H10.6n/achrIII 10,260,159C. elegans BBS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07289 Protein of unknown function (DUF1448) contains similarity to Interpro domains IPR006606 (Protein of unknown function DUF1448), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014003 (Protein of unknown function DM16)
7C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
8D1046.5D1046.5n/achrIV 8,960,986contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Integral membrane protein GPR175; ENSEMBL:ENSP00000347748
9M01B2.6M01B2.6n/achrV 15,242,739contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
10ZK1010.6ZK1010.6n/achrIII 12,989,808contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
11R01B10.3R01B10.3n/achrV 6,044,828
12nekl-2ZC581.1n/achrI 6,664,152nekl-2 encodes a putative serine/threonine protein kinase orthologous to Aspergillus nidulans nimA and human NEK8 (OMIM:609799), and paralogous to C. elegans D1044.3, D1044.8, F19H6.1, and Y39G10AR.3; nekl-2 interacts with two or more components of the EGF/RAS signalling pathway, and is required for such signalling in vulval development.
13Y37D8A.6Y37D8A.6n/achrIII 12,857,304contains similarity to Interpro domains IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
14T07C12.10T07C12.10n/achrV 9,960,139contains similarity to Rattus norvegicus Trans-Golgi network integral membrane protein TGN38 precursor.; SW:TGN3_RAT
15srh-182ZK228.5n/achrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F47H4.2F47H4.2n/achrV 17,356,736This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
17nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18C44F1.1C44F1.1n/achrIII 3,761,814contains similarity to Interpro domain IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding)
19srbc-6C36C5.3n/achrV 3,170,772C. elegans SRBC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20nhr-186F47C10.3n/achrV 3,853,607C. elegans NHR-186 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21srx-67K07C6.10n/achrV 3,917,627C. elegans SRX-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22Y11D7A.10Y11D7A.10n/achrIV 9,259,330contains similarity to Coniophora arida ATP synthase subunit 6 (EC 3.6.3.14) (ATP synthase A chain)s(Fragment).; TR:Q9XLN6
23F28G4.3F28G4.3n/achrV 16,286,908contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
24F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
25Y44A6D.3Y44A6D.3n/achrV 20,786,983contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
26C07A4.2C07A4.2n/achrX 10,173,174contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
27Y41C4A.13Y41C4A.13n/achrIII 11,735,378contains similarity to Homo sapiens Rabconnectin; ENSEMBL:ENSP00000251076
28C54E10.2C54E10.2n/achrV 18,829,031contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
29clec-43R07C3.1n/achrII 945,103C. elegans CLEC-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
30nhr-206R07B7.13n/achrV 12,092,930C. elegans NHR-206 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31puf-9W06B11.2n/achrX 5,843,741The puf-9 gene encodes a predicted RNA binding protein orthologous to Drosophila PUMILIO and human PUMILIO 2 (OMIM:607205); PUF-9 is required for normal locomotion and fluid balance, and is expressed primarily in somatic tissues; PUF-9 contains a glutamine/asparagine-rich domain.
32C30E1.6C30E1.6n/achrX 16,916,238
33twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
34F57C7.4F57C7.4n/achrX 10,585,230contains similarity to Interpro domain IPR008972 ()
35ZK218.7ZK218.7n/achrV 17,106,188contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR000480 (Glutelin), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
36egl-38C04G2.7n/achrIV 10,108,695The egl-38 gene encodes a Pax5 homolog.
37C48E7.6C48E7.6n/achrI 6,244,688contains similarity to Drosophila pseudoobscura GA10211-PA (Fragment).; TR:Q29MP8
38nhr-191F55D12.3n/achrI 7,896,919C. elegans NHR-191 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39T11B7.2T11B7.2n/achrIV 8,844,038contains similarity to Homo sapiens remodeling and spacing factor 1; ENSEMBL:ENSP00000311513
40T10B10.5T10B10.5n/achrX 15,197,450contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
41str-232T10C6.1n/achrV 16,015,103C. elegans STR-232 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42C03A7.12C03A7.12n/achrV 5,179,902contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43srx-20R13H7.1n/achrIV 6,868,598C. elegans SRX-20 protein ;
44nhr-246ZK1037.4n/achrV 15,317,437C. elegans NHR-246 protein; contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
45srj-49T03D3.12n/achrV 2,847,294C. elegans SRJ-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46C46E1.1C46E1.1n/achrX 15,469,830contains similarity to Staphylococcus aureus Surface protein SasB (Fragment).; TR:Q84GB4
47F21D12.5F21D12.5n/achrII 7,329,535contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
48C49F8.1C49F8.1n/achrX 13,363,169contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Actin-binding protein of the cortical actin cytoskeleton, important for activation of the Arp2/3 complex that plays a key role actin in cytoskeleton organization; SGD:YCR088W
49srx-43T10C6.3n/achrV 16,018,889C. elegans SRX-43 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
50lite-1C14F11.3n/achrX 6,228,375C. elegans LITE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF08395 7tm Chemosensory receptor contains similarity to Interpro domains IPR009318 (Trehalose receptor), IPR013604 (7TM chemoreceptor)