UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F57A10.2F57A10.21e-88chrV 15,766,892contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3srx-110C46E10.6n/achrII 3,710,247C. elegans SRX-110 protein ;
4C06C6.1C06C6.1n/achrV 16,011,384contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR010916 (TonB box, conserved site)
5sre-28T07C12.6n/achrV 9,945,116C. elegans SRE-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
6F54F2.6F54F2.6n/achrIII 8,800,500
7Y71A12C.2Y71A12C.2n/achrI 14,047,116contains similarity to Pfam domain PF09335 SNARE associated Golgi protein contains similarity to Interpro domain IPR015414 (SNARE associated Golgi protein)
8F57B1.1F57B1.1n/achrV 13,194,570contains similarity to Pfam domain PF04789 Protein of unknown function (DUF621) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006874 (Protein of unknown function DUF621)
9F49C5.7F49C5.7n/achrII 12,567,144contains similarity to Candida albicans Hyphal wall protein 1 (Cell elongation protein 2).; SW:HWP1_CANAL
10str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11cyp-13A8T10B9.4n/achrII 9,806,501C. elegans CYP-13A8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
12ttr-10F19F10.4n/achrV 7,553,390C. elegans TTR-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
13ZK384.3ZK384.3n/achrV 18,730,891contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001412 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site), IPR001461 (Peptidase A1)
14srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
15F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
16sri-21T24A6.4n/achrV 3,550,559C. elegans SRI-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17F02H6.5F02H6.5n/achrIV 14,222,125contains similarity to Pfam domain PF07992 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR015904 (Sulphide quinone-reductase), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
18srab-21T20D4.18n/achrV 3,423,693C. elegans SRAB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
19ZK218.5ZK218.5n/achrV 17,101,526contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
20D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.
21F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
22T05A7.7T05A7.7n/achrII 4,680,482contains similarity to Interpro domain IPR000118 (Granulin)
23F42A8.1F42A8.1n/achrII 9,343,914contains similarity to Yersinia pestis ORF4.; TR:Q9RPN3
24F25D7.5F25D7.5n/achrI 10,425,982contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
25F53G12.11F53G12.11n/achrI 145,479contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
26Y113G7B.24Y113G7B.24n/achrV 20,231,897contains similarity to Pfam domain PF05916 Synthetic lethal mutants of dpb11-1 five contains similarity to Interpro domain IPR008591 (GINS complex, Sld5 component)
27C32H11.1C32H11.1n/achrIV 12,913,842contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
28srh-74C45B11.4n/achrV 11,047,962C. elegans SRH-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29F28D1.8F28D1.8n/achrIV 12,388,613contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype)
30ilys-4C55F2.2n/achrIV 7,896,569C. elegans ILYS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
31egl-10F28C1.2n/achrV 12,459,067egl-10 encodes an RGS protein, expressed in neurons, that affects egg laying and negatively regulates GOA-1 (Galpha[o]) signalling; it requires the Gbeta(5) ortholog GPB-2 for this activity, and genetically interacts with the egl-30 and goa-1 signaling pathways.
32pqn-97ZK488.10n/achrV 609,465The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
33C50F2.7C50F2.7n/achrI 3,900,880
34F33D11.8F33D11.8n/achrI 5,854,677
35C17A2.2C17A2.2n/achrII 3,847,228contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
36srx-74F41F3.6n/achrV 4,660,713C. elegans SRX-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37tub-1F10B5.4n/achrII 8,155,446tub-1 encodes a tubby homolog that affects fat storage in C. elegans and may function in a parallel pathway with kat-1 to affect lipid accumulation based on genetic analysis; expressed primarily in sensory neurons.
38T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
39dyf-11C02H7.1n/achrX 765,241dyf-11 encodes a conserved protein orthologous to the human microtubule-binding protein MIP-T3 and that contains a lysine-rich region and a C-terminal coiled-coil domain present in a number of intraflagellar transport (IFT) complex B proteins; DYF-11 activity is required continuously in sensory neurons for formation of medial and distal ciliary segments and thus, for normal sensory cilium morphology and function and chemotaxis; a dyf-11::gfp promoter fusion is expressed in all ciliated sensory neurons as well as in the AQR, PQR, ADE, and PDR neurons; a DYF-11::GFP protein fusion is detected throughout the cilium and appears to localize to IFT-B particles in a manner consistent with an early role in IFT-B particle assembly; dyf-11 expression in ciliated neurons is dependent upon the presence of the DAF-19 RFX transcription factor.
40ZK994.1ZK994.1n/achrV 8,511,428contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
41srx-117C14C11.5n/achrV 5,645,343C. elegans SRX-117 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42twk-12F29F11.4n/achrV 10,669,197twk-12 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-12 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-12 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-12 may, however, function redundantly with other TWK channels; the TWK-12 expression pattern has not been determined.
43C03B1.1C03B1.1n/achrX 6,374,577
44str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
46str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47C13A10.2C13A10.2n/achrII 1,357,598
48F46F5.5F46F5.5n/achrII 812,930contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
49ZC404.1ZC404.1n/achrV 6,794,516
50E02H4.4E02H4.4n/achrX 14,259,690contains similarity to Arabidopsis thaliana Uncharacterized protein At1g15830.1.; TR:Q3EDB7