UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1glb-17F49E2.41e-114chrX 9,574,890glb-17 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
2C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241
3srv-7T22B7.5n/achrX 5,643,888C. elegans SRV-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
4srh-3K04F1.5n/achrV 1,683,835C. elegans SRH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001024 (Lipoxygenase, LH2)
5egl-2F16B3.1n/achrV 1,294,353egl-2 encodes a voltage-gated potassium channel that affects egg laying, muscle activation, defecation, mechanosensation, and chemosensation; expressed in the intestinal muscle, AFD, ALN, AQR, ASE, AWC, BAG, IL2, PLN, PQR, and URX neurons as well as a subset of sensory neurons in the male tail.
6twk-10K04A8.4n/achrV 6,553,200C. elegans TWK-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
7srj-29F22B8.1n/achrV 16,076,456C. elegans SRJ-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00060 (Ligand-gated ion channel) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) contains similarity to Interpro domains IPR001638 (Bacterial extracellular solute-binding protein, family 3), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001320 (Ionotropic glutamate receptor), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR001508 (NMDA receptor)
8T02B11.6T02B11.6n/achrV 887,079contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
9T18D3.7T18D3.7n/achrX 12,442,974contains similarity to Pfam domain PF01166 TSC-22/dip/bun family contains similarity to Interpro domain IPR000580 (TSC-22 / Dip / Bun)
10F01F1.14F01F1.14n/achrIII 5,882,603
11F26H9.2F26H9.2n/achrI 9,292,112contains similarity to Pfam domain PF02755 RPEL repeat contains similarity to Interpro domain IPR004018 (RPEL repeat)
12T03E6.8T03E6.8n/achrV 16,601,940contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13W05H5.3W05H5.3n/achrII 12,446,465contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
14T01C3.1T01C3.1n/achrV 14,989,266contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF06920 (Dedicator of cytokinesis) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR010703 (Dedicator of cytokinesis)
15srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16fbxa-88F10A3.2n/achrV 16,142,535This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
17T10B10.8T10B10.8n/achrX 15,163,702contains similarity to Pfam domain PF01501 Glycosyl transferase family 8 contains similarity to Interpro domain IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
18col-78W07A12.5n/achrII 9,153,340C. elegans COL-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
19srbc-52F54B8.10n/achrV 15,828,326C. elegans SRBC-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20C48C5.1C48C5.1n/achrX 8,982,602contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21F07G6.3F07G6.3n/achrX 1,723,986
22sri-2F36G9.9n/achrV 15,964,503C. elegans SRI-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
23T21E12.3T21E12.3n/achrI 4,403,989contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
24T05H4.7T05H4.7n/achrV 6,416,194contains similarity to Pfam domain PF00182 Chitinase class I contains similarity to Interpro domain IPR000726 (Glycoside hydrolase, family 19, catalytic)
25str-9F57A10.1n/achrV 15,759,569C. elegans STR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26C47A10.5C47A10.5n/achrV 17,775,721C47A10.5 encodes a D-aspartate oxidase (DASPO), paralogous to F18E3.7 and F20H11.5; recombinant C47A10.5 protein has DASPO acvitity on acidic D-amino acid substrates (e.g., D-aspartate, D-glutamate, or N-methyl-D-aspartate/NMDA), with highest catalytic efficiency on D-glutamate; since the C-terminal residues of C47A10.5 match the PTS1 consensus sequence, C47A10.5 is predicted to be peroxisomal.
27clec-31F49A5.2n/achrV 16,857,086C. elegans CLEC-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
28B0564.4B0564.4n/achrIV 13,112,036contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
29K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
30dsl-4F16B12.2n/achrX 14,091,441dsl-4 encodes a putative secreted protein with a single DSL domain and three EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; unlike the nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins (including DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7), DSL-4 is evolutionarily divergent, with perhaps a distant affinity to APX-1, ARG-1, and LAG-2.
31col-148C12D8.8n/achrV 10,242,222C. elegans COL-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
32C08A9.8C08A9.8n/achrX 17,103,774contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
33clec-2B0454.7n/achrII 3,021,991C. elegans CLEC-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
35F56H6.9F56H6.9n/achrI 12,305,199contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
36H10E21.4H10E21.4n/achrIII 18,471contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
37let-23ZK1067.1n/achrII 9,202,659let-23 encodes an EGF-receptor-family transmembrane tyrosine kinase that affects viability, inductive signaling during development of the vulva, male spicule formation, posterior development of the epidermis, ovulation and behavioral quiescience during lethargus; it is genetically upstream of the let-60/RAS pathway with respect to viability and vulval development, is upstream of phosopholipase C gamma with respect to fertility and quiesence, and is expressed in vulval precursor cells and the ALA neuron.
38F19G12.2F19G12.2n/achrX 1,429,318contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
39fbxa-112Y102A5C.13n/achrV 16,947,523C. elegans FBXA-112 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
40srh-155F40D4.2n/achrV 17,180,821C. elegans SRH-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
41exc-9F20D12.5n/achrIV 7,940,302exc-9 encodes a LIM domain-containing protein; exc-9 activity is required for proper development and morphogenesis of the excretory cell canal.
42F09F3.5F09F3.5n/achrV 13,851,828contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal)
43srx-2R03H4.2n/achrV 9,010,093C. elegans SRX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44gpa-13F18E2.5n/achrV 12,753,806gpa-13 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASH, AWC, PHA, and PHB.
45AH10.2AH10.2n/achrV 14,157,204contains similarity to Plasmodium falciparum RIFIN.; TR:Q8I211
46daf-11B0240.3n/achrV 11,721,848The daf-11 gene encodes a guanylate cyclase that affects dauer formation, chemotaxis, and axon formation; it is genetically upstream of daf-12 with respect to dauer larvae formation and is expressed in a subset of amphid neurons.
47C04A11.1C04A11.1n/achrX 13,661,662contains similarity to Sorghum bicolor Extensin precursor (Proline-rich glycoprotein).; SW:EXTN_SORBI
48W04G5.4W04G5.4n/achrI 11,631,445contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR008996 (Cytokine, IL-1-like), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
49gst-25F37F2.3n/achrI 1,452,100C. elegans GST-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003082 (Glutathione S-transferase, Pi class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
50D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058