UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nspb-6H04M03.23e-21chrIV 5,895,659C. elegans NSPB-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
2F56C11.3F56C11.3n/achrI 182,455contains similarity to Pfam domain PF04777 Erv1 / Alr family contains similarity to Interpro domain IPR006863 (Erv1/Alr)
3C03B8.2C03B8.2n/achrIII 7,716,234
4C35D10.5C35D10.5n/achrIII 4,862,879contains similarity to Pfam domain PF03981 Ubiquinol-cytochrome C chaperone contains similarity to Interpro domain IPR007129 (Ubiquinol-cytochrome C chaperone)
5ugt-14H23N18.2n/achrV 4,907,256C. elegans UGT-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
6san-1ZC328.4n/achrI 6,408,365san-1 encodes the C. elegans ortholog of the Saccharomyces cerevisiae spindle checkpoint protein Mad3p; san-1 is essential for the mitotic spindle checkpoint activity in response to stimuli such as microtubule depolymerization or anoxia, in which microscopically visible movement ceases and cell cycle progression reversibly arrests; san-1 has also been reported to be essential for normal embryonic development; SAN-1 localizes to the nucleus during prophase and, during metaphase, colocalizes with HCP-3 to the kinetochore, consistent with a role as a spindle checkpoint component.
7K10C8.1K10C8.1n/achrV 12,693,876contains similarity to Pfam domain PF04857 CAF1 family ribonuclease contains similarity to Interpro domains IPR006941 (Ribonuclease CAF1), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
8C25D7.10C25D7.10n/achrV 15,067,993contains similarity to Mus musculus Probable taste receptor type 2 member 23 (T2R23) (STC9-2).; SW:T2R2_MOUSE
9his-60F55G1.11n/achrIV 7,487,766his-60 encodes an H4 histone; by homology, HIS-60 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-60 expression is detected in early embryos, beginning at the 28-cell stage and continuing through the comma stage (early morphogenesis); his-60 is a replication-dependent histone locus that resides in a histone gene-rich region on chromosome IV.
10R05F9.11R05F9.11n/achrII 4,913,028
11Y106G6H.8Y106G6H.8n/achrI 10,452,513contains similarity to Pfam domain PF04241 Protein of unknown function (DUF423) contains similarity to Interpro domain IPR006696 (Protein of unknown function DUF423)
12B0391.10B0391.10n/achrV 15,589,316contains similarity to Mus musculus Serine/threonine protein phosphatase 2B catalytic subunit, gammasisoform (EC 3.1.3.16) (Calmodulin-dependent calcineurin A subunit,sgamma isoform) (Calcineurin, testis-specific catalytic subunit)s(CAM-PRP catalytic subunit).; SW:P2BC_MOUSE
13F45E4.11F45E4.11n/achrIV 7,652,864contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
14T12E12.2T12E12.2n/achrIV 5,546,641contains similarity to Pfam domain PF00385 'chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR016197 (Chromo domain-like)
15syn-16ZC155.7n/achrIII 5,208,372C. elegans SYN-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF00804 (Syntaxin) , PF05739 (SNARE domain) contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR006011 (Syntaxin, N-terminal), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
16F31E3.4F31E3.4n/achrIII 6,965,804contains similarity to Pfam domain PF00929 Exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR013520 (Exonuclease, RNase T and DNA polymerase III), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR006055 (Exonuclease), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
17hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
18M01B2.8M01B2.8n/achrV 15,260,488contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
19elo-3D2024.3n/achrIV 7,238,796The elo-3 gene encodes a paralog of elo-1 and elo-2, each of which encodes a polyunsaturated fatty acid (PUFA) elongase; ELO-3 may be required for normally rapid growth.
20W04B5.1W04B5.1n/achrIII 2,428,781
21C06A1.6C06A1.6n/achrII 10,564,347contains similarity to Interpro domains IPR000006 (Metallothionein, vertebrate), IPR004035 (Endonuclease III, iron-sulphur binding, conserved site-1), IPR001396 (Echinodermata metallothionein, family 4), IPR001008 (Mollusc metallothionein, family 2)
22Y49E10.18Y49E10.18n/achrIII 12,444,259contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
23fbxa-193F59A1.9n/achrV 17,654,348C. elegans FBXA-193 protein; contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domains IPR001000 (Glycoside hydrolase, family 10), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
24F22F7.4F22F7.4n/achrV 2,104,867contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
25bath-21F59H6.8n/achrII 2,026,127C. elegans BATH-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
266R55.26R55.2n/achrX 17,713,765
27bath-35W02A11.8n/achrI 12,758,985C. elegans BATH-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
28cua-1Y76A2A.2n/achrIII 13,447,397The cua-1 gene encodes a putative E1-E2 ATPase orthologous to the human gene KIAA1347 (ATP7A; OMIM:604384), which when mutated leads to Hailey-Hailey disease.
29D2096.1D2096.1n/achrIV 8,397,532contains similarity to Pfam domain PF02466 Tim17/Tim22/Tim23 family contains similarity to Interpro domain IPR003397 (Mitochondrial import inner membrane translocase, subunit Tim17/22)
30K09E3.2K09E3.2n/achrX 17,117,739
31T08A11.1T08A11.1n/achrIII 4,255,571contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000591 (Pleckstrin/ G-protein, interacting region)
32C24G6.3C24G6.3n/achrV 5,517,383contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
33F43G9.10F43G9.10n/achrI 8,639,367contains similarity to Pfam domain PF06991 Micro-fibrillar-associated protein 1 C-terminus contains similarity to Interpro domains IPR009730 (Micro-fibrillar-associated 1, C-terminal), IPR000533 (Tropomyosin)
34CD4.8CD4.8n/achrV 5,600,286contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
35pink-1EEED8.9n/achrII 5,394,469pink-1 encodes a predicted serine/threonine protein kinase that is most similar to the Drosophila and human PINK1 (PTEN-induced kinase) protein kinases, the latter of which has been implicated in familial forms of Parkinson's disease; although loss of C. elegans pink-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, studies in Drosophila indicate that Drosophila PINK1 is a mitochondrial protein that genetically interacts with Drosophila parkin and is essential for maintaining mitochondrial function and integrity in several tissues, including flight muscles and dopaminergic neurons.
36C49C3.7C49C3.7n/achrIV 17,333,023contains similarity to Homo sapiens Isoform Short of CAP-Gly domain-containing linker protein 1; ENSEMBL:ENSP00000355314
37duo-3Y106G6H.12n/achrI 10,467,681C. elegans DUO-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
38smp-2D1037.2n/achrI 3,669,414C. elegans SMP-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01403 Sema domain contains similarity to Interpro domains IPR001627 (Semaphorin/CD100 antigen), IPR003659 (Plexin/semaphorin/integrin), IPR016201 (Plexin-like fold), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
39M18.3M18.3n/achrIV 12,107,094contains similarity to Pfam domain PF00733 Asparagine synthase contains similarity to Interpro domains IPR001962 (Asparagine synthase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold)
40C25H3.3C25H3.3n/achrII 5,694,437contains similarity to Pfam domain PF03061 Thioesterase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006683 (Thioesterase superfamily), IPR003736 (Phenylacetic acid degradation-related protein)
41K02E7.2K02E7.2n/achrII 1,080,452
42B0019.2B0019.2n/achrI 12,777,941contains similarity to Pfam domains PF04435 (Domain of unknown function (DUF545)) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
43F25H5.5F25H5.5n/achrI 9,161,573F25H5.5 encodes the C. elegans homologue of Claspin, an S-phase checkpoint component that interacts with Chk1 and negatively regulates cell cycle progression; in wild-type animals, loss of F25H5.5 activity results in some embryonic lethality; loss of F25H5.5 activity in a lin-35 mutant background, however, results in sterility, as well as smaller than normal body size, uncoordinated locomotion, and a protruding vulva; weaker F25H5.5 RNAi phenotypes are seen in lin-15B and eri-1; lin-15B backgrounds.
44srw-32K03D7.11n/achrV 17,509,470C. elegans SRW-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
45F56D2.2F56D2.2n/achrIII 5,588,134contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF01485 (IBR domain) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
46F52B5.3F52B5.3n/achrI 8,321,160The F52B5.3 gene encodes a DEAH helicase orthologous to the Drosophila SpindleE protein.
47K12D12.5K12D12.5n/achrII 11,862,086contains similarity to Interpro domains IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
48W05G11.2W05G11.2n/achrIII 58,191contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal)
49C56G3.2C56G3.2n/achrX 7,365,880contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
50dnj-21T19B4.4n/achrI 5,677,239This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.