UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxa-129F59A1.81.0000000000000001e-159chrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
2T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
3srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
44R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
5R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920
6tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
7rab-14K09A9.2n/achrX 15,605,871rab-14 encodes a member of the Rab GTPase family.
8ZC239.14ZC239.14n/achrII 3,221,697contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
9srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10F11D5.5F11D5.5n/achrX 3,302,988contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
11ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
12F33E2.6F33E2.6n/achrI 12,589,287contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
13T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
14str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
16C38C3.7C38C3.7n/achrV 1,502,860contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
17C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
18C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
19srz-103F14F8.4n/achrV 16,678,452C. elegans SRZ-103 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
20F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
21srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22clec-146Y48E1B.9n/achrII 13,592,126C. elegans CLEC-146 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23T26E4.3T26E4.3n/achrV 15,783,606contains similarity to Pfam domain PF01531 (Glycosyl transferase family 11)
24F45C12.9F45C12.9n/achrII 1,709,067contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
25php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
26srsx-14C39H7.5n/achrIV 5,625,990C. elegans SRSX-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27nhr-39F44A2.4n/achrV 9,303,947C. elegans NHR-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
28H04M03.11H04M03.11n/achrIV 5,883,356
29cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
30mif-3F13G3.9n/achrI 7,313,193C. elegans MIF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01187 Macrophage migration inhibitory factor (MIF) contains similarity to Interpro domains IPR014347 (Tautomerase), IPR001398 (Macrophage migration inhibitory factor)
31F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
32sng-1T08A9.3n/achrX 7,328,590sng-1 encodes the C. elegans synaptogyrin ortholog, a vertebrate integral membrane synaptic vesicle protein; loss-of-function mutations in sng-1 result in no obvious defects in synaptogenesis or neuronal activity, suggesting that SNG-1 is likely required for more subtle neuronal functions; SNG-1::GFP reporters are expressed throughout the nervous system in neurons in the dorsal and ventral nerve cords, as well as the anterior nerve ring; SNG-1 colocalizes with the synaptic vesicle component SNT-1.
33nhr-119K12H6.1n/achrII 2,799,024C. elegans NHR-119 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
34abt-3F55G11.9n/achrIV 12,953,691abt-3 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-3 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-3 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
35str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36F55A4.7F55A4.7n/achrX 1,037,733contains similarity to Pfam domain PF00402 Calponin family repeat contains similarity to Interpro domain IPR000557 (Calponin repeat)
37F56H6.6F56H6.6n/achrI 12,295,311contains similarity to Mus musculus N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferases(EC 2.4.1.149) (Poly-N-acetyllactosamine extension enzyme) (I-beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase) (iGnT) (UDP-GlcNAc:betaGal beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1).; SW:Q8BWP8
38C29F5.5C29F5.5n/achrII 6,297,911
39Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
40C28H8.8C28H8.8n/achrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
41F15H9.1F15H9.1n/achrI 12,157,921contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
42F18C5.4F18C5.4n/achrII 6,564,443contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
43C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
44str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F02E11.2F02E11.2n/achrII 3,267,119
46F32D1.3F32D1.3n/achrV 4,355,654contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (3), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
47Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
48sdz-23F58G4.4n/achrV 8,100,032sdz-23 encodes a putatively secreted protein with a single EGF domain, with some similarity to LAG-2; sdz-23 begins to be expressed in the E blastomere of 8-cell embryos, and continues to be expressed solely in the E lineage througout embryogenesis; sdz-23 requires SKN-1 and WRM-1 for E lineage expression, and is a putative MED-1/2 target gene; sdz-23 is both activated by POP-1 (with SYS-1 as coactivator, in the E lineage) and repressed by POP-1 (in the MS lineage), while the dependence of sdz-23 on WRM-1 for E lineage expression is alleviated by loss of POP-1, indicating that WRM-1 switches POP-1 from repression to activation in the E lineage; sdz-23 requires SYS-1 for normal embryonic expression; SDZ-23 has no obvious function in mass RNAi assays.
49F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
50C17C3.6C17C3.6n/achrII 5,550,261This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.