UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1H10E21.2H10E21.20chrIII 10,398contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3K05F6.4K05F6.4n/achrII 1,544,461This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
4fbxb-47F58E1.14n/achrII 1,702,944This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
5T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
6F54E7.6F54E7.6n/achrIII 5,660,439
7M199.2M199.2n/achrIV 15,109,806contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
8Y41E3.3Y41E3.3n/achrIV 14,988,934contains similarity to Pfam domain PF02263 Guanylate-binding protein, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR015894 (Guanylate-binding protein, N-terminal), IPR015900 (Guanylate-binding protein-like, C-terminal)
9K02G10.1K02G10.1n/achrX 4,708,472contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type)
10F55F8.9F55F8.9n/achrI 5,671,663contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
11K09D9.12K09D9.12n/achrV 4,003,740
12C46F11.4C46F11.4n/achrIII 3,661,086contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014014 (RNA helicase, DEAD-box type, Q motif), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
13ZK470.4ZK470.4n/achrX 4,139,617
14str-82B0213.8n/achrV 3,975,447C. elegans STR-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15Y51A2A.5Y51A2A.5n/achrV 18,299,724contains similarity to Saccharomyces cerevisiae transcription factor tau (TFIIIC) subunit 95; SGD:YBR123C
16C43H6.4C43H6.4n/achrX 2,405,689
17Y54E2A.6Y54E2A.6n/achrII 14,768,030contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) (2), PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) (2), PF02889 (Sec63 Brl domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR004179 (Sec63), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
18nhr-78F36A4.14n/achrIV 4,276,441C. elegans NHR-78 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
19grl-18T05C3.4n/achrV 5,487,265grl-18 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
20T21H3.5T21H3.5n/achrV 1,159,760
21sre-37F15A4.3n/achrII 12,466,610C. elegans SRE-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
22ing-3Y51H1A.4n/achrII 13,879,211Y51H1A.4 is orthologous to the human gene P33ING1B (ING1; OMIM:601566), which when mutated leads to disease.
23sdc-2C35C5.1n/achrX 11,528,006The sdc-2 gene encodes a protein that represses transcription of X chromosomes to achieve dosage compensation, and that also represses the male sex-determination gene her-1 to elicit hermaphrodite differentiation.
24clec-118W04H10.4n/achrII 610,423C. elegans CLEC-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25srbc-18C45H4.6n/achrV 2,169,987C. elegans SRBC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26Y52B11A.9Y52B11A.9n/achrI 11,036,452contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR005824 (KOW), IPR002358 (Ribosomal protein L6, conserved site-1), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
27K06H6.5K06H6.5n/achrV 577,400contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
28dpm-1Y66H1A.2n/achrIV 447,058dpm-1 encodes a putative catalytic subunit of dolichol phosphate mannosyltransferase, orthologous to budding yeast and human DPM1 (OMIM:603503, mutated in congenital disorder of glycosylation type Ie); in mass RNAi assays, DPM-1 is required for embryonic viability and proper cortical motion in the early embryo.
29hlh-3T24B8.6n/achrII 9,086,866hlh-3 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor homologous to Drosophila Achaete-scute; in vitro, HLH-3 can heterodimerize, and bind an E-box-containing probe, with HLH-2, the C. elegans E/daughterless ortholog with which it is coexpressed in the nuclei of embryonic neuronal precursors.
30rpb-4F43E2.2n/achrII 7,374,771C. elegans RPB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03874 RNA polymerase Rpb4 contains similarity to Interpro domains IPR010997 (HRDC-like), IPR005574 (RNA polymerase II, Rpb4), IPR006590 (RNA polymerase II, Rpb4, core)
31C26E1.1C26E1.1n/achrV 13,297,767contains similarity to Rattus norvegicus GLUT4 vesicle protein.; TR:Q9Z1X1
32R02F11.4R02F11.4n/achrV 4,814,781contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR008378 (Ubiquitous surface protein), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR009053 (Prefoldin)
33srgp-1F12F6.5n/achrIV 11,574,575C. elegans SRGP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00620 (RhoGAP domain) , PF00611 (Fes/CIP4 homology domain) contains similarity to Interpro domains IPR001060 (Cdc15/Fes/CIP4), IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
34srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35ceh-5C16C2.1n/achrI 9,727,604ceh-5 encodes a homeodomain protein, similar to the human VENTRAL ANTERIOR HOMEO BOX 2 gene (VAX2; OMIM:604295); CEH-5 is dispensable for viability and gross morphology.
36ZK1055.3ZK1055.3n/achrV 6,590,794
37F53F8.1F53F8.1n/achrV 20,682,534The F53F8.1 gene encodes a homolog of human WT1, which when mutated leads to Wilms tumour (OMIM:194070).
38fbxa-203W05F2.5n/achrI 3,372,801This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
39C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
40C17H11.5C17H11.5n/achrX 8,183,262
41F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42R10D12.7R10D12.7n/achrV 13,950,209contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
43F28C10.3F28C10.3n/achrX 533,819contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44F49C12.12F49C12.12n/achrIV 9,320,583contains similarity to Homo sapiens RNase K; VG:OTTHUMP00000182776
45ZC196.9ZC196.9n/achrV 8,724,688contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
46srxa-6W07A8.5n/achrV 20,730,954C. elegans SRXA-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
47E02H9.1E02H9.1n/achrIII 2,468,952
48C15A7.2C15A7.2n/achrX 12,072,281contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 145.; SW:Q5U239
49nhr-189F47C10.8n/achrV 3,859,413C. elegans NHR-189 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
50C15C8.6C15C8.6n/achrV 12,750,756contains similarity to Ancylostoma duodenale NADH dehydrogenase subunit 2 (Fragment).; TR:Q8SKS9