UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1myo-5F58G4.10chrV 8,113,539C. elegans MYO-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF01576 (Myosin tail) , PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF02736 (Myosin N-terminal SH3-like domain) , PF00063 (Myosin head (motor domain)) contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR002957 (Keratin, type I), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin), IPR004009 (Myosin, N-terminal, SH3-like), IPR002928 (Myosin tail), IPR001609 (Myosin head, motor region)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3grl-4F42C5.7n/achrIV 7,310,282grl-4 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-4 is expressed in pharynx, reproductive system, vulva, larval neurons, and larval rectal epithelium; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
4spc-1K10B3.100.00004chrX 3,122,249spc-1 encodes the C. elegans alpha spectrin ortholog; during development, spc-1 activity is required for body morphogenesis, formation of body wall muscles, locomotion, and larval development.
5daf-5W01G7.1n/achrII 14,035,373daf-5 encodes a proline-rich protein, conserved in C. briggsae but not observed in non-nematode genomes, that promotes dauer formation in the group II branch of the dauer pathway, may regulate chemosensation via AWC neurons, and may regulate egg laying; daf-5 mutations suppress the dauer phenotype of group II Daf-c mutants; daf-5(e1385) partially suppresses dauer formation by aex-6(sa699) mutants at 26.8 degrees C.
6B0272.4B0272.4n/achrX 9,429,267contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
7gst-20Y48E1B.10n/achrII 13,608,893C. elegans GST-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
8Y75B8A.13Y75B8A.13n/achrIII 12,209,672contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
9R102.1R102.1n/achrIV 10,686,816contains similarity to Oryza sativa Similar to Arabidopsis thaliana chromosome 4.; TR:Q9LWR6
10K07E3.1K07E3.1n/achrX 8,112,540contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Dentin sialophosphoprotein, putative.; TR:A2DMT3
11lgc-25R03E1.3n/achrX 14,160,175C. elegans LGC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
12clec-68F56D6.1n/achrIV 3,927,681C. elegans CLEC-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13B0238.10B0238.10n/achrV 5,274,794contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
14myo-2T18D3.40chrX 12,471,624myo-2 encodes a muscle-type specific myosin heavy chain isoform; myo-2 is expressed in pharyngeal muscle.
15R05H10.1R05H10.1n/achrII 14,852,898contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
16K05B2.4K05B2.4n/achrX 4,919,986contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
17T21B6.3T21B6.3n/achrX 10,946,988The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
18F16G10.5F16G10.5n/achrII 2,368,093
19W09D10.5W09D10.5n/achrIII 10,709,857contains similarity to Mus musculus C1GALT1-specific chaperone 1 (Core 1 beta3-galactosyltransferase-sspecific molecular chaperone) (Beta1,3-galactosyltransferase 2)s(C1GalT2) (C1Gal-T2) (mC1Gal-T2).; SW:Q9JMG2
20ben-1C54C6.2n/achrIII 3,539,934A beta-tubulin that confers benzimidazole sensitivity.
21fbxb-36F07E5.6n/achrII 2,061,815C. elegans FBXB-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
22mec-12C44B11.3n/achrIII 3,135,388mec-12 encodes a novel C. elegans alpha-tubulin that is unique amongst C. elegans alpha tubulins in that it may be subject to post-translational acetylation; MEC-12 is required for normal mechanosensory response to gentle touch, and specifically for formation of the 15-protofilament microtubule bundle present in the touch receptor neurons; mec-12 interacts genetically with mec-5, which encodes a unique C. elegans collagen secreted by the hypodermis; MEC-12 is highly expressed in the touch neurons as well as in several other neurons that do not contains the microfilament bundle, such as the ventral cord motorneurons.
23abt-2F12B6.1n/achrI 2,264,395abt-2 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-2 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-2 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
24ZK930.6ZK930.6n/achrII 11,885,760contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
25ace-3Y48B6A.8n/achrII 14,207,809ace-3 encodes one of four C. elegans acetylcholinesterases (AChE); ACE-3 represents ~5% of the total AChE activity in C. elegans and in vitro, hydrolyzes acetylthio-, butyrylthio-, and propionylthiocholine substrates with equal efficiency; although loss-of-function mutations in ace-3 result in no obvious defects, animals doubly mutant with ace-1 or ace-2 have slight defects in backward locomotion and animals triply mutant for ace-1, -2, and -3 arrest as unhatched, yet fully developed, embryos; ace-3 is the downstream gene in an operon with a fourth AChE-encoding gene, ace-4, and transcriptional reporter fusions with ace-4 upstream sequences direct expression in pharyngeal muscles pm3, 4, 5, and 7, the two CAN (canal associated neuron) cells, midbody dorsal body wall muscles in larvae, and several neurons in the head and anal ganglion
26B0303.14B0303.14n/achrIII 8,714,993contains similarity to Homo sapiens 33 kDa protein; VG:OTTHUMP00000025234
27abt-4Y39D8C.1n/achrV 327,261abt-4 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-4 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-4 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; abt-4 promoter-gfp fusion proteins are widely expressed in larvae and adults, with expression seen in the pharynx, the pharyngeal-intestinal valve, the intestine, renal gland cells, hypodermis, various neurons, and unidentified cells in the head and tail.
28inx-13Y8G1A.2n/achrI 3,751,248inx-13 encodes an innexin, an integral transmembrane channel protein that is a structural component of invertebrate gap junctions; INX-13 is essential for larval development and osmoregulation, and may be a component of the gap junctions that link the excretory and hypodermal cells; INX-13 is expressed embryonically in hypodermis and post-embryonically, in hypodermal seam cells, the excretory cell, and the developing vulva and spermatheca; in hypodermal cells, INX-13 localizes to the plasma membrane at points of contact between adjacent cells.
29gsk-3Y18D10A.5n/achrI 12,821,999C. elegans GSK-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
30unc-68K11C4.5n/achrV 6,915,345unc-68 encodes a ryanodine receptor ortholog that is expressed in body-wall muscle cells and is required for normal body tension and locomotion; unc-68 mutants are flaccid, sluggish, and resistant to ryanodine, but have normal muscle ultrastructure; UNC-68 is dispensable for excitation-contraction coupling itself, but may amplify its calcium signals; the unc-68/kra-1(kh30) mutation is an S1444N substitution at a putative protein kinase C phosphorylation site; UNC-68 reduced unc-103(sy557)-induced spicule protraction by one half; unc-68 is orthologous to the human genes RYR1 (OMIM:180901, mutated in malignant hyperthermia and central core disease), RYR2 (OMIM:180902, mutated in stress-induced polymorphic ventricular tachycardia), and RYR3 (OMIM:180903).
31D1005.3D1005.3n/achrX 1,453,357contains similarity to Pfam domain PF07716 Basic region leucine zipper contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
32ZK112.3ZK112.3n/achrIII 7,726,943
33nhr-205R04B5.3n/achrV 10,080,904C. elegans NHR-205 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
34ZC247.1ZC247.1n/achrI 10,271,766contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG32377-PA;; FLYBASE:CG32377
35ugt-43F01D4.1n/achrIV 10,466,113C. elegans UGT-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
36arf-1.1F45E4.1n/achrIV 7,635,253arf-1.1 encodes a member of the ADP-ribosylation factor family.
37pqn-74W02A2.3n/achrIV 13,330,430pqn-74 encodes a protein with two chitin-binding peritrophin-A domains, separated by a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain; like CEJ-1 and CPG-2, PQN-74 might participate in eggshell synthesis and early embryonic development, and PQN-74's peritrophin-A domains might enable mechanical cross-linking of chitin.
38F27E5.3F27E5.3n/achrII 10,142,746contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Cell division cycle 2-related protein kinase 7; ENSEMBL:ENSP00000300647
39Y113G7B.14Y113G7B.14n/achrV 20,223,220contains similarity to Pfam domains PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal)
40clec-64F35C5.7n/achrII 12,899,255C. elegans CLEC-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
41gst-38F35E8.8n/achrV 15,915,638C. elegans GST-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
42F28B1.1F28B1.1n/achrV 17,043,156contains similarity to Mus musculus Hypothetical protein.; TR:Q8C3I4
43unc-41C27H6.1n/achrV 9,971,233unc-41 encodes an ortholog of Drosophila STONED A (STNA) required for normal locomotion; a beta-strand in the mu-adaptin-like domain of UNC-41 binds the C2A domain of SNT-1, and this binding is required for SNT-1 endocytosis, punctate localization of UNC-41 in neurons, and transgenic rescue of unc-41(e268) animals; UNC-41 is also required for normal secretion of EGL-17 from P6.p cells, and for embryonic viability; UNC-41 is expressed in the larval and adult nervous system; UNC-41, like other stonins, is an adaptin, and by orthology with stonins is predicted to be a protein adaptor that helps sort SNT-1 endocytotically.
44C01B4.8C01B4.8n/achrV 2,491,606contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
45F56D2.8F56D2.8n/achrIII 5,581,951
46H11E01.3H11E01.3n/achrX 1,612,018contains similarity to Staphylococcus saprophyticus subsp saprophyticus Uro-adherence factor A precursor.; SW:Q4A0V8
47math-41T08E11.4n/achrII 1,827,415C. elegans MATH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
48dnj-7C55B6.2n/achrX 7,196,372This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain that is predicted to be mitochondrial.
49F59A1.10F59A1.10n/achrV 17,661,006contains similarity to Pfam domain PF03982 Diacylglycerol acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007130 (Diacylglycerol acyltransferase)
50cyp-33C8R08F11.3n/achrV 3,802,105C. elegans CYP-33C8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)