UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F53F1.6F53F1.64.0000000000000004e-157chrV 13,416,842contains similarity to Aeropyrum pernix Elongation factor 1-beta (EF-1-beta) (aEF-1beta).; SW:EF1B_AERPE
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3ZK353.5ZK353.5n/achrIII 8,394,543
4F10A3.12F10A3.12n/achrV 16,164,918contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
7srd-48F17A2.9n/achrX 12,336,853C. elegans SRD-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
9F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
10T21D9.2T21D9.2n/achrX 2,095,709contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
11C46C2.3C46C2.3n/achrIV 9,226,726contains similarity to Tropheryma whipplei DNA repair protein RecN.; TR:Q83NU4
12sri-46K07E8.11n/achrII 670,321C. elegans SRI-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13srd-55K02A2.2n/achrII 7,409,558C. elegans SRD-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14C24A8.5C24A8.5n/achrX 4,328,634
15str-141F47G9.2n/achrV 11,323,048C. elegans STR-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
17B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
18srt-14ZC142.2n/achrV 4,255,024C. elegans SRT-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
20sre-22F36D1.2n/achrI 11,284,373C. elegans SRE-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
21F47B7.5F47B7.5n/achrX 3,768,291contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
22C56A3.4C56A3.4n/achrV 13,551,128contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
23clec-143ZK673.9n/achrII 10,469,224C. elegans CLEC-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
24tba-5F16D3.1n/achrI 8,355,612tba-5 encodes one of nine C. elegans alpha tubulins; by homology, TBA-5 is predicted to be a component of microtubules; as loss of tba-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, TBA-5 likely functions redundantly with other alpha tubulins as a basic component of cellular architecture that may play additional roles in processes such as cell division, cell movement, and intracellular transport.
25T26E4.2T26E4.2n/achrV 15,781,680contains similarity to Salmonella typhimurium Sialidase (EC 3.2.1.18) (Fragment).; TR:Q9R5J8
26sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
27K02F3.7K02F3.7n/achrIII 836,776
28M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
29F09G8.7F09G8.7n/achrIII 8,268,070
30K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
31D1053.2D1053.2n/achrX 11,728,445contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
32F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
33C50E3.9C50E3.9n/achrV 7,599,821contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
34F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
35R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
36C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
37K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
38Y17G7B.13Y17G7B.13n/achrII 12,045,368contains similarity to Pfam domain PF06090 Domain of unknown function (DUF941) contains similarity to Interpro domain IPR009286 (Protein of unknown function DUF941)
39nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.
40Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7
41F11A5.7F11A5.7n/achrV 16,205,976contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
42T23D5.8T23D5.8n/achrV 15,747,913contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
43T22E7.2T22E7.2n/achrI 5,767,620contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
44Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
45srd-51F15A2.3n/achrX 13,483,631C. elegans SRD-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46F44A2.2F44A2.2n/achrV 9,319,570contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
47W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
48clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
49Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
50srw-87F57G8.4n/achrV 16,337,424C. elegans SRW-87 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)