UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxb-17F58E1.52e-152chrII 1,676,856This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3F48E3.6F48E3.6n/achrX 7,501,882
4fbxb-26F58E1.31.0000000000000001e-29chrII 1,683,034This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
5F38C2.5F38C2.5n/achrIV 16,278,575F38C2.5 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of F38C2.5 is predicted to function as an RNA-binding protein.
6C35D6.4C35D6.4n/achrIV 16,351,255C35D6.4 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to other TZF proteins, such as MEX-5 and POS-1, the product of C35D6.4 is predicted to function as an RNA-binding protein.
7fbxb-22Y56A3A.102.0000000000000002e-29chrIII 11,882,947This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
8sdz-33Y56A3A.143e-28chrIII 11,907,882This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
9fbxb-32M151.64e-20chrII 3,646,198C. elegans FBXB-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10T05E7.5T05E7.5n/achrI 6,201,572contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
11sdz-14F14B6.1n/achrI 12,216,990C. elegans SDZ-14 protein ;
12srg-23Y25C1A.11n/achrII 3,095,026C. elegans SRG-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
13F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
14fbxb-37T16A1.82.0000000000000002e-28chrII 2,092,797This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
15Y106G6D.2Y106G6D.2n/achrI 10,111,416contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC283767; ENSEMBL:ENSP00000347269
16T04B8.3T04B8.3n/achrII 628,093contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
17fbxb-24Y56A3A.153e-30chrIII 11,909,309This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
18F55C9.5F55C9.5n/achrV 19,290,786contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
19T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
20fbxb-54K05F6.77e-16chrII 1,555,788C. elegans FBXB-54 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001404 (Heat shock protein Hsp90), IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
21sdz-28R52.1n/achrII 2,131,740C. elegans SDZ-28 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
22sdz-22F56F4.1n/achrI 6,148,622C. elegans SDZ-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
23K02E7.7K02E7.7n/achrII 1,055,525
24R11.4R11.4n/achrX 16,210,394contains similarity to Leishmania major Hypothetical protein.; TR:Q9GRL1
25nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26fbxb-84T17A3.70.00004chrIII 146,002This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
27C24H12.11C24H12.11n/achrII 428,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
28F39F10.4F39F10.4n/achrX 16,903,278
29Y44A6C.2Y44A6C.2n/achrV 20,718,374contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I380
30fbxb-8F49B2.10.0000003chrI 14,302,931This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
31C41H7.2C41H7.2n/achrII 3,015,393This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
32C24H12.1C24H12.1n/achrII 444,212This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33F13H10.1F13H10.1n/achrIV 11,004,784contains similarity to Oryza sativa Putative pM5 collagenase.; TR:Q93W04
34fbxb-18F58E1.87.999999999999999e-30chrII 1,686,936This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains leucine-rich repeats.
35fbxb-66Y40B1B.30.005chrI 13,424,575C. elegans FBXB-66 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
36fbxb-81T17A3.30.00000009chrIII 140,425This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
37K08H2.4K08H2.4n/achrX 13,239,283
38C24H12.6C24H12.6n/achrII 418,114
39C24H12.8C24H12.8n/achrII 422,729This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
40F58E6.3F58E6.3n/achrV 9,748,618contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (4)contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
41Y57A10C.1Y57A10C.1n/achrII 12,411,984contains similarity to Macaca mulatta Thyrotropin receptor (Fragment).; TR:Q8HY53
42sdz-25M116.40.000000006chrIV 8,405,798C. elegans SDZ-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
43W10D9.1W10D9.1n/achrII 454,887
44hch-1F40E10.1n/achrX 14,698,114hch-1 encodes a member of the zinc-dependent metalloprotease family that contains an epidermal growth factor-like domain, a CUB domain, and a TSP1 domain and affects hatching and QL neuroblast migration.
45fbxb-103F53C3.2n/achrII 3,907,716This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46T26E3.5T26E3.5n/achrI 12,663,411This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
47srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48fbxb-3F38H4.20.00002chrIV 11,839,582This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
49Y106G6D.1Y106G6D.1n/achrI 10,108,184contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q58718
50Y75B12A.2Y75B12A.2n/achrV 15,109,937contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C