UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1H09F14.1H09F14.10chrV 10,614,197contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
3T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
4Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
5F46F5.16F46F5.16n/achrII 787,659
6ZC196.3ZC196.3n/achrV 8,737,532contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
7K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
8M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
9C17A2.4C17A2.4n/achrII 3,840,560contains similarity to Cebus apella Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1 (EC 2.4.1.69) (GDP-L-sfucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1)s(Alpha(1,2)FT 1) (Fucosyltransferase 1).; SW:Q866E8
10R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
11ZK353.4ZK353.4n/achrIII 8,388,992contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized serine/threonine-rich protein PB15E9.01c precursor.; SW:Q8TFG9
12F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
13K09D9.11K09D9.11n/achrV 3,999,279contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
14C50A2.3C50A2.3n/achrIV 1,148,209
15F57H12.4F57H12.40.0002chrIV 7,971,993contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001920 (Asp/Glu racemase), IPR009126 (Cholecystokinin receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16F40E3.5F40E3.5n/achrI 2,646,674contains similarity to Interpro domain IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
17Y42A5A.1Y42A5A.1n/achrV 11,093,039contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
18ubc-22C06E2.7n/achrX 8,868,414ubc-22 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme orthologous to Saccharomyces cerevisiae UBC8 and human UBC1/HIP2 (Huntingtin interacting protein 2, OMIM:602846) which are involved in regulating fructose-1,6-bisphosphatase and huntingtin catabolism, respectively; by homology, UBC-22 is likely required for covalent attachment of ubiquitin to select target proteins to facilitate their degradation; however, as loss of UBC-22 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UBC-22 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
19srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20C18H7.9C18H7.9n/achrIV 603,317contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
21F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
22W03F11.4W03F11.4n/achrI 2,238,497contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
23Y49F6C.6Y49F6C.6n/achrII 3,364,648contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
24Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
25cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
26T27F2.4T27F2.4n/achrV 11,650,405contains similarity to Interpro domain IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
27F42C5.3F42C5.3n/achrIV 7,286,758contains similarity to Homo sapiens Intersectin 1 short form transcript variant 8; ENSEMBL:ENSP00000370685
28T08G5.2T08G5.2n/achrV 14,025,155contains similarity to Homo sapiens Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1; ENSEMBL:ENSP00000312021
29Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
30B0546.3B0546.3n/achrIV 3,380,351contains similarity to Pfam domain PF03226 Yippee putative zinc-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004910 (Yippee-like protein)
31F07E5.8F07E5.8n/achrII 2,074,096contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
32B0261.5B0261.5n/achrI 5,250,115
33F15E11.11F15E11.11n/achrV 2,332,801contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
34C54D10.3C54D10.3n/achrV 12,418,939contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
35F53B1.3F53B1.3n/achrX 2,106,394
36srd-23Y40H7A.5n/achrIV 15,181,398C. elegans SRD-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37ZC412.1ZC412.10.0002chrV 14,855,683contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38ugt-36F09G2.6n/achrV 7,168,088C. elegans UGT-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR008081 (Cytoplasmic FMR1-interacting), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
39T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
40F23D12.3F23D12.3n/achrX 14,442,916
41srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
42C30B5.7C30B5.7n/achrII 6,225,999contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
43C32B5.11C32B5.11n/achrII 949,051
44nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
45C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
46gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
47F54B8.4F54B8.4n/achrV 15,816,808The F54B8.4 gene encodes a homolog of Death Associated Protein 1 (DAP-1) protein that may be involved in apoptosis.
48C15B12.4C15B12.4n/achrX 6,472,014contains similarity to Interpro domain IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal)
49C17B7.2C17B7.2n/achrV 3,349,796contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
50nhr-77T15D6.6n/achrI 12,384,994C. elegans NHR-77 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)