UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F53A9.4F53A9.40chrX 8,705,694
2F32H2.6F32H2.6n/achrI 8,999,077contains similarity to Pfam domain PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR000794 (Beta-ketoacyl synthase), IPR014030 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal), IPR016039 (Thiolase-like)
3Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
4ifta-2T28F3.6n/achrIV 17,301,376ifta-2 encodes a ciliary protein, orthologous to human RABL5, that is required for normally short life span and dauer formation; IFTA-2 is expressed in amphid, labial, and phasmid ciliated sensory neurons; intracellularly, IFTA-2 resides in the bases and axonemes of cilia, colocalizing with DAF-2 and AGE-1; IFTA-2 may be either a cargo or a cargo-docking component of intraflagellar transport (IFT) by the IFT-B complex; ciliary basal localization of IFTA-2 is abolished by a T42N mutation predicted to lock ITFA-2 into an inactive, GDP-bound conformation; ifta-2(tm1724) mutants have abnormally long lifespans and constitutive dauer formation, perhaps because IFTA-2 regulates DAF-2 signalling from ciliated sensory neurons; IFTA-2 is not required for cilium assembly or IFT, nor is it required for chemosensation or osmosensation; the ciliary localization of IFTA-2 is conserved in RABL5; via an X-box in its promoter, ifta-2 is a candidate for direct regulation by DAF-19.
5C33A12.4C33A12.4n/achrIV 9,510,301contains similarity to Homo sapiens Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E; ENSEMBL:ENSP00000324074
6math-48ZK250.6n/achrII 1,945,985C. elegans MATH-48 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00917 (MATH domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR012885 (F-box associated type 2)
7clec-139F35D11.10n/achrII 4,620,939C. elegans CLEC-139 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
8T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
9T19D7.7T19D7.7n/achrX 678,427contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
10C54G4.5C54G4.5n/achrI 7,996,207
11F22B7.3F22B7.3n/achrIII 8,649,167
12C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
13ZK177.3ZK177.3n/achrII 5,516,470contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
14F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
15F58G1.7F58G1.7n/achrII 12,945,904contains similarity to Interpro domain IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
16Y8A9A.4Y8A9A.4n/achrII 3,791,066
17fbxb-80E04A4.2n/achrIV 4,735,325C. elegans FBXB-80 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
18C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
19srx-85F38B7.4n/achrV 11,553,428C. elegans SRX-85 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
21C03H5.4C03H5.4n/achrII 375,541contains similarity to Pfam domain PF00068 Phospholipase A2 contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR001211 (Phospholipase A2, eukaryotic), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
22F47B10.8F47B10.8n/achrX 10,905,841contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
23arl-3F19H8.3n/achrII 14,607,534arl-3 encodes a member of the ARL (ADP-ribosylation factor(ARF)-like) family of proteins which are very similar to ARF proteins but lack the ability to stimulate ADP ribosylation by cholera toxin; as loss of arl-3 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of ARL-3 is not yet known.
24T23G4.2T23G4.2n/achrIV 13,688,527contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
25F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
26Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
27C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
28M01E10.3M01E10.3n/achrIII 2,054,148contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
29srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
31Y42A5A.4Y42A5A.4n/achrV 11,106,364contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
32C39D10.5C39D10.5n/achrX 7,891,348
33srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34rab-28Y11D7A.4n/achrIV 9,243,090rab-28 encodes a small GTPase homologous to the Rab GTPases that function in endocytosis, membrane fusion, and vesicular trafficking events; the precise biological role and expression pattern of rab-28 are not yet known.
35F58E6.1F58E6.1n/achrV 9,742,698n/a
36T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
37R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
38F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
39F16B12.4F16B12.4n/achrX 14,097,334contains similarity to Dictyostelium discoideum Myosin II heavy chain, non muscle.; SW:MYS2_DICDI
40F55E10.2F55E10.2n/achrX 8,340,780
41K06B4.4K06B4.4n/achrV 15,669,604contains similarity to Interpro domain IPR006025 (Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region)
42T26E4.3T26E4.3n/achrV 15,783,606contains similarity to Pfam domain PF01531 (Glycosyl transferase family 11)
43F23A7.1F23A7.1n/achrX 16,217,447contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RSC4 is a member of RSC complex, which remodels the structure of chromatin.; SGD:YKR008W
44ZC239.3ZC239.3n/achrII 3,216,335contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
45T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
46K03F8.1K03F8.1n/achrIII 6,511,465contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
47R03H10.5R03H10.5n/achrII 4,170,159contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
48D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
49sdz-23F58G4.4n/achrV 8,100,032sdz-23 encodes a putatively secreted protein with a single EGF domain, with some similarity to LAG-2; sdz-23 begins to be expressed in the E blastomere of 8-cell embryos, and continues to be expressed solely in the E lineage througout embryogenesis; sdz-23 requires SKN-1 and WRM-1 for E lineage expression, and is a putative MED-1/2 target gene; sdz-23 is both activated by POP-1 (with SYS-1 as coactivator, in the E lineage) and repressed by POP-1 (in the MS lineage), while the dependence of sdz-23 on WRM-1 for E lineage expression is alleviated by loss of POP-1, indicating that WRM-1 switches POP-1 from repression to activation in the E lineage; sdz-23 requires SYS-1 for normal embryonic expression; SDZ-23 has no obvious function in mass RNAi assays.
50ZC373.2ZC373.2n/achrX 10,058,054contains similarity to Synechococcus elongatus Tll2335 protein.; TR:Q8DGI2