UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F56C3.4F56C3.40chrX 1,360,874
2ZK550.3ZK550.3n/achrIV 17,252,502contains similarity to Pfam domain PF01432 Peptidase family M3 contains similarity to Interpro domain IPR001567 (Peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F)
3T15B7.14T15B7.14n/achrV 6,833,799
4M01D7.1M01D7.1n/achrI 1,859,236This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
5F32B5.3F32B5.3n/achrI 2,693,421contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domains IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv)
6srt-71C50H11.3n/achrV 3,084,429C. elegans SRT-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002208 (SecY protein)
7col-72W09G10.1n/achrII 3,521,069C. elegans COL-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
8T27A1.3T27A1.3n/achrII 536,941This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
9F16D3.6F16D3.6n/achrI 8,376,505contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
10T04B8.2T04B8.2n/achrII 631,033This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
11T24D8.6T24D8.6n/achrX 2,365,815
12ZC204.6ZC204.6n/achrII 1,644,534
13AH9.1AH9.1n/achrX 2,245,299contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
14fbxb-118W06A11.3n/achrII 4,063,201C. elegans FBXB-118 protein ;
15srbc-16C45H4.1n/achrV 2,182,614C. elegans SRBC-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
18C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
19F25D1.2F25D1.2n/achrV 10,531,704contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
20C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
21srx-3R03H4.3n/achrV 9,006,212C. elegans SRX-3 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22Y39E4B.6Y39E4B.6n/achrIII 13,072,610contains similarity to Rattus norvegicus Nucleolar protein NOP5 (Nucleolar protein 5) (Nopp140 associatedsprotein).; SW:NOP5_RAT
23srt-27C24B9.6n/achrV 2,720,278C. elegans SRT-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25C35E7.4C35E7.4n/achrI 10,833,345
26F44F4.1F44F4.1n/achrII 10,881,580contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
27T07A5.3T07A5.3n/achrIII 10,301,759contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28F57E7.1F57E7.1n/achrV 16,481,775contains similarity to Bos taurus Enoyl-CoA hydratase precursor (EC 4.2.1.17) (Fragment).; TR:Q95KZ6
29F49H6.8F49H6.8n/achrV 17,022,485contains similarity to Rattus norvegicus Transcription factor 8 (Zinc finger homeodomain enhancer-bindingsprotein) (Zfhep).; SW:TCF8_RAT
30str-129F58G4.5n/achrV 8,091,709C. elegans STR-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F31F7.3F31F7.3n/achrV 6,269,506
32srh-178ZK228.8n/achrV 18,479,364C. elegans SRH-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33F36A2.2F36A2.2n/achrI 8,803,215contains similarity to Pfam domain PF01207 Dihydrouridine synthase (Dus) contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001269 (Dihydrouridine synthase, DuS)
34C47E8.6C47E8.6n/achrV 14,690,485contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
35nhr-76C05G6.1n/achrIV 630,739C. elegans NHR-76 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36srw-133T05B4.6n/achrV 4,114,016C. elegans SRW-133 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
37R08C7.1R08C7.1n/achrIV 4,451,940
38ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
39C04B4.4C04B4.4n/achrX 12,291,546contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein involved in exit from mitosis; SGD:YJL076W
40srg-21Y25C1A.9n/achrII 3,089,880C. elegans SRG-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
41acr-11D2092.3n/achrI 6,623,291A homolog of an alpha type nicotinic acetylcholine receptor subunit involved in the mediation of fast synaptic transmission at neuromuscular junctions.
42gcy-19C17F4.6n/achrII 3,254,897gcy-19 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; as loss of gcy-19 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-19 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; by sequence similarity, however, GCY-19 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
43F26D2.13F26D2.13n/achrV 16,435,139contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
44glb-25T06A1.4n/achrV 1,949,042glb-25 encodes a globin required for normally rapid growth in mass RNAi assays.
45C03C10.4C03C10.4n/achrIII 4,097,487contains similarity to Pfam domain PF05276 SH3 domain-binding protein 5 (SH3BP5) contains similarity to Interpro domain IPR007940 (SH3-binding 5)
46F57C9.6F57C9.6n/achrI 4,823,394contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47C54H2.4C54H2.4n/achrX 5,768,086
48T23G11.1T23G11.1n/achrI 7,701,721contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I452
49F56C3.5F56C3.5n/achrX 1,363,402
50T21E8.5T21E8.5n/achrX 10,886,592contains similarity to Mus musculus 1700021E15Rik protein.; TR:Q9DA43