UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F52H2.1F52H2.10chrX 2,574,893
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4C01H6.3C01H6.3n/achrI 7,208,985contains similarity to Pfam domain PF00096 (Zinc finger, C2H2 type)
5ZK938.3ZK938.3n/achrII 9,832,928contains similarity to Pfam domain PF00612 IQ calmodulin-binding motif contains similarity to Interpro domain IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
6M04C9.4M04C9.4n/achrI 9,356,115contains similarity to Bos taurus Osteopontin precursor (Bone sialoprotein 1).; SW:OSTP_BOVIN
7sma-3R13F6.9n/achrIII 6,862,404sma-3 encodes a Smad protein; during development, SMA-3 functions as part of a DBL-1/SMA-6 TGF-beta-related signaling pathway that controls body size and male tail sensory ray and spicule formation; sma-3 is widely expressed at all developmental stages, beginning during embryogenesis, continuing through all larval stages, and seen very strongly in adult hermaphrodites and males; a SMA-3::GFP is detected in the pharynx, intestine, and hypodermis and localizes to the nucleus; sma-3 expression in the hypodermis is necessary and sufficient for normal body size; SMA-3 can physically interact with the LIN-31 forkhead transcription factor.
8dpy-22F47A4.2n/achrX 9,816,134dpy-22 encodes a broadly expressed protein, homologous to the human transcriptional mediator protein TRAP230, which is involved in WNT and RAS signaling, as well as in dosage compensation; DPY-22 has a C-terminal glutamine-rich domain that is dispensable for inhibition of RAS-dependent cell differentiation, but is required for inhibition of BAR-1-dependent gene expression.
9srg-33F21F8.1n/achrV 8,292,769C. elegans SRG-33 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
10F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11clec-178T19E7.1n/achrIV 5,654,480C. elegans CLEC-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12xbx-1F02D8.3n/achrV 14,981,466C. elegans XBX-1 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1; ENSEMBL:ENSP00000260605
13F45D3.2F45D3.2n/achrV 12,541,972contains similarity to Dictyocaulus viviparus Putative uncharacterized protein.; TR:Q6E6T3
14F40A3.5F40A3.5n/achrV 7,869,571contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15T08B6.2T08B6.2n/achrIV 4,895,590
16Y17D7C.2Y17D7C.2n/achrV 18,717,931contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
17F59A3.1F59A3.1n/achrI 5,525,077F59A3.1 encodes one of two C. elegans carboxypeptidase D homologs; loss of F59A3.1 activity via large-scale RNAi screens in a sensitized, rrf-3 mutant background results in larval lethality, abnormal locomotion, and abnormal morphogenesis of the vulval epithelium resulting in rupture; high-throughput expression studies report F59A3.1 expression in the pharynx only.
18ceh-23ZK652.5n/achrIII 7,840,469The ceh-23 gene encodes a homeodomain protein required for a specific differentiated trait of the thermosensory interneuron AIY.
19C32B5.5C32B5.5n/achrII 974,906contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain
20K06A9.3K06A9.3n/achrX 1,534,681contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
21C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
22C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
23F54A5.2F54A5.2n/achrI 966,565contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
24T09E11.3T09E11.3n/achrI 12,369,888contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
25ceh-24F55B12.1n/achrV 13,814,273ceh-24 is orthologous to the human gene SIMILAR TO THYROID TRANSCRIPTION FACTOR 1 (TITF1; OMIM:600635), which when mutated leads to disease.
26str-16Y73C8A.1n/achrV 3,239,764C. elegans STR-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
27F21D9.1F21D9.1n/achrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28clec-182C33D9.2n/achrIV 8,797,600C. elegans CLEC-182 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29W04G5.9W04G5.9n/achrI 11,644,012contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
30acr-5K03F8.2n/achrIII 6,512,172acr-5 encodes a predicted member of the alpha subunit family of nicotinic acetylcholine receptors that is expressed in the nervous system.
31R08B4.3R08B4.3n/achrX 11,119,911contains similarity to Homo sapiens 23 kDa protein; VG:OTTHUMP00000170038
32F45E6.1F45E6.1n/achrX 12,476,473contains similarity to Interpro domain IPR005829 (Sugar transporter, conserved site)
33gcy-3R134.1n/achrII 9,504,941gcy-3 is predicted to encode a guanylate cyclase.
34srw-136K12D9.10n/achrV 3,009,736C. elegans SRW-136 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
35C34F6.10C34F6.10n/achrX 11,233,244contains similarity to Pfam domain PF00041 Fibronectin type III domain contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR000694 (Proline-rich region)
36srw-122H27D07.5n/achrV 2,951,456C. elegans SRW-122 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
37F57B7.2F57B7.2n/achrV 11,442,786contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
38nhr-116F09C6.9n/achrV 16,913,761C. elegans NHR-116 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
40F39B3.2F39B3.2n/achrX 17,569,704contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41F47F2.2F47F2.2n/achrX 3,886,480
42str-178R11D1.5n/achrV 12,715,427C. elegans STR-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F15A4.5F15A4.5n/achrII 12,470,242contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ICX2
44T06H11.2T06H11.2n/achrX 10,129,860contains similarity to Sulfolobus tokodaii Putative reverse gyrase.; TR:Q975P6
45F55H12.3F55H12.3n/achrI 8,884,703contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (5), PF07645 (Calcium binding EGF domain) , PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF07974 (EGF-like domain) (5), PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) , PF02494 (HYR domain) , PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
46T20F7.5T20F7.5n/achrX 16,850,352contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
47ZK112.6ZK112.6n/achrIII 7,740,126contains similarity to Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1) (Acetate--CoA ligase) (Acyl-sactivating enzyme).; SW:Q72LY9
48srh-15C50B6.6n/achrV 13,321,651C. elegans SRH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49R04A9.3R04A9.3n/achrX 378,980
50W02B3.3W02B3.3n/achrIII 668,260