UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F58F12.2F58F12.27e-61chrII 6,387,834
2T25B9.4T25B9.4n/achrIV 10,756,710contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
3ZK354.3ZK354.3n/achrIV 5,310,807contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
4D2024.1D2024.1n/achrIV 7,248,474contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
5C35D10.3C35D10.3n/achrIII 4,869,534
6K05F1.8K05F1.8n/achrII 5,799,460
7F26B1.1F26B1.1n/achrI 6,328,529contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
8ssp-32F32B6.7n/achrIV 9,895,754C. elegans SSP-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
9ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
10F52F12.5F52F12.5n/achrI 9,921,559contains similarity to Homo sapiens Triadin; ENSEMBL:ENSP00000329278
11T08H10.1T08H10.1n/achrV 4,484,972contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
12W09C3.8W09C3.8n/achrI 4,716,751
13C50E10.1C50E10.1n/achrII 12,301,690contains similarity to Gibberella zeae Hypothetical protein.; TR:Q4IR83
14C34D4.2C34D4.2n/achrIV 7,155,353contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
15F33D11.1F33D11.1n/achrI 5,852,462contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
16C01G6.2C01G6.2n/achrII 9,267,839contains similarity to Interpro domain IPR008065 (FMRFamide-related peptide 2)
17C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
18C34B2.4C34B2.4n/achrI 10,672,056contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
19F56A11.6F56A11.6n/achrIV 581,274contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000533 (Tropomyosin)
20K09C6.2K09C6.2n/achrV 857,653contains similarity to Yarrowia lipolytica Similar to sp|P32583 Saccharomyces cerevisiae YKR092c SRP40 Suppressorsprotein.; TR:Q6CEY9
21Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
22Y51A2B.6Y51A2B.6n/achrV 18,393,120contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
23F20B6.1F20B6.1n/achrX 4,200,926contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
24C32C4.3C32C4.3n/achrV 10,646,016contains similarity to Yersinia pestis Putative phage-related membrane protein.; TR:Q8ZEA4
25C35D10.8C35D10.8n/achrIII 4,855,662
26ttr-9C33A12.15n/achrIV 9,505,947C. elegans TTR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
27C27F2.6C27F2.6n/achrIII 4,980,070
28C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
29F42G4.6F42G4.6n/achrII 13,079,994F42G4.6 encodes a nematode-specific sperm protein; F42G4.6 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); F42G4.6(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; F42G4.6 expression is enriched in spermatogenesis.
30C05C12.1C05C12.1n/achrIV 11,254,815contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
31C34F11.5C34F11.5n/achrII 5,197,549contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
32clec-142K01C8.8n/achrII 8,279,792C. elegans CLEC-142 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
33B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
34C01G12.3C01G12.3n/achrII 14,581,796contains similarity to Petromyzon marinus NF-180.; TR:Q91255
35W02A2.8W02A2.8n/achrIV 13,356,775
36F38A5.8F38A5.8n/achrIV 6,600,170
37C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
38spe-11F48C1.7n/achrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
39T05C12.3T05C12.3n/achrII 8,172,837contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
40kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
41F26C11.1F26C11.1n/achrII 9,894,986contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
42Y106G6G.1Y106G6G.1n/achrI 10,329,688contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4Z6
43ZK1307.3ZK1307.3n/achrII 9,652,584contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
44F29D10.1F29D10.1n/achrI 8,840,873contains similarity to Arabidopsis thaliana H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4 (EC 5.4.99.-) (Nucleolarsprotein NAP57 homolog) (Nopp-140-associated protein of 57 kDa homolog)s(AtNAP57).; SW:Q9LD90
45T21E12.5T21E12.5n/achrI 4,412,759
46Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
47F57F4.1F57F4.1n/achrV 6,391,469contains similarity to Mus musculus Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial precursor (EC 3.1.2.-)s(Acyl-CoA thioesterase 9) (Acyl-CoA thioester hydrolase 9) (Acylscoenzyme A thioester hydrolase 2) (48 kDa acyl-CoA thioestershydrolase) (p48) (Mt-ACT48.1) (Protein U8) (MTE-2).; SW:Q9R0X4
48fbxa-178F17A9.1n/achrV 6,116,834F17A9.1 encodes a divergent ONECUT class CUT homeobox protein with a single N-terminal cut domain; F17A9.1 has an atypical tyrosine residue at position 48 of its homeodomain rather than a phenylalanine or tryptophan residue; the cut domain may be a compact DNA-binding domain composed of alpha helices; phylogenetically, F17A9.1 is (somewhat distantly) affiliated with C17H12.9, Drosophila ONECUT, and mammalian HNF6 proteins; F17A9.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
49R155.2R155.2n/achrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)