UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F53H4.4F53H4.42e-160chrX 15,867,475contains similarity to Salmonella typhi Hypothetical protein STY0658.; TR:Q8Z8J9
2W04C9.5W04C9.5n/achrI 464,897contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
3B0041.1B0041.1n/achrI 4,665,314
4spe-38Y52B11A.1n/achrI 10,965,401C. elegans SPE-38 protein ;
5T27A8.5T27A8.5n/achrX 16,065,286contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
6nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7R09H10.1R09H10.1n/achrIV 10,601,257contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
8Y37D8A.22Y37D8A.22n/achrIII 12,937,773contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 49.; SW:Q6NYY9
9T13A10.1T13A10.1n/achrIV 6,276,666contains similarity to Danio rerio Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog (EC 1.-.-.-).; SW:Q8JFV8
10srx-104F40H7.7n/achrII 3,699,139C. elegans SRX-104 protein ;
11sri-47F22E5.4n/achrII 2,657,583C. elegans SRI-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12ZK688.7ZK688.7n/achrIII 7,911,165
13C18D11.1C18D11.1n/achrIII 11,818,072contains similarity to Sporobolus stapfianus Hypothetical protein.; TR:O04820
14F02E11.3F02E11.3n/achrII 3,273,416contains similarity to Interpro domain IPR010993 (Sterile alpha motif homology)
15srw-7R08F11.5n/achrV 3,806,992C. elegans SRW-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16Y51A2A.6Y51A2A.6n/achrV 18,303,075contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
17K08E3.2K08E3.2n/achrIII 13,747,959contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
18hlh-14C18A3.8n/achrII 5,738,759hlh-14 encodes a basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor that is one of five C. elegans Achaete-Scute family homologs; HLH-14 activity is required generally for normal egg-laying, movement, body morphology, and larval development; more specifically, HLH-14 is required for proper neuronal development, particularly for regulation of the asymmetric cell division that gives rise to the PVQ/HSN/PHB neuroblasts and for normal differentiation of these neuroblast descendants, including their cell division patterns, migrations, and neurotransmitter expression; in specifying neuronal cell fates, genetic evidence suggests that hlh-14 acts together with hlh-2, which encodes the C. elegans E/Daughterless ortholog; HLH-14 is expresed exclusively in the embryo and detected in the left and right PVQ/HSN/PHB neuroblasts and their descendants, as well as in other cells identified, tentatively, as anterior neuroblasts and posterior neuroblasts such as Caapa.
19fax-1F56E3.4n/achrX 3,198,294fax-1 encodes a conserved nuclear receptor that contains two C4-type zinc fingers and is orthologous to the vertebrate photoreceptor-specific nuclear receptor PNR (OMIM:604485, mutated in enhanced S-cone syndrome and retinitis pigmentosa); fax-1 is required for normal locomotion and neuron fate specification, including specification of the AVA, AVE, and AVK interneurons and proper axon pathfinding of the AVK, HSNL, and PVQL axons; expression of reporter gene fusions in fax-1 mutants suggests that fax-1 functions by regulating expression of a number of downstream targets, including nmr-1 and nmr-2, opt-3, flp-1, and ncs-1; in some neurons, fax-1 regulates expression combinatorially with unc-42, which encodes a paired-like homeodomain protein that additionally, regulates fax-1 expression in AVK neurons; FAX-1 is expressed in the nuclei of 18 neurons, including the AVK, AVA, AVB, and AVE interneurons, beginning at mid-embryogenesis and continuing through larval and adult stages; FAX-1 is also seen in two non-neuronal cell types: the distal tip cells (DTCs), from L2 to L4 larval stages, and two pairs of vulval cells in L4 animals.
20fbxa-213Y37H2C.3n/achrV 18,268,033This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
21clec-192Y116A8A.1n/achrIV 16,803,039C. elegans CLEC-192 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22T27E7.4T27E7.4n/achrIV 14,534,258contains similarity to Pelomedusa subrufa NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (EC 1.6.5.3).; SW:NU5M_PELSU
23F55F1.1F55F1.1n/achrX 2,779,060contains similarity to Homo sapiens Rho family guanine-nucleotide exchange factor; ENSEMBL:ENSP00000328118
24ZK1225.2ZK1225.2n/achrI 13,209,439contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
25F17C8.6F17C8.6n/achrIII 4,745,411F17C8.6 encodes an alpha1 Ca2+ channel subunit; large-scale RNAi experiments indicate that during development F17C8.6, along with nca-2, may play a role in regulating egg size and shape.
26T10E9.9T10E9.9n/achrI 6,547,634contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
27srt-8C50H11.2n/achrV 3,087,272C. elegans SRT-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
28F49C12.1F49C12.1n/achrIV 9,295,603contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
29srh-275C03G6.7n/achrV 7,353,665C. elegans SRH-275 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30lgc-54T15B7.16n/achrV 6,841,721C. elegans LGC-54 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
31cof-2C48E7.5n/achrI 6,251,698cof-2 encodes a homolog of human GLC1A, which when mutated leads to glaucome primary open angle (OMIM:137750)
32C56G2.5C56G2.5n/achrIII 6,323,209contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB)
33F31B9.2F31B9.2n/achrX 15,919,200contains similarity to Mus musculus Radixin (ESP10).; SW:RADI_MOUSE
34nhr-53K06B4.11n/achrV 15,701,459C. elegans NHR-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
36R07B1.6R07B1.6n/achrX 9,867,228contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
37str-217Y102A5C.28n/achrV 16,999,587C. elegans STR-217 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
39F13A2.3F13A2.3n/achrV 4,394,967
40fbxa-148Y102A5C.9n/achrV 16,939,509C. elegans FBXA-148 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
41nhr-252ZK6.2n/achrV 405,309C. elegans NHR-252 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42C51E3.6C51E3.6n/achrV 10,165,329contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
43ric-19C32E8.7n/achrI 3,779,897The ric-19 gene encodes an evolutionarily conserved cytosolic protein involved in neuroendocrine secretion via association with secretory vesicles.
44srd-70F48F5.4n/achrV 20,450,660C. elegans SRD-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srsx-30C51E3.5n/achrV 10,159,536C. elegans SRSX-30 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46irk-1R03E9.4n/achrX 6,769,400C. elegans IRK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01007 Inward rectifier potassium channel contains similarity to Interpro domains IPR013521 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir, conserved region 2), IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR013518 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir, cytoplasmic), IPR001838 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir-like)
47sre-43W07G1.6n/achrII 13,967,710C. elegans SRE-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48R12C12.4R12C12.4n/achrII 6,039,457
49C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
50C34E7.3C34E7.3n/achrX 12,931,101contains similarity to Plasmodium falciparum Ribonuclease, putative.; TR:Q8ICL5