UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F54E4.2F54E4.20chrX 14,627,172contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
4C03B1.3C03B1.3n/achrX 6,366,380
5spp-16F32D8.9n/achrV 10,900,900C. elegans SPP-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
6sre-21C47A10.4n/achrV 17,771,397C47A10.4 is orthologous to the human gene ALBINISM, OCULAR, TYPE I (OA1; OMIM:300500), which when mutated leads to Nettleship-Falls type ocular albinism.
7C14A11.5C14A11.5n/achrX 2,806,295
8srd-27T26E4.12n/achrV 15,803,891C. elegans SRD-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9srt-19F47D2.1n/achrV 4,286,112C. elegans SRT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
10K05G3.1K05G3.1n/achrX 16,501,554contains similarity to Pfam domain PF01612 3'-5' exonuclease contains similarity to Interpro domain IPR002562 (3'-5' exonuclease)
11sre-53C50E10.3n/achrII 12,322,214C. elegans SRE-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
12B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
13E03H4.12E03H4.12n/achrI 12,436,494contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
14Y44A6D.6Y44A6D.6n/achrV 20,807,147contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
15srg-28T09D3.2n/achrV 5,335,592C. elegans SRG-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
16T02G5.3T02G5.3n/achrII 7,094,691
17srz-45Y6G8.1n/achrV 17,593,282C. elegans SRZ-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
18R09D1.13R09D1.13n/achrII 9,444,567contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
19T05H4.3T05H4.3n/achrV 6,444,929contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal)
20fbxa-32ZC47.6n/achrIII 1,268,313This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
21sre-1B0495.1n/achrII 7,710,540sre-1 encodes a putative seven transmembrane chemoreceptor; an SRE-1::GFP reporter is expressed in the ADL and ASJ amphid sensory neurons.
22T22B11.3T22B11.3n/achrIV 4,684,022contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23T24D5.2T24D5.2n/achrX 12,585,041contains similarity to Plasmodium falciparum DNA-directed RNA polymerase beta chain (EC 2.7.7.6).; SW:RPOB_PLAFA
24ced-3C48D1.2n/achrIV 13,202,258The ced-3 gene encodes a protease required for apoptosis.
25C40D2.4C40D2.4n/achrII 2,000,282contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
26C01G6.9C01G6.9n/achrII 9,294,851contains similarity to Plasmodium falciparum SET-domain protein, putative.; TR:Q8IC77
27C47E8.3C47E8.3n/achrV 14,681,957contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
28K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
29C10A4.1C10A4.1n/achrX 7,417,182contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
30Y38F1A.2Y38F1A.2n/achrII 12,956,401contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
31lgc-23C15A7.1n/achrX 12,066,273C. elegans LGC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
32T03G11.5T03G11.5n/achrX 5,168,923
33tag-312C33D12.6n/achrX 3,057,313C. elegans TAG-312 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF00036 (EF hand) (2), PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR011992 (EF-Hand type), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily), IPR001854 (Ribosomal protein L29)
34gcy-33F57F5.2n/achrV 11,998,799gcy-33 encodes a soluble guanylyl cyclase; a gcy-33::GFP reporter is expressed in the ciliated BAG head sensory neurons.
35ZC376.1ZC376.1n/achrV 14,179,216contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
36srr-2T26H2.8n/achrV 19,215,331C. elegans SRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
37C32E8.3C32E8.3n/achrI 3,787,036contains similarity to Pfam domain PF05517 p25-alpha contains similarity to Interpro domain IPR008907 (P25-alpha)
38nhr-83F48G7.3n/achrV 632,120C. elegans NHR-83 protein; contains similarity to Pfam domains PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR015897 (CHK kinase-like)
39C06E2.2C06E2.2n/achrX 8,879,967
40C01G6.7C01G6.7n/achrII 9,292,949contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
41srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
43srh-28ZC404.5n/achrV 6,774,975C. elegans SRH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
45C49A1.5C49A1.5n/achrI 14,239,274contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
46C25E10.7C25E10.7n/achrV 9,050,528C25E10.7 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; C25E10.7 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; C25E10.7 has no obvious function in mass RNAi assays.
47fbxb-65C43D7.2n/achrV 19,330,120This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
48C46A5.1C46A5.1n/achrIV 7,765,495contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
49T03F7.5T03F7.5n/achrV 11,297,691contains similarity to Staphylococcus aureus YdbT-like protein.; TR:Q8GPI5
50K05C4.10K05C4.10n/achrI 14,725,700contains similarity to Enterococcus faecalis Hypothetical protein.; TR:Q836A3