UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F57B1.1F57B1.18e-135chrV 13,194,570contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
2srg-23Y25C1A.11n/achrII 3,095,026C. elegans SRG-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4twk-12F29F11.4n/achrV 10,669,197twk-12 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-12 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-12 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-12 may, however, function redundantly with other TWK channels; the TWK-12 expression pattern has not been determined.
5F57A10.2F57A10.2n/achrV 15,766,892contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
6F54F2.6F54F2.6n/achrIII 8,800,500
7srd-51F15A2.3n/achrX 13,483,631C. elegans SRD-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
9R09D1.3R09D1.3n/achrII 9,439,305contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
10srx-117C14C11.5n/achrV 5,645,343C. elegans SRX-117 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11ZK856.11ZK856.11n/achrV 10,204,273contains similarity to Pfam domain PF01176 Translation initiation factor 1A / IF-1 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR006196 (S1, IF1 type), IPR001253 (Eukaryotic initiation factor 1A (eIF-1A))
12ZK721.3ZK721.3n/achrX 8,785,606
13C56A3.4C56A3.4n/achrV 13,551,128contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
14srg-22Y25C1A.10n/achrII 3,092,472C. elegans SRG-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
15F13G3.10F13G3.10n/achrI 7,313,972contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
16ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
17C47E12.2C47E12.2n/achrIV 10,002,723contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
18str-19T23D5.7n/achrV 15,743,832C. elegans STR-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19W04B5.2W04B5.2n/achrIII 2,425,901contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR005386 (EDG-8 sphingosine 1-phosphate receptor)
20T10B11.6T10B11.6n/achrI 6,944,267contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
21F10A3.7F10A3.7n/achrV 16,156,140contains similarity to Pfam domain PF01461 (7TM chemoreceptor)
22srw-69F18E3.5n/achrV 7,428,134C. elegans SRW-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
24str-18T23D5.6n/achrV 15,741,213C. elegans STR-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25ZC376.6ZC376.6n/achrV 14,188,934contains similarity to Interpro domain IPR001028 (Glycoprotein phospholipase D)
26F49C12.4F49C12.4n/achrIV 9,303,356contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
27fbxa-187F47H4.7n/achrV 17,340,899This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28T05A8.2T05A8.2n/achrII 2,710,658
29str-55F26D2.7n/achrV 16,416,377C. elegans STR-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30F55D1.2F55D1.2n/achrX 5,488,910
31F01F1.13F01F1.13n/achrIII 5,877,744contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
32F21H12.3F21H12.3n/achrII 6,082,723
33B0457.2B0457.2n/achrII 8,925,501contains similarity to Homo sapiens Isoform 8 of Elastin precursor; ENSEMBL:ENSP00000369958
34srh-113Y68A4A.7n/achrV 17,213,595C. elegans SRH-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35ZC373.4ZC373.4n/achrX 10,066,060contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36H05L14.2H05L14.2n/achrI 7,987,359contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
37F54B11.8F54B11.8n/achrX 13,602,980contains similarity to Silene gallica Reverse transcriptase (Fragment).; TR:Q8W3T3
38srz-18F46B3.11n/achrV 20,622,846C. elegans SRZ-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
39B0507.7B0507.7n/achrV 8,757,284contains similarity to Pfam domains PF04960 (Glutaminase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR015868 (Glutaminase, core), IPR007043 (Glutaminase), IPR012338 (Beta-lactamase-type transpeptidase fold), IPR002110 (Ankyrin)
40F28F8.7F28F8.7n/achrV 15,579,943contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000949 (ELM2)
41C40H1.3C40H1.3n/achrIII 9,328,239contains similarity to Homo sapiens Protein; VG:OTTHUMP00000003630
42K10G4.5K10G4.5n/achrV 17,299,907contains similarity to Pfam domains PF00621 (RhoGEF domain) , PF00169 (PH domain) contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR015721 (Rho GTP exchange factor)
43cyp-14A3K09A11.4n/achrX 13,272,959C. elegans CYP-14A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
44F19H6.3F19H6.3n/achrX 12,369,640contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302021
45B0244.6B0244.6n/achrIII 5,741,364contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
46T06C12.14T06C12.14n/achrV 15,900,422contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
47F53F1.6F53F1.6n/achrV 13,416,842contains similarity to Aeropyrum pernix Elongation factor 1-beta (EF-1-beta) (aEF-1beta).; SW:EF1B_AERPE
48F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
49ZK218.4ZK218.4n/achrV 17,100,011contains similarity to Interpro domain IPR000434 (Polycystic kidney disease type 1 protein)
50B0228.6B0228.6n/achrII 7,754,791