UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1kin-29F58H12.10chrX 2,848,198kin-29 encodes a serine/threonine kinase with significant homology in the kinase domain to the AMP-activated protein kinase (AMPK) and SNF1 kinases; the AMP-kinase cascade is activated by cellular stresses that deplete ATP; AMP-kinase is believed to protect the mammalian cell by 'switching off' ATP-consuming pathways like fatty acid synthesis, by phosphorylating key regulatory enzymes, and switching on alternative pathways for ATP generation; kin-29 is involved in regulating the expression of chemosensory receptors and entry into the daur pathway; kin-29 also affects body size via interaction with the Sma/Mab pathway and lifespan, with mutants exhibiting a smaller body size and increased life span; a functional KIN-29-GFP fusion protein is expressed in sensory neurons and many other cell types, and localizes to the cytoplasm; under conditions of cellular stress like heat shock and starvation, KIN-29-GFP translocates to the nucleus.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3srg-3C18F10.6n/achrIII 6,269,673C. elegans SRG-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
4K02H11.4K02H11.4n/achrV 1,529,803contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5ZK1055.4ZK1055.4n/achrV 6,586,468contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
6F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
7C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
8F54A5.2F54A5.2n/achrI 966,565contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
9F45D3.2F45D3.2n/achrV 12,541,972contains similarity to Dictyocaulus viviparus Putative uncharacterized protein.; TR:Q6E6T3
10lnp-1C05E11.1n/achrX 4,589,579lnp-1 encodes a highly conserved protein of unknown function, orthologous to human LUNAPARK/KIAA1715 (OMIM:610236), that is required for normally short body length, normal locomotion, fat content, acetylcholine neurotransmission, localization of RAB-3 and SNB-1, and sensitivity to aldicarb; LNP-1 is expressed in muscles, hypodermal cells, and neurons; within neurons, LNP-1 is localized to cell bodies, neuritic processes and commissures, and requiring UNC-104 for localization outside of cell bodies; LNP-1 is likely to act presynaptically; LNP-1 contains two N-terminal predicted transmembrane sequences, and an atypical zinc finger domain (C2HC2).
11F39D8.3F39D8.3n/achrX 15,423,577contains similarity to Homo sapiens Sperm-specific thioredoxin; ENSEMBL:ENSP00000304908
12dpy-19F22B7.10n/achrIII 8,663,628The dpy-19 gene encodes a novel transmembrane protein whose human homolog is expressed in brain, and that is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
13F17H10.4F17H10.4n/achrX 13,126,169contains similarity to Macaca fascicularis Cytochrome oxidase subunit VIII.; TR:Q8SPI5
14T07D10.2T07D10.2n/achrI 12,622,116T07D10.2 is orthologous to the human gene VASOPRESSIN RECEPTOR TYPE 2 (AVPR2; OMIM:304800), which when mutated leads to nephrogenic diabetes insipidus.
15T07G12.4T07G12.4n/achrIV 10,537,682contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
16fbxa-111Y102A5C.14n/achrV 16,949,135This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
17C09G1.2C09G1.2n/achrX 15,980,318contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Formin, nucleates the formation of linear actin filaments, involved in cell processes such as budding and mitotic spindle orientation which require the formation of polarized actin cables, functionally redundant with BNR1; SGD:YNL271C
18tag-293C03G6.13n/achrV 7,355,612C. elegans TAG-293 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
19F42G8.7F42G8.7n/achrIV 8,127,262contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain)
20C27B7.7C27B7.7n/achrIV 8,911,257contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) (6)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013151 (Immunoglobulin)
21F59F5.7F59F5.7n/achrX 10,563,070contains similarity to Interpro domain IPR006609 (Region of unknown function DM13, Skeletor)
22twk-25M04B2.5n/achrIV 11,507,989C. elegans TWK-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
23T27C4.2T27C4.2n/achrV 3,729,612
24ugt-24C49A9.8n/achrIV 6,208,144C. elegans UGT-24 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
25nhr-143F59E11.11n/achrV 8,974,032C. elegans NHR-143 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26pqn-15C24A8.3n/achrX 4,307,497The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
27C18H9.1C18H9.1n/achrII 6,699,771
28F54E2.4F54E2.4n/achrV 2,806,913contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR009134 (Vascular endothelial growth factor receptor, VEGFR, N-terminal), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
29cyp-33C5F41B5.3n/achrV 2,246,015C. elegans CYP-33C5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
30T10B5.2T10B5.2n/achrV 1,849,449
31ocam-1T02B5.2n/achrV 14,167,452T02B5.2 encodes a protein with an OCAM domain, a nematode-specific motif conserved between T02B5.2 and two other nematode ONECUT homeobox proteins (CEH-21 and CEH-41); this gene is probably derived from a ONECUT gene that lost both tit cut domain and its homeodomain; T02B5.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
32F30A10.6F30A10.6n/achrI 9,490,547contains similarity to Pfam domain PF02383 SacI homology domain contains similarity to Interpro domain IPR002013 (Synaptojanin, N-terminal)
33R06B9.4R06B9.4n/achrII 13,754,197contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
34T15B7.13T15B7.13n/achrV 6,827,999contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35srt-29C24B9.5n/achrV 2,718,264C. elegans SRT-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
36srw-134T05B4.7n/achrV 4,111,591C. elegans SRW-134 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
37ZK430.5ZK430.5n/achrII 4,411,199contains similarity to Pfam domain PF03568 Peptidase family C50 contains similarity to Interpro domain IPR005314 (Peptidase C50, separase)
38zag-1F28F9.1n/achrIV 3,858,673zag-1 encodes a homeodomain protein of the ZFH class which consists of a homeodomain flanked by two clusters of C2H2-type zinc fingers and is related to transcriptional repressors encoded by Drosophila zfh-1 and the vertebrate ZEB genes; ZAG-1 is required for locomotion, for neuronal differentiation, and for proper axonal branching and fasciculation; from late embryogenesis through adult stages of development, ZAG-1 is expressed dynamically in head and tail neurons and in the intestinal and anal depressor muscles.
39F09B12.5F09B12.5n/achrX 15,086,421contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
40mab-7ZC13.4n/achrX 895,155mab-7 encodes a protein with a hydrophobic type II transmembrane region at the N-terminus, an EGF-like motif, a ShKT motif and a long C-terminus; mab-7 is involved in morphogenesis of the male tail, specifically affecting the structural cells, neuronal processes and the hypodermal sheath of the sensory rays, as such, it affects mating in males; a mab-7 promoter-gfp construct is expressed in hypodermis, body seam, ray structural cells, and several neurons in the head and tail region.
41C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
42K09C4.2K09C4.2n/achrX 3,297,833
43F38E1.6F38E1.6n/achrV 8,360,585contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44F21D9.1F21D9.1n/achrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
45T10D4.1T10D4.1n/achrII 3,151,352contains similarity to Pfam domains PF01579 (Domain of unknown function DUF19) , PF02343 (Domain of unknown function DUF130) contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
46col-70H17B01.2n/achrII 1,471,156C. elegans COL-70 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
47H12I19.4H12I19.4n/achrIV 14,147,395contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
48F26F2.7F26F2.7n/achrV 20,581,046contains similarity to Pfam domain PF05346 Eukaryotic membrane protein family contains similarity to Interpro domain IPR008010 (Protein of unknown function DUF747, CMV receptor)
49C12D5.10C12D5.10n/achrV 7,692,770contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
50srh-186F36G9.2n/achrV 15,956,387C. elegans SRH-186 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)