UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1F58E1.10F58E1.100chrII 1,690,389
2srw-144H05B21.4n/achrV 2,960,090C. elegans SRW-144 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
3dylt-2D1009.5n/achrX 8,939,705dylt-2 encodes a small putative dynein light chain subunit orthologous to human CTEX1D1, LOC343521, and TCTE3; unlike its distant paralog DYLT-1, DYLT-2 does not obviously inhibit DHC-1 in vivo; DYTL-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
4C35E7.3C35E7.3n/achrI 10,837,920
5T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
6C24H12.6C24H12.6n/achrII 418,114
7srh-140Y6E2A.6n/achrV 15,723,067C. elegans SRH-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000484 (Photosynthetic reaction centre, L and M subunits)
8F37A4.6F37A4.6n/achrIII 6,706,446
9W06D11.2W06D11.2n/achrX 12,296,301
10fbxb-101Y63D3A.3n/achrI 14,088,963C. elegans FBXB-101 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
11F55C9.11F55C9.11n/achrV 19,307,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
12F54E2.2F54E2.2n/achrV 2,796,653contains similarity to Pfam domain PF00095 WAP-type (Whey Acidic Protein) 'four-disulfide core' contains similarity to Interpro domain IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core)
13ceh-39T26C11.7n/achrX 1,855,047ceh-39 encodes a a ONECUT class CUT homeobox protein with a single N-terminal cut domain; CEH-39 acts as an X-signal element (XSE) to affect sex determination; the cut domain may be a compact DNA-binding domain composed of alpha helices; ceh-39 is one of three nematode-specific ONECUT genes in a cluster with ceh-21 and ceh-41.
14ZK938.2ZK938.2n/achrII 9,837,617contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
15F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
16C24H12.7C24H12.7n/achrII 420,597This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
17fbxb-60F55C9.7n/achrV 19,298,249This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
18K12H6.7K12H6.7n/achrII 2,835,833
19srg-23Y25C1A.11n/achrII 3,095,026C. elegans SRG-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
20F26D2.13F26D2.13n/achrV 16,435,139contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
21C29A12.6C29A12.6n/achrV 10,849,822contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
22F34D6.1F34D6.1n/achrII 2,680,190This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
23R52.4R52.4n/achrII 2,107,797
24bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
25C24H12.10C24H12.10n/achrII 426,751This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
26B0365.7B0365.7n/achrV 13,144,616contains similarity to Pfam domain PF08393 Dynein heavy chain, N-terminal region 2 contains similarity to Interpro domains IPR013602 (Dynein heavy chain, N-terminal region 2), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
27ZK816.3ZK816.3n/achrX 3,348,370
28C18E3.4C18E3.4n/achrI 4,202,730
29C01G5.8C01G5.8n/achrIV 6,550,691contains similarity to Pfam domain PF08774 VRR-NUC domain contains similarity to Interpro domain IPR014883 (VRR-NUC)
30tag-52C02F12.4n/achrX 3,676,290C. elegans TAG-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)
31fbxb-18F58E1.8n/achrII 1,686,936This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains leucine-rich repeats.
32F16G10.14F16G10.14n/achrII 2,398,093contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
33K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
34T15B7.7T15B7.7n/achrV 6,824,981contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
35asm-2ZK455.4n/achrX 11,322,599asm-2 encodes a protein similar to human acid sphingomyelinase (ASM) or sphingomyelin phosphodiesterase 1; the ASM-2 protein has a putative secretory signal peptide at the N-terminus, saposin-like and proline-rich domains and putative N-linked glycosylation sites; asm-2 shows phosphodiesterase activity when expressed in COS-7 cells; like mammalian ASM, asm-2 is probably both intracellular and secreted; northern blot analysis indicates that asm-2 is expressed during post-embryonic development as compared to asm-1 which is expressed at higher levels in the embryo; human ASM is implicated in Niemann-Pick disease type B (OMIM:607608).
36F49C5.7F49C5.7n/achrII 12,567,144contains similarity to Candida albicans Hyphal wall protein 1 (Cell elongation protein 2).; SW:HWP1_CANAL
37K02E10.1K02E10.1n/achrX 2,498,552contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
38C04A11.2C04A11.2n/achrX 13,667,311contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
39unc-42F58E6.10n/achrV 9,766,975unc-42 encodes a paired-like homeodomain protein of the Q50 class; UNC-42 is required to specify the fate of ASH sensory neurons, AVA, AVD, and AVE interneurons, and a subset of motor neurons; unc-42 mutants fail to express cell-surface receptors required for differentiated neuronal function (sra-6, srb-6, glr-1, glr-5, and glr-6); UNC-42 is also required for AVKR and HSNL growth cones to follow the PVPR and PVQL pioneer axons, for axonal outgrowth in the backward command interneurons AVA, AVD, and AVE, and for inhibition of ectopic FMRFamide-positive and GABAergic axons; unc-42 mutants are defective in mechanosensation, backward motion, and regulation of egg-laying.
40fbxb-41M01D1.8n/achrII 1,041,839This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
41srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42xbx-4C23H5.3n/achrIV 2,115,124C. elegans XBX-4 protein ;
43C24H12.11C24H12.11n/achrII 428,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
44C13A2.2C13A2.2n/achrV 7,286,774contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
45srt-71C50H11.3n/achrV 3,084,429C. elegans SRT-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002208 (SecY protein)
46F47G4.6F47G4.6n/achrI 14,060,105contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG)
47C18H9.2C18H9.2n/achrII 6,690,893contains similarity to Xenopus laevis PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q5U236
48C06G4.1C06G4.1n/achrIII 7,988,768contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
49R02C2.1R02C2.1n/achrV 237,472contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
50fbxb-19F58E1.9n/achrII 1,688,706This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.