UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F59A3.4F59A3.40chrI 5,508,149contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
2F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
3R11.1R11.1n/achrX 16,192,348contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
4str-230T16A9.2n/achrV 14,209,976C. elegans STR-230 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5hsr-9T05F1.6n/achrI 9,628,707hsr-9 encodes a protein containing a BRCT (BRCA 1 C terminus) domain that is found in proteins that regulate the cell cycle checkpoint in response to DNA damage; HSR-9 activity is required for a normal response to DNA damage caused by gamma-irradiation; loss of HSR-9 function via RNA-mediated interference after gamma-irradiation results in defects in mitotic cell cycle arrest, reduction of apoptosis of pachytene nuclei, and radiation sensitivity of progeny; the expression pattern and subcellular localization of HSR-9 are not yet known.
6efl-1Y102A5C.18n/achrV 16,962,099efl-1 encodes a homolog of mammalian E2F that is required for embryonic asymmetry and that functions as a transcriptional repressor; during vulval development, efl-1, a class B synMuv gene, acts with class B synMuv genes dpl-1 and lin-35/Rb to antagonize receptor tyrosine kinase and Ras-mediated signaling; EFL-1 also negatively regulates the G1 to S phase cell cycle transition.
7F56A6.4F56A6.4n/achrI 622,086
8T24B8.2T24B8.2n/achrII 9,055,661contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
9his-65H02I12.7n/achrIV 11,401,254his-65 encodes an H2A histone.
10skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
11C14H10.1C14H10.1n/achrX 10,235,306contains similarity to Pfam domain PF02535 ZIP Zinc transporter contains similarity to Interpro domain IPR003689 (Zinc/iron permease)
12wve-1R06C1.3n/achrI 11,927,136wve-1 encodes a homolog of the mammalian WAVE protein; based on homology WVE-1 might be involved in actin cytoskeletal dynamics; wve-1 is required for early cell migrations in the epidermis during embryonic morphogenesis and may require gex-2 and gex-3 for its function.
13F44A6.4F44A6.4n/achrX 10,214,952contains similarity to Salmonella typhi Anaerobic sulfite reductase subunit A (EC 1.8.2.-).; TR:Q8Z4M7
14F27C8.2F27C8.2n/achrIV 9,597,886contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
15ced-6F56D2.7n/achrIII 5,596,872ced-6 encodes an Src homology (SH) 3 and phosphotyrosine-binding (PTB) domain-containing adaptor protein, orthologous to human CED-6/GULP, that is required for cell corpse engulfment during apoptosis; CED-6 is bound by the phosphotyrosine binding motif in the cytoplasmic tail of the transmembrane protein CED-1, and and within phagocytic cells this interaction may be part of a signal transduction pathway that promotes apoptotic cell engulfment.
16vps-37CD4.4n/achrV 5,593,134C. elegans VPS-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF07200 Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein contains similarity to Interpro domain IPR009851 (Modifier of rudimentary, Modr)
17M05B5.4M05B5.4n/achrI 7,189,526The M05B5.4 gene encodes an ortholog of the human gene LECITHIN-CHOLESTEROL ACYLTRANSFERASE (LCAT; OMIM:606967), which when mutated leads to lecithin-cholesterol acyltransferase deficiency (OMIM:245900).
18F41C3.4F41C3.4n/achrII 4,740,995contains similarity to Pfam domain PF04178 Got1-like family contains similarity to Interpro domain IPR007305 (Got1-like protein)
19set-16T12D8.1n/achrIII 13,650,157C. elegans SET-16 protein ;
20AH9.3AH9.3n/achrX 2,259,841contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
21pph-6C34C12.3n/achrIII 3,464,667C. elegans PPH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
22C43E11.11C43E11.11n/achrI 4,251,319contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Conserved oligomeric Golgi complex component 5; ENSEMBL:ENSP00000334703
23srj-4C27A7.7n/achrV 12,163,847C. elegans SRJ-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24R01H10.4R01H10.4n/achrIII 10,255,933contains similarity to Sus scrofa Outer dense fiber protein.; SW:ODFP_PIG
25C11H1.3C11H1.3n/achrX 14,309,889contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
26ZK507.6ZK507.6n/achrIII 9,107,905contains similarity to Pfam domains PF00134 (Cyclin, N-terminal domain) , PF02984 (Cyclin, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal), IPR004367 (Cyclin, C-terminal), IPR014400 (Cyclin, A/B/D/E)
27srx-53T27C5.2n/achrV 17,400,916C. elegans SRX-53 protein; contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
28F25B4.4F25B4.4n/achrV 5,685,274
29ZC196.4ZC196.4n/achrV 8,734,518contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR007883 (Protein of unknown function DUF713), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
30K09B11.10K09B11.10n/achrIV 13,439,731contains similarity to Interpro domain IPR000998 (MAM)
31duo-3Y106G6H.12n/achrI 10,467,681C. elegans DUO-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
32ugt-3ZC455.3n/achrV 12,799,239C. elegans UGT-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
33F32B4.1F32B4.1n/achrI 11,511,408contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
34F49F1.7F49F1.7n/achrIV 4,124,635contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
35R07G3.5R07G3.5n/achrII 7,598,098contains similarity to Pfam domain PF00300 Phosphoglycerate mutase family contains similarity to Interpro domain IPR013078 (Phosphoglycerate mutase)
36crml-1K07G5.1n/achrI 7,154,627C. elegans CRML-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003590 (Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype)
37R05D3.8R05D3.8n/achrIII 8,357,800contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
38dcr-1K12H4.8n/achrIII 8,076,021The dcr-1 gene encodes a bidentate ribonuclease that is homologous to E. coli RNAse III; dcr-1 is required both for RNA interference and for synthesis of small developmental RNAs; DCR-1 interacts in vivo with RDE-4, a double-stranded RNA (dsRNA) binding protein required for RNAi that interacts with trigger dsRNAs and may function to deliver dsRNAs to DCR-1 for endonucleolytic processing.
39F45C12.2F45C12.2n/achrII 1,732,740contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
40F08F1.9F08F1.9n/achrX 8,410,171contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal)
41Y44E3A.3Y44E3A.3n/achrI 3,318,281contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR015467 (Thioredoxin family), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
42exoc-7C43E11.8n/achrI 4,245,201C. elegans EXOC-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03081 Exo70 exocyst complex subunit contains similarity to Interpro domain IPR004140 (Exo70 exocyst complex subunit)
43fem-2T19C3.8n/achrIII 633,323A CB5161 ortholog of fem-2, Cbn-fem-2, has been isolated from the sibling Caenorhabditis species CB5161.
44T22B11.2T22B11.2n/achrIV 4,690,180contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
45T01B11.1T01B11.1n/achrIV 8,448,108contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
46T20F7.1T20F7.1n/achrX 16,875,523contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
47bag-1F57B10.11n/achrI 6,564,081A homolog of the human BAG-family of co-chaperone proteins, negatively regulates Hsp70 and affects cell stress and cell growth.
48F58G1.6F58G1.6n/achrII 12,941,277contains similarity to Pfam domain PF02752 Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal)
49C07A4.1C07A4.1n/achrX 10,169,900contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR003954 (RNA recognition, region 1), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
50M03F4.4M03F4.4n/achrX 4,957,667