UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-190F48G7.110chrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
3srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
4F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
5srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
6C17H1.3C17H1.3n/achrI 13,105,263contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Smooth muscle caldesmon, putative.; TR:A2FBI1
7H25K10.4H25K10.4n/achrIV 16,226,802contains similarity to Pseudomonas putida Hypothetical protein.; TR:Q8VMP3
8T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
9srh-295ZK1037.8n/achrV 15,331,670C. elegans SRH-295 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
11T07D3.5T07D3.5n/achrII 886,263contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR009644 (Fukutin-related)
12C40A11.5C40A11.5n/achrII 2,134,686contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
13F49C5.4F49C5.4n/achrII 12,539,002contains similarity to Pfam domain PF00069 (Eukaryotic protein kinase domain)
14twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
15F38B6.7F38B6.7n/achrX 6,697,033contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
16C50H11.17C50H11.17n/achrV 3,097,908contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
17Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
18clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
19nhr-150C06B8.10.0003chrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C32B5.7C32B5.7n/achrII 962,400contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
22str-198ZK285.1n/achrV 16,048,450C. elegans STR-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24F41E6.8F41E6.8n/achrV 8,600,475contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
25F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
26C27F2.1C27F2.1n/achrIII 4,989,295contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
27C31B8.9C31B8.9n/achrV 2,912,083contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
28srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29str-14T08G3.2n/achrV 16,454,252C. elegans STR-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
32ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
33srw-84Y43F8A.4n/achrV 19,382,978C. elegans SRW-84 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
34T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
35F56C9.8F56C9.8n/achrIII 7,317,655
36srh-18C50B6.5n/achrV 13,319,254C. elegans SRH-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
38srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
40srv-4F15E6.7n/achrIV 4,286,920C. elegans SRV-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
41nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
42R12B2.2R12B2.2n/achrIII 5,808,424contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Golgin-45; ENSEMBL:ENSP00000327541
43F59B2.11F59B2.11n/achrIII 9,014,893contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000025312
44fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
45B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
46C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
48C04C3.6C04C3.6n/achrIV 3,421,207contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
49lgc-1T05B4.1n/achrV 4,136,911C. elegans LGC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
50F16G10.1F16G10.1n/achrII 2,402,918contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)