UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nlp-3F48C11.33e-47chrX 13,178,076nlp-3 encodes a neuropeptide-like protein of the GFxGF family with similarity to orcokinins, highly conserved peptides native to crustaceans that enhance hindgut contractions; NLP-3 is expressed in neurons in the head, pharynx, and vulva, and in the intestine; the precise role of NLP-3 in nervous system function and development is not yet clear.
2flp-19M79.4n/achrX 10,605,248C. elegans FLP-19 protein ;
3flp-21C26F1.10n/achrV 7,793,674flp-21 encodes a single FMRFamide-related neuropeptide (FaRP) that serves as a ligand for NPR-1, a G protein-coupled receptor that regulates social versus solitary feeding behavior in several Caenorhabditis species; genetic analysis suggests that FLP-21 acts through NPR-1 to inhibit social feeding behavior; FLP-21 is expressed in the ADL, ASE and ASH sensory neurons, the URA motor neurons, the MC, M2 and M4 pharyngeal neurons, and the intestine; flp-21 encodes the only FMRFamide-related neuropeptide (FaRP) encoded by the C. elegans genome that activates both the social (215F) and the solitary (215V) forms of NPR-1 in both Xenopus oocytes and pharyngeal assays.
4nlp-37F48B9.4n/achrX 2,163,570C. elegans NLP-37 protein ;
5snt-4T23H2.2n/achrI 6,438,658C. elegans SNT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
6nlp-1C01C4.1n/achrX 3,727,992nlp-1 encodes a predicted neuropeptide-like protein of the MSFamide family with similarity to Aplysia californica (sea hare) buccalin, a neuropeptide that regulates acetylcholine-induced muscle contraction; NLP-1 is expressed in the phasmid PHB tail sensory neuron, lateral neurons, head neurons, and the intestine; the precise role of NLP-1 in nervous system function and development is not yet known.
7nlp-15CC4.2n/achrI 12,991,841C. elegans NLP-15 protein ; contains similarity to Procambarus clarkii Orcokinin peptides type A precursor [Contains: Orcomyotropin-likespeptide; Orcokinin; Orcokinin-like peptide].; SW:Q9NL83
8flp-7F49E10.3n/achrX 5,886,304flp-7 encodes an MVRFamide-containing peptide that, upon injection into A. suum, produces paralysis and loss of locomotory waveforms, increased body length, and decreased cAMP production.
9nlp-8D2005.2n/achrI 7,801,131C. elegans NLP-8 protein ;
10ttr-23T21C9.8n/achrV 10,589,462C. elegans TTR-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
11sbt-1T03D8.3n/achrV 20,823,688C. elegans SBT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05281 Neuroendocrine protein 7B2 precursor (Secretogranin V) contains similarity to Interpro domain IPR007945 (Neuroendocrine 7B2 precursor)
12F58B4.3F58B4.3n/achrV 10,930,269contains similarity to Homo sapiens similar to bA88M19.1 (EGF-like-domain multiple 5 protein); ENSEMBL:ENSP00000223618
13scl-14F09E8.5n/achrIV 13,166,113C. elegans SCL-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
14F20B6.6F20B6.6n/achrX 4,201,908contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
15C54C6.5C54C6.5n/achrIII 3,549,652contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_4440.; TR:Q98QC2
16F14F11.2F14F11.2n/achrII 8,295,048contains similarity to Rhodopirellula baltica Methanol dehydrogenase regulatory protein (EC 1.1.1.244).; TR:Q7UX83
17ttr-21F09F3.6n/achrV 13,854,097C. elegans TTR-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
18numr-2F08F8.1n/achrIII 7,365,432C. elegans NUMR-2 protein ;
19zig-5Y48A6A.1n/achrIII 10,952,247zig-5 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-5::gfp reporter fusion is expressed in a number of neurons, including PVT, VD1-13, RID, AFD, ASK, RIV, RIB, PVQ, DVA, and RIS; zig-5::gfp is detected in the PVT neuron beginning at the three-fold stage of embryogenesis and continuing throughout larval development; loss of zig-5 activity in large-scale RNAi screens has been reported to result in low levels of embryonic lethality.
20F21F3.1F21F3.1n/achrI 4,909,304contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR000720 (Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013017 (NHL repeat, subgroup), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR001258 (NHL repeat)
21cal-2C18E9.1n/achrII 8,961,053cal-2 encodes a calmodulin homolog required for embryonic development or viability; CAL-2 is closely similar to its paralogs CAL-1, CAL-3, CAL-4 and CMD-1.
22nlp-14D1009.4n/achrX 8,918,369C. elegans NLP-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005829 (Sugar transporter, conserved site)
23ins-18T28B8.2n/achrI 8,148,533ins-18 encodes one of 40 C. elegans insulin/IGF-like peptides; INS-18, along with INS-1, are the only two C. elegans insulins that contain a C peptide, characteristic of mammalian insulins, connecting the B and A chains; overexpression of ins-18 induces dauer arrest at 26 degrees C and enhances the dauer arrest seen in a daf-2 mutant at 20 degrees C, suggesting that INS-18 functions to antagonize DAF-2 receptor signaling; ins-18::gfp reporters are expressed in neurons and the intestine.
24tsp-1C02F5.8n/achrIII 8,238,638C. elegans TSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
25C47D2.1C47D2.1n/achrX 8,215,243
26F52E1.8F52E1.8n/achrV 8,393,368contains similarity to Pfam domains PF00300 (Phosphoglycerate mutase family) , PF00328 (Histidine acid phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR000560 (Histidine acid phosphatase), IPR013078 (Phosphoglycerate mutase)
27ttr-29R90.4n/achrV 12,906,429C. elegans TTR-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
28K12B6.4K12B6.4n/achrV 6,280,741
29B0294.1B0294.1n/achrX 1,897,093
30ZC204.1ZC204.1n/achrII 1,666,906contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
31ttr-27R90.2n/achrV 12,903,803C. elegans TTR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
32F36D1.7F36D1.7n/achrI 11,263,396contains similarity to Bacteriophage T5 L-shaped tail fiber protein (LTF protein).; SW:VLTF_BPT5
33C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
34C02B8.3C02B8.3n/achrX 8,139,820
35flp-3W07E11.2n/achrX 10,092,469flp-3 encodes nine copies of a GTMRFamide-containing peptide that is predicted to function as a neuropeptide that inhibits pharyngeal action potential in a manner similar to octopamine without having a significant effect on basal resting membrane potential; expressed in three pairs of neurons IL1D, OL1, URB.
36drn-1C54A12.4n/achrII 5,271,026C. elegans DRN-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
37T26G10.5T26G10.5n/achrIII 9,426,015contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein SPy0952.; TR:Q9A032
38pqn-48K07D4.8n/achrII 4,040,965The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
39F53A9.6F53A9.6n/achrX 8,713,583contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002395 (HMW kininogen)
40ZK353.4ZK353.4n/achrIII 8,388,992contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Uncharacterized serine/threonine-rich protein PB15E9.01c precursor.; SW:Q8TFG9
41flp-5C03G5.7n/achrX 8,529,581flp-5 encodes a predicted FMRFamide-like peptide neurotransmitter that increases action potential frequency in the pharyngeal muscle when applied to the pharynx of dissected worms; expressed in the sensory neurons ASE and PVM.
42xbx-3M04D8.6n/achrIII 10,036,315C. elegans XBX-3 protein ;
43K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
44F41G3.10F41G3.10n/achrII 6,749,016contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
45R06F6.7R06F6.7n/achrII 10,811,543contains similarity to Saccharomyces cerevisiae FLO5- and FLO8-determined flocculation are considerably less sensitive to mannose than FLO1-determined flocculation.; SGD:YHR211W
46R05A10.2R05A10.2n/achrIV 14,178,019contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Actin-binding protein that stabilizes actin filaments; Tpm1, the main tropomyosin, is required for the formation and stability of actin cables in vivo which direct polarized cell growth and the distribution of several organelles.; SGD:YNL079C
47sul-2D1014.1n/achrV 8,158,775sul-2 is orthologous to the human gene ARYLSULFATASE A (ARSA; OMIM:250100), which when mutated leads to metachromatic leukodystrophy.
48C34F11.8C34F11.8n/achrII 5,210,353contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
49abf-5T22H6.5n/achrX 12,793,039The abf-5 gene encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum.
50flp-24C24A1.1n/achrIII 725,550C. elegans FLP-24 protein ;