UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F54B11.5F54B11.52e-118chrX 13,595,020contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C53A5.11C53A5.11n/achrV 14,563,580contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
4C56A3.6C56A3.6n/achrV 13,554,913contains similarity to Pfam domain PF00036 (EF hand)
5srv-34F13A7.3n/achrV 16,373,569C. elegans SRV-34 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000355 (Chemokine receptor)
6mbr-1T01C1.2n/achrX 10,720,732C. elegans MBR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05225 helix-turn-helix, Psq domain contains similarity to Interpro domains IPR011526 (Helix-turn-helix, Psq-like), IPR007889 (Helix-turn-helix, Psq)
7R05D7.3R05D7.3n/achrI 12,169,337contains similarity to Interpro domain IPR000085 (Bacterial DNA recombination protein, RuvA)
8ZC411.1ZC411.1n/achrV 8,878,230
9nhr-198K06B4.8n/achrV 15,695,079C. elegans NHR-198 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10F54D5.11F54D5.11n/achrII 11,541,574contains similarity to Pfam domain PF02186 TFIIE beta subunit core domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR016656 (Transcription initiation factor IIE, beta subunit), IPR003166 (Transcription factor TFIIE beta subunit, core)
11F19G12.2F19G12.2n/achrX 1,429,318contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
12K04A8.2K04A8.2n/achrV 6,563,097contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
13str-208F26G5.2n/achrV 4,957,686C. elegans STR-208 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14lin-32T14F9.5n/achrX 2,229,639lin-32 encodes a basic helix-loop-helix transcription factor that is required for development of several types of neurons, including the touch receptor neurons and the male sensory ray neurons.
15C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
16F47G6.3F47G6.3n/achrI 1,467,585contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
17T14F9.2T14F9.2n/achrX 2,235,334
18Y53C12B.2Y53C12B.2n/achrII 9,740,855contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
19F30A10.1F30A10.1n/achrI 9,473,896contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
20C39B10.4C39B10.4n/achrX 10,445,432contains similarity to Brachydanio rerio Similar to synaptonemal complex protein 1 (Fragment).; TR:Q7ZVL0
21srx-13C44B12.4n/achrIV 1,116,817C. elegans SRX-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22R05C11.2R05C11.2n/achrIV 2,058,493contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
23cah-1F54D8.4n/achrIII 5,084,208cah-1 encodes a member of the carbonic anhydrase family.
24B0198.3B0198.3n/achrX 12,045,895contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
25glb-2C06E4.7n/achrIV 7,262,720glb-2 encodes a globin; glb-2 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
26F28E10.2F28E10.2n/achrIV 4,563,722contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
27C06E4.4C06E4.4n/achrIV 7,259,079contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
28R09H3.3R09H3.3n/achrX 1,667,620
29srx-44T10C6.4n/achrV 16,021,667C. elegans SRX-44 protein ; contains similarity to Rattus norvegicus Blue-sensitive opsin (BOP) (Blue cone photoreceptor pigment) (Shortswavelength-sensitive cone opsin) (S opsin).; SW:Q63652
30T03F7.6T03F7.6n/achrV 11,295,604contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
31str-211C02E7.13n/achrV 4,943,703C. elegans STR-211 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32sre-37F15A4.3n/achrII 12,466,610C. elegans SRE-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
33ZC132.8ZC132.8n/achrV 4,316,012
34T22B2.5T22B2.5n/achrX 3,910,583
35W04D2.5W04D2.5n/achrV 12,493,975contains similarity to Pfam domain PF00411 Ribosomal protein S11 contains similarity to Interpro domain IPR001971 (Ribosomal protein S11)
36C01C4.2C01C4.2n/achrX 3,717,428
37K02D3.1K02D3.1n/achrX 13,707,203contains similarity to Clostridium acetobutylicum Transcriptional regulator, AcrR family.; TR:Q97IH3
38C25A1.12C25A1.12n/achrI 10,192,090contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
39srx-134F09F3.7n/achrV 13,855,910C. elegans SRX-134 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
40ikb-1C04F12.3n/achrI 9,687,053ikb-1 encodes an ortholog of human BCL3 (OMIM:109560) that physically interacts with the checkpoint protein MRT-2; ikb-1(nr2019) and ikb-1(nr2027) mutants display no obvious phenotype other than shortened lifespan; mutation of BCL3 is frequently associated with recurring translocations found in the neoplastic cells of patients with chronic lymphocytic leukemia, and has been implicated in cell cycle control (perhaps via apoptosis).
41F52G3.4F52G3.4n/achrX 16,950,151
42F52D1.2F52D1.2n/achrX 447,631
43B0361.10B0361.10n/achrIII 7,286,727contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR010908 (Longin), IPR001388 (Synaptobrevin), IPR011012 (Longin-like)
44F57B7.2F57B7.2n/achrV 11,442,786contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
45ZC482.7ZC482.7n/achrIII 12,752,251contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
46R160.6R160.6n/achrX 4,372,098
47sre-13C38C6.4n/achrII 14,635,649C. elegans SRE-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
48Y57A10B.6Y57A10B.6n/achrII 12,391,276contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
49F25A2.1F25A2.1n/achrV 1,180,578contains similarity to Rattus norvegicus C-X-C chemokine receptor type 7 (CXC-R7) (CXCR-7) (G-protein coupledsreceptor RDC1 homolog) (RDC-1) (Chemokine orphan receptor 1).; SW:O89039
50Y116A8C.43Y116A8C.43n/achrIV 17,089,705contains similarity to Bacillus thuringiensis Pesticidial crystal protein cry12Aa (Insecticidal delta-endotoxinsCryXIIA(a)) (Crystaline entomocidal protoxin) (142 kDa crystalsprotein).; SW:CCAA_BACTU