UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F54C1.6F54C1.63e-140chrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
2nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3K01A6.5K01A6.5n/achrIV 11,743,140contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q14202 Zinc finger protein 261; ENSEMBL:ENSP00000322845
4twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
5W04B5.6W04B5.6n/achrIII 2,434,376
6F58A6.2F58A6.2n/achrII 5,137,627
7F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
8srw-79T11F1.5n/achrII 2,947,802C. elegans SRW-79 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
10M6.4M6.4n/achrX 631,028
11srbc-83C31A11.3n/achrV 16,297,797C. elegans SRBC-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002231 (5-Hydroxytryptamine receptor)
12clec-2B0454.7n/achrII 3,021,991C. elegans CLEC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13F40D4.12F40D4.12n/achrV 17,161,146contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
14his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.
15K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
16T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
17F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
18clec-182C33D9.2n/achrIV 8,797,600C. elegans CLEC-182 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
19C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
20F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21srsx-32F20A1.3n/achrV 7,018,087C. elegans SRSX-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22F45C12.3F45C12.3n/achrII 1,731,227contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
23F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
24ocr-2T09A12.3n/achrIV 8,216,912ocr-2 encodes a TRPV (transient receptor potential channel, vanilloid subfamily) ion channel; OCR-2 activity is required for several types of sensory transduction including olfaction, osmosensation, mechanosensation, and chemosensation; an OCR-2 fusion protein is expressed in sensory cilia and requires the OSM-9 TRPV channel protein for proper localization; likewise, OSM-9 requires OCR-2 for its cilial localization.
25F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
27F23D12.1F23D12.1n/achrX 14,425,936contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE1252.; TR:Q8XKZ0
28F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
29fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
30C29F9.1C29F9.1n/achrIII 133,396
31tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
32F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
33F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
34T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35srh-208C43D7.6n/achrV 19,317,895This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
36nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
37T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
38F53E10.3F53E10.3n/achrV 2,606,470
39B0286.1B0286.1n/achrII 4,382,555contains similarity to Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8; ENSEMBL:ENSP00000302239
40scd-2T10H9.2n/achrV 6,636,446C. elegans SCD-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR000998 (MAM), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
41exc-9F20D12.5n/achrIV 7,940,302exc-9 encodes a LIM domain-containing protein; exc-9 activity is required for proper development and morphogenesis of the excretory cell canal.
42clec-31F49A5.2n/achrV 16,857,086C. elegans CLEC-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43sre-41Y57A10B.5n/achrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
44F25H2.2F25H2.2n/achrI 10,544,713contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001683 (Phox-like), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
45F32B4.5F32B4.5n/achrI 11,519,244contains similarity to Homo sapiens BTB/POZ domain-containing protein KCTD16; ENSEMBL:ENSP00000329906
46C18G1.7C18G1.7n/achrV 4,746,815contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
47nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48Y48A6C.1Y48A6C.1n/achrIII 11,104,510contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
49R04A9.3R04A9.3n/achrX 378,980
50igcm-2SSSD1.1n/achrX 6,382,121igcm-2 encodes a protein containing immunoglobulin and fibronectin repeats; igcm-2 promoter::gfp fusions are expressed in the PVT interneuron, in some head neurons, and in the pharynx and intestine.