UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1inft-1F58B6.20chrIII 1,107,561C. elegans INFT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02181 Formin Homology 2 Domain contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003104 (Actin-binding FH2 and DRF autoregulatory)
2C54E4.5C54E4.5n/achrIV 2,148,654contains similarity to Pfam domain PF05153 Family of unknown function (DUF706) contains similarity to Interpro domain IPR007828 (Protein of unknown function DUF706)
3C28G1.2C28G1.2n/achrX 8,837,092contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
4Y17D7C.1Y17D7C.1n/achrV 18,709,792contains similarity to Trypanosoma brucei Hypothetical protein.; TR:Q7YVJ9
5cmk-1K07A9.2n/achrIV 1,829,288cmk-1 encodes a Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase I (CaMK1); CMK-1 activity is required, cell autonomously and downstream of the cyclic nucleotide-gated channel TAX-4, for several aspects of AFD thermosensory neuron differentiation, including expression of the gcy-8 guanylyl cyclase and nhr-38 nuclear hormone receptor genes and morphology of the AFD sensory endings; cmk-1 activity is thus also required for normal thermosensory behavior; a cmk-1::gfp reporter is expressed in head sensory and interneurons as well as in the ventral nerve cord; expression is seen specifically in the neurons of the thermosensory circuit, AFD, AIY, and AIZ; CMK-1 localizes exclusively to the cytoplasm.
6osm-9B0212.5n/achrIV 3,554,256The osm-9 gene encodes a capsaicin receptor homolog involved in sensory responses to a subset of chemical stimuli and to ASH neuron-mediated osmotic and mechanical stimuli; OSM-9 is also involved in adaptation to volatile odorants and salts.
7C09F5.1C09F5.1n/achrIII 660,714
8F19C7.4F19C7.4n/achrIV 4,604,373contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
9C49A1.10C49A1.10n/achrI 14,243,227contains similarity to Mus musculus Proteinase activated receptor 3 precursor (PAR-3) (Thrombin receptor-slike 2) (Coagulation factor II receptor-like 2).; SW:PAR3_MOUSE
10srb-6R05H5.6n/achrII 10,195,792C. elegans SRB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
11col-164T21D9.1n/achrX 2,094,123C. elegans COL-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008160 (Collagen triple helix repeat), IPR013286 (Annexin, type VII)
12glb-31Y57G7A.9n/achrII 1,300,864glb-31 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
13sdz-4C32B5.16n/achrII 959,537C. elegans SDZ-4 protein ;
14F25F6.1F25F6.1n/achrX 4,445,262
15sri-10C54E10.4n/achrV 18,805,260C. elegans SRI-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR016040 (NAD(P)-binding)
16F45E1.5F45E1.5n/achrX 7,978,560contains similarity to Interpro domain IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A)
17nhr-217T09E11.2n/achrI 12,341,975C. elegans NHR-217 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18C03A7.2C03A7.2n/achrV 5,182,798
19C29H12.6C29H12.6n/achrII 6,116,301
20R12C12.3R12C12.3n/achrII 6,030,297contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21ceh-31C33D12.1n/achrX 3,069,626ceh-31 encodes a protein containing a homeobox domain.
22nhr-250ZK488.1n/achrV 613,820C. elegans NHR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23F13E6.4F13E6.4n/achrX 10,693,437contains similarity to Pfam domain PF00397 WW domain contains similarity to Interpro domains IPR002349 (WW), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
24C33B4.2C33B4.2n/achrII 11,371,111contains similarity to Aristolochia gigantea RPB140 (EC 2.7.7.6) (DNA-directed RNA polymerase beta chain)s(Fragment).; TR:O48912
25T16A9.4T16A9.4n/achrV 14,218,017T16A9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while T16A9.4 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
26W05B5.2W05B5.2n/achrI 13,052,842contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27F15A8.4F15A8.4n/achrX 4,408,576
28ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
29T09B9.2T09B9.2n/achrX 9,763,139contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter), IPR004745 (Na(+)-dependent inorganic phosphate cotransporter)
30R07A4.3R07A4.3n/achrX 10,756,469contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
31srw-108R11G11.5n/achrV 528,386C. elegans SRW-108 protein ;
32T20B6.3T20B6.3n/achrIII 2,899,911contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein)
33K05C4.10K05C4.10n/achrI 14,725,700contains similarity to Enterococcus faecalis Hypothetical protein.; TR:Q836A3
34skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
35srz-14K05D4.3n/achrV 16,184,163C. elegans SRZ-14 protein ;
36C55A1.1C55A1.1n/achrV 15,622,421contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37C51E3.6C51E3.6n/achrV 10,165,329contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
38F07C6.3F07C6.3n/achrIV 12,789,701contains similarity to Coxiella burnetii Hypothetical protein.; TR:Q83D43
39F20B4.3F20B4.3n/achrX 17,706,033
40srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41Y57G11B.2Y57G11B.2n/achrIV 14,566,202contains similarity to Guillardia theta Hypothetical protein orf176 from chromosome 3.; TR:Q98SC3
42fbxa-148Y102A5C.9n/achrV 16,939,509C. elegans FBXA-148 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
43str-52C45H4.12n/achrV 2,145,082C. elegans STR-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44del-1E02H4.1n/achrX 14,274,420del-1 encodes an ion channel protein of the DEG/ENaC (degenerin/epithelial Na+ channel) family; like other members of the degenerin family, DEL-1 is predicted to function as a sensory mechanotransduction channel, however detailed analysis of the DEL-1 mutant phenotype has not yet been reported; DEL-1 is expressed postembryonically in the VA and VB motor neurons and in the FLP sensory neurons; the DEL-1 expression pattern overlaps that of UNC-8, an additional C. elegans degenerin involved in movement control, with which DEL-1 may coassemble to form mechanically activated cation channels.
45nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46srsx-24C03G6.16n/achrV 7,378,672C. elegans SRSX-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47T07F10.6T07F10.6n/achrV 12,865,830contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
48F18F11.4F18F11.4n/achrIV 332,622contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
49F35F10.11F35F10.11n/achrV 3,311,123contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
50F53G12.4F53G12.4n/achrI 135,809