UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1gnrr-5H22D07.10chrV 4,452,877C. elegans GNRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2T28A11.13T28A11.13n/achrV 3,249,973contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006662 (Thioredoxin-related)
3Y37H9A.2Y37H9A.2n/achrI 13,780,578contains similarity to Candida albicans Hyphally regulated protein precursor.; SW:HYR1_CANAL
4W02B8.3W02B8.3n/achrII 13,917,920contains similarity to Pfam domain PF04870 Protein of unknown function, DUF644 contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
5srab-9C36C5.6n/achrV 3,140,609C. elegans SRAB-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
6F22H10.2F22H10.2n/achrX 16,679,072contains similarity to Interpro domain IPR002395 (HMW kininogen)
7F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
8gcy-18ZK896.8n/achrIV 12,863,005gcy-18 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-18 functions redundantly with gcy-8 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, microarray experiments indicate that gcy-18 expression is induced in daf-16(RNAi); daf-2(RNAi) double mutants and repressed in daf-2(RNAi) mutants, suggesting that GCY-18 activity may contribute to a shortened lifespan; consistent with this, loss of gcy-18 activity via RNAi does result in lifespan extension; GCY-18 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
9F42A8.1F42A8.1n/achrII 9,343,914contains similarity to Yersinia pestis ORF4.; TR:Q9RPN3
10C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
11K03A11.5K03A11.5n/achrX 13,066,078contains similarity to Enterobacteria phage RB49 Hypothetical protein.; TR:Q7Y3J5
12Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13H35B03.1H35B03.1n/achrIV 5,727,641
14F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
15K11H12.4K11H12.4n/achrIV 674,988contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
16F25D7.5F25D7.5n/achrI 10,425,982contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
17F46G10.2F46G10.2n/achrX 13,325,413contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
18C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
19F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
20srx-110C46E10.6n/achrII 3,710,247C. elegans SRX-110 protein ;
21bath-47T07H3.1n/achrII 1,603,204C. elegans BATH-47 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (2), PF00917 (MATH domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
22nca-2C27F2.2n/achrIII 4,972,657nca-2 encodes a novel, four-domain alpha1U Ca2+ channel subunit; nca-2 functions redundantly with a paralog, nca-1, to regulate locomotion and the response to specific volatile anesthetics; in regulating these processes, nca-1 and nca-2 function in the same pathway as unc-79, which encodes a conserved novel protein that positively regulates levels of NCA-1 and NCA-2 protein; nca-2::gfp reporters are expressed in the nervous system in a few pharyngeal neurons, many nerve ring interneurons, most ventral nerve motor cord neurons, and in neurons and muscles in the tail; diffuse expression is also seen in vulval muscles and the intestine.
23C56E6.6C56E6.6n/achrII 6,542,233contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
24C18H7.6C18H7.6n/achrIV 590,772contains similarity to Interpro domain IPR000817 (Prion protein)
25srd-70F48F5.4n/achrV 20,450,660C. elegans SRD-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
274R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
28T13A10.2T13A10.2n/achrIV 6,253,526contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
29M03D4.6M03D4.6n/achrIV 6,144,282contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
30btb-15C08E3.2n/achrII 1,611,924C. elegans BTB-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
31F02E11.2F02E11.2n/achrII 3,267,119
32C06G3.4C06G3.4n/achrIV 7,029,714contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
33Y51A2D.1Y51A2D.1n/achrV 18,510,717contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
35sfxn-1.1AH6.2n/achrII 9,518,171C. elegans SFXN-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
36F15G9.3F15G9.3n/achrX 9,710,815contains similarity to Plasmodium falciparum Prolyl-t-RNA synthase, putative (EC 6.1.1.15).; TR:Q8I2Q5
37R03G5.6R03G5.6n/achrX 7,808,111
38M01A8.1M01A8.1n/achrIII 9,259,292contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0544; ENSEMBL:ENSP00000262370
39F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
40F11A5.4F11A5.4n/achrV 16,195,957contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
41R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920
42T27E7.4T27E7.4n/achrIV 14,534,258contains similarity to Pelomedusa subrufa NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (EC 1.6.5.3).; SW:NU5M_PELSU
43F55A4.7F55A4.7n/achrX 1,037,733contains similarity to Pfam domain PF00402 Calponin family repeat contains similarity to Interpro domain IPR000557 (Calponin repeat)
44C16D6.1C16D6.1n/achrX 12,525,704contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
45srab-21T20D4.18n/achrV 3,423,693C. elegans SRAB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
46F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
47Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
48T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W
49str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65