UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1str-145F58G4.70chrV 8,097,583C. elegans STR-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
4F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
5F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
6M162.6M162.6n/achrV 19,782,521contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
7sri-15F15H9.2n/achrI 12,152,667C. elegans SRI-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
9nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
10srh-272F37B4.4n/achrV 2,864,166C. elegans SRH-272 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11math-10C16C4.15n/achrII 1,872,348C. elegans MATH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
12clec-39T25E12.7n/achrV 16,740,408C. elegans CLEC-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
14T27F6.8T27F6.8n/achrI 12,498,624This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
15F46E10.3F46E10.3n/achrV 6,519,002contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
16tag-4ZK337.4n/achrI 14,984,784tag-4 encodes a novel protein with low similarity to human putative splicing factor YT521
17str-238R09E12.42.9999999999999997e-20chrV 768,810C. elegans STR-238 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C24G7.1C24G7.1n/achrI 4,110,897contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
19srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20Y56A3A.18Y56A3A.18n/achrIII 11,918,159Y56A3A.18 encodes an ortholog of S. cerevisiae BUD20 that may suppress tumorous growth in the germline; like PRO-1, -2, and -3, Y56A3A.18 is thought to be required for ribosome biogenesis, suggesting a link between biogenesis in the distal sheath and control of cell division in the germline.
21nhr-276Y71A12C.1n/achrI 14,042,539C. elegans NHR-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
23C15H9.2C15H9.2n/achrX 6,119,566contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
24H25K10.4H25K10.4n/achrIV 16,226,802contains similarity to Pseudomonas putida Hypothetical protein.; TR:Q8VMP3
25T06E8.2T06E8.2n/achrV 10,036,032
26C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
27W04E12.3W04E12.3n/achrV 19,737,520contains similarity to Bacillus subtilis Nuclease sbcCD subunit C.; SW:SBCC_BACSU
28F59C12.3F59C12.3n/achrX 16,606,372contains similarity to Interpro domain IPR009114 (Angiomotin)
29R11A5.6R11A5.6n/achrI 7,867,741contains similarity to Rattus norvegicus Aa2-141.; TR:Q7TP81
30fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
31srx-76K12G11.5n/achrV 11,892,608C. elegans SRX-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32grl-20C23H5.9n/achrIV 2,127,497grl-20 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
33F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
34M70.5M70.5n/achrIV 2,270,286contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001258 (NHL repeat)
35W02H3.1W02H3.1n/achrX 11,104,112contains similarity to Bacillus halodurans Myo-inositol 2-dehydrogenase.; TR:Q9KAH1
36nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
37Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
38C04B4.6C04B4.6n/achrX 12,275,348contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative alanyl-tRNA synthetase.; TR:Q8FT23
39srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
42math-17C16C4.9n/achrII 1,880,205C. elegans MATH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
43F20D1.8F20D1.8n/achrX 14,996,828contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
44clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
45B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
46C40A11.7C40A11.7n/achrII 2,149,559contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
47T02G6.4T02G6.4n/achrI 11,811,897contains similarity to Buchnera aphidicola RpoD protein (EC 2.7.7.6).; TR:Q89AY7
48Y79H2A.2Y79H2A.2n/achrIII 12,029,742contains similarity to Interpro domain IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
49srj-8T28A11.93.9999999999999996e-26chrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)