UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F54F7.7F54F7.72e-180chrX 11,868,588contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3H01M10.1H01M10.1n/achrX 2,579,387
4T07F12.3T07F12.3n/achrX 4,887,726contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
5ZK265.7ZK265.7n/achrI 8,265,494contains similarity to Drosophila yakuba Salivary glue protein Sgs-3 precursor.; SW:P13728
6K01A6.6K01A6.6n/achrIV 11,738,764contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
7tag-224B0496.8n/achrIV 7,450,248tag-224 encodes an ortholog of Drosophila CG6522-PA and of human LMCD1 and TESTIN; TAG-224 is dispensable for Wnt-directed planar cell polarity and the fully asymmetrical division of B.a versus B.p cells.
8F58H1.4F58H1.4n/achrV 11,937,362contains similarity to Interpro domain IPR006207 (Cystine knot, C-terminal)
9F15G9.5F15G9.5n/achrX 9,735,456contains similarity to Homo sapiens Fibrillin 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000262464
10F57B7.2F57B7.2n/achrV 11,442,786contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
11ncs-3K03E6.3n/achrX 1,055,449ncs-3 encodes a neuronal calcium sensor (NCS) protein with no obvious null phenotype.
12F52D1.2F52D1.2n/achrX 447,631
13cdk-2K03E5.3n/achrI 3,411,552C. elegans CDK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
15rom-2C48B4.2n/achrIII 9,593,829C. elegans ROM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01694 (Rhomboid family) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid), IPR017213 (Peptidase S54, rhomboid, metazoan)
16ser-5F16D3.7n/achrI 8,385,819F16D3.7 encodes a homolog of mammalian alpha-adrenergic receptors that is expressed in vulval and bodywall muscle cells, intestine, and head neurons; heterologously expressed F16D3.7 has no effect on adenylate cyclase signalling; F16D3.7 has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
17C11G10.2C11G10.2n/achrX 15,142,124contains similarity to Homo sapiens Thyroid hormone receptor-associated protein complex 240 kDa component; ENSEMBL:ENSP00000262436
18F23A7.5F23A7.5n/achrX 16,233,076contains similarity to Homo sapiens Isoform 3 of Cyclin-L1; VG:OTTHUMP00000173336
19F27E11.1F27E11.1n/achrV 3,464,980contains similarity to Pfam domains PF01773 (Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus) , PF07670 (Nucleoside recognition) , PF07662 (Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR008276 (Concentrative nucleoside transporter), IPR002668 (Na+ dependent nucleoside transporter), IPR011657 (Na+ dependent nucleoside transporter, C-terminal), IPR011642 (Nucleoside recognition)
20nlr-1F20B10.1n/achrIV 12,174,554C. elegans NLR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF02210 (Laminin G domain) (2), PF00054 (Laminin G domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR001791 (Laminin G), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR012680 (Laminin G, subdomain 2), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase), IPR012679 (Laminin G, subdomain 1)
21srh-129F14F9.7n/achrV 5,143,034C. elegans SRH-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001036 (Acriflavin resistance protein), IPR010916 (TonB box, conserved site)
22F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
23F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
24F40G12.6F40G12.6n/achrV 14,272,120contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
25cyp-23A1B0304.3n/achrII 4,514,151The B0304.3 gene encodes a homolog of the human gene CYP7B1, which when mutated leads to giant cell hepatitis (OMIM:231100).
26nhr-227T27B7.5n/achrV 2,286,399C. elegans NHR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27F08G12.3F08G12.3n/achrX 11,301,106contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I5Q0
28ZK1086.2ZK1086.2n/achrX 13,792,979contains similarity to Shewanella oneidensis Hypothetical protein.; TR:Q8EJA6
29C30A5.6C30A5.6n/achrIII 8,206,270
30F46F11.7F46F11.7n/achrI 5,621,853contains similarity to Interpro domain IPR011061 (Proteinase inhibitor I14/I15, hirudin/antistatin)
31F56D5.5F56D5.5n/achrIV 9,407,671contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
32srm-1T28H11.2n/achrIV 5,013,566C. elegans SRM-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
33fbxa-52F07G6.6n/achrX 1,710,748C. elegans FBXA-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
34soc-1F41F3.2n/achrV 4,644,923C. elegans SOC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)
35clec-178T19E7.1n/achrIV 5,654,480C. elegans CLEC-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36sru-3C33A12.11n/achrIV 9,497,224C. elegans SRU-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
37atg-11T08A9.1n/achrX 7,337,446T08A9.1 is orthologous to the human gene LIKELY ORTHOLOG OF MOUSE COILED COIL FORMING PROTEIN 1 (RB1CC1; OMIM:606837), which when mutated leads to disease.
38C32B5.5C32B5.5n/achrII 974,906contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain
39C08H9.6C08H9.6n/achrII 9,873,847contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
40F15A4.5F15A4.5n/achrII 12,470,242contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ICX2
41F11A5.8F11A5.8n/achrV 16,208,396contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42C07G3.2C07G3.2n/achrV 3,524,079contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
43fpn-1.3R08F11.6n/achrV 3,796,213C. elegans FPN-1.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF06963 Ferroportin1 (FPN1) contains similarity to Interpro domains IPR009716 (Ferroportin1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44cyn-9T27D1.1n/achrIII 3,698,740cyn-9 encodes a peptidyl prolyl cis-trans isomerase most similar to human cyclophilin G (OMIM:606093); CYN-9 likely functions as a catalyst in the folding and modification of cuticle collagens; a cyn-9::lacZ reporter is expressed in the syncytial hypodermis from early larval through adult stages; cyn-9 mRNA is expressed most strongly at the mid-L3 and mid-L4 larval stages, the intermoult period when collagens are synthesized.
45str-46C31B8.6n/achrV 2,899,200C. elegans STR-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46tni-4W03F8.1n/achrIV 5,205,854tni-4 encodes one of the four elegans troponin I proteins; tni-4 is required for the normal development of the pharynx during embryonic development; TNI-4 interacts only with the pharyngeal troponin C; tni-4 is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
47T16D1.1T16D1.1n/achrII 5,241,424
48sre-24F37B4.9n/achrV 2,885,567C. elegans SRE-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
49C08H9.1C08H9.1n/achrII 9,876,448contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
50ceh-1F16H11.4n/achrX 4,653,768ceh-1 encodes a protein that contains a homeobox domain.