UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxa-41F52D2.10chrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
2nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
4T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5C15H9.2C15H9.2n/achrX 6,119,566contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
6srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
8T23D5.8T23D5.8n/achrV 15,747,913contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
9sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
10ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
11C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
12Y66A7A.7Y66A7A.7n/achrIII 11,629,581contains similarity to Lactobacillus plantarum Hypothetical protein.; TR:Q88VI8
13F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
14F35E2.1F35E2.1n/achrI 11,739,734contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
15M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
16nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
17srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
20B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
21hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
22jkk-1F35C8.3n/achrX 5,370,204jkk-1 encodes a member of the MAP kinase kinase superfamily that affects synaptic vesicle localization and is required in type-D motor neurons for normal locomotion; can function in the Hog1 MAP kinase pathway I in yeast as an activator of JNK and is expressed in most neurons
23C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
24srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25F45F2.6F45F2.6n/achrV 8,527,305contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
26F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
27F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
28Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
29F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
30C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
31uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
32R10E8.5R10E8.5n/achrV 18,255,890contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33C17A2.3C17A2.3n/achrII 3,844,552contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2975-PA;; FLYBASE:CG2975
34T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
35R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
36glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
37nhr-190F48G7.11n/achrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
39F02C12.4F02C12.4n/achrX 13,393,433contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
40srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42C55B6.5C55B6.5n/achrX 7,205,013contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
43Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4
44Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
45str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
47T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
48T06E8.2T06E8.2n/achrV 10,036,032
49C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
50R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)