UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1dsl-5F58B3.81e-180chrIV 11,620,190dsl-5 encodes a putative secreted protein with single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-5 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
2ZK1086.3ZK1086.3n/achrX 13,791,278contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
3C17G10.3C17G10.3n/achrII 5,583,865
4K10D6.3K10D6.3n/achrV 11,201,218contains similarity to Homo sapiens HMG-BOX transcription factor BBX; ENSEMBL:ENSP00000319742
5F26H9.8F26H9.8n/achrI 9,322,465contains similarity to Pfam domains PF01501 (Glycosyl transferase family 8) , PF06427 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR009448 (UDP-glucose:Glycoprotein Glucosyltransferase), IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
6B0496.6B0496.6n/achrIV 7,419,545contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
7ttr-6T28B4.3n/achrX 6,596,773C. elegans TTR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
8C09D4.6C09D4.6n/achrI 5,486,821
9W04A4.2W04A4.2n/achrI 13,683,368contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ90033; TR:Q8N2R3
10K02B2.6K02B2.6n/achrIV 5,961,963
11fbxb-58H11E01.1n/achrX 1,628,252C. elegans FBXB-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
12ugt-2AC3.8n/achrV 10,399,988C. elegans UGT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
13F49D11.4F49D11.4n/achrI 10,914,398contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
14rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
15F18A12.4F18A12.4n/achrII 3,405,348F18A12.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.4 has no clear orthologs in other organisms.
16Y116A8C.19Y116A8C.19n/achrIV 17,039,245Y116A8C.19 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of Y116A8C.19 is predicted to function as an RNA-binding protein.
17C07B5.3C07B5.3n/achrX 9,522,844
18ZK1053.4ZK1053.4n/achrI 13,243,185contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Nucleoporin nup124 (Nuclear pore protein nup124).; SW:N124_SCHPO
19F09C12.2F09C12.2n/achrII 5,111,113F09C12.2 encodes a kinase most closely related to mitogen-activated protein (MAP) kinases; as loss of F09C12.2 activity via mutation or large-scale RNAi results in no obvious defects, the precise role of F09C12.2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
20R155.3R155.3n/achrIII 1,973,361contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
21snf-8ZK829.10n/achrIV 11,967,123C. elegans SNF-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR004354 (Meiotic recombination protein rec114)
22srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23cyp-33B1C25E10.2n/achrV 9,042,479C. elegans CYP-33B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
24wht-3C16C10.12n/achrIII 4,149,469C16C10.12 encodes an ATP-binding cassette (ABC) transporter; C16C10.12 activity is required for efficient RNA interference (RNAi) of a germline-expressed target, pop-1.
25F44D12.3F44D12.3n/achrIV 10,022,456contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
26F44D12.10F44D12.10n/achrIV 10,036,818contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
27gly-15C54C8.11n/achrI 12,463,985gly-15 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-15 expressed only in cellular processes that are probably part of the secretory network of the G2 gland cells.
28lgc-51F12B6.3n/achrI 2,244,756C. elegans LGC-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
29Y51A2D.1Y51A2D.1n/achrV 18,510,717contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
30phy-3T20B3.7n/achrV 16,836,164C. elegans PHY-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
31Y57G11C.8Y57G11C.8n/achrIV 14,782,524contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302919
32C33F10.8C33F10.8n/achrII 4,824,276This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33R01H2.4R01H2.4n/achrIII 7,062,521contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
34C18H2.4C18H2.4n/achrIII 7,697,463C18H2.4 is orthologous to the human gene GLOMULIN (FAP48; OMIM:601749), which when mutated leads to disease.
35C56C10.12C56C10.12n/achrII 6,606,347contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
36sur-6F26E4.1n/achrI 9,756,000C. elegans SUR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR000009 (Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
37C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
38scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
39F54F12.1F54F12.1n/achrIII 13,051,731contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
40F14D2.6F14D2.6n/achrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
41F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
42F46F5.10F46F5.10n/achrII 824,543contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
43F59B2.5F59B2.5n/achrIII 9,001,107contains similarity to Pfam domain PF01399 PCI domain contains similarity to Interpro domains IPR013143 (PCI/PINT associated module), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR000717 (Proteasome component region PCI)
44srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45sri-21T24A6.4n/achrV 3,550,559C. elegans SRI-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46fbxa-224ZK1290.9n/achrII 7,547,404fbxa-224 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
47W07G1.1W07G1.1n/achrII 13,938,717contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
48F14D2.9F14D2.9n/achrII 3,354,397contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
49C06C6.7C06C6.7n/achrV 15,993,879contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50F56F3.3F56F3.3n/achrIII 4,458,938contains similarity to Drosophila dasycnemia Wingless (Fragment).; TR:O46305