UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1spe-11F48C1.75e-135chrI 5,331,412spe-11 encodes a novel protein that is required for early embryonic development and for regulating the dynamic morphology of sperm pseudopods; although the precise biological role of SPE-11 is not yet known, SPE-11 is one of the few paternally provided proteins known to be essential for embryogenesis, and may constitute a sperm-associated factor required for oocyte activation; SPE-11 is first detected in the nuclei of primary spermatocytes and then remains tightly associated with sperm chromatin until fertilization at which point it appears to be degraded.
2C24A11.1C24A11.1n/achrI 5,402,352
3F13G11.2F13G11.2n/achrIV 14,633,712contains similarity to Rattus norvegicus Chondroadherin precursor (Cartilage leucine-rich protein).; SW:CHAD_RAT
4C10H11.7C10H11.7n/achrI 4,720,444contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5D1081.5D1081.5n/achrI 8,481,820contains similarity to Interpro domain IPR009061 ()
6T02E1.7T02E1.7n/achrI 8,209,741contains similarity to Pfam domain PF02077 SURF4 family contains similarity to Interpro domains IPR002995 (Surfeit locus 4), IPR011592 (Surfeit locus 4-related)
7K07A1.5K07A1.5n/achrI 9,591,179contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR003060 (Pyocin S killer protein)
8C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
9C18H7.4C18H7.4n/achrIV 594,283contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
10C38C3.8C38C3.8n/achrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
11C50D2.3C50D2.3n/achrII 106,848contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
12Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
13C04F12.6C04F12.6n/achrI 9,693,209contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR013303 (Wnt-14 protein)
14C34D4.2C34D4.2n/achrIV 7,155,353contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
15C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
16T02E1.6T02E1.6n/achrI 8,211,732contains similarity to Akodon andinus NADH dehydrogenase subunit 4 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinonesoxidoreductase chain 4) (Fragment).; TR:O21539
17ZK354.3ZK354.3n/achrIV 5,310,807contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
18B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
19F56A11.6F56A11.6n/achrIV 581,274contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000533 (Tropomyosin)
20ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
21C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)
22ZK1248.5ZK1248.5n/achrII 5,811,119contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domains IPR001940 (Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S), IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
23F26B1.1F26B1.1n/achrI 6,328,529contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
24C16A11.7C16A11.7n/achrII 4,256,423
25C08F8.6C08F8.6n/achrIV 11,163,509contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
26C35E7.9C35E7.9n/achrI 10,807,562contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR005819 (Histone H5)
27T04F3.3T04F3.3n/achrV 11,759,725contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
28cyc-2.2ZC116.2n/achrV 12,611,951ZC116.2 encodes, along with E04A4.7, one of two C. elegans cytochrome c proteins; the product of ZC116.2 is predicted to function in the electron transport chain by transferring electrons from respiratory chain Complex III to Complex IV; RNAi screens indicate the ZC116.2 activity is required for embryonic development as well as for normal body size and rates of growth.
29Y106G6H.13Y106G6H.13n/achrI 10,471,577contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical membrane spanning protein.; TR:Q813N7
30Y57G11C.6Y57G11C.6n/achrIV 14,759,618contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
31Y106G6G.4Y106G6G.4n/achrI 10,322,489contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:P28968
32F42C5.5F42C5.5n/achrIV 7,293,350contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
33K06H7.8K06H7.8n/achrIII 8,097,370contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34F58A6.5F58A6.5n/achrII 5,147,698contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domain IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
35ttr-9C33A12.15n/achrIV 9,505,947C. elegans TTR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
36C18A3.7C18A3.7n/achrII 5,730,004contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Arginine/serine-rich coiled-coil protein 1; ENSEMBL:ENSP00000295930
37C54D10.4C54D10.4n/achrV 12,420,859contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
38F47B3.5F47B3.5n/achrI 3,963,648contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
39C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
40C15H7.3C15H7.3n/achrIII 9,651,090contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
41B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316
42C01G12.8C01G12.8n/achrII 14,595,473contains similarity to Pfam domains PF00689 (Cation transporting ATPase, C-terminus) , PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) , PF00690 (Cation transporter/ATPase, N-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR005775 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit, eukaryotic), IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR004014 (ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR006068 (ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR000695 (H+ transporting ATPase, proton pump)
43ZC412.5ZC412.5n/achrV 14,874,791
44Y45F10B.8Y45F10B.8n/achrIV 13,577,771contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
45ZK1307.3ZK1307.3n/achrII 9,652,584contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
46ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
47C01G10.14C01G10.14n/achrV 15,105,627contains similarity to Pfam domain PF03147 Ferredoxin-fold anticodon binding domain contains similarity to Interpro domain IPR005121 (Phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, ferrodoxin-fold anticodon-binding)
48Y44A6D.5Y44A6D.5n/achrV 20,797,500contains similarity to Pfam domain PF01063 Aminotransferase class IV contains similarity to Interpro domains IPR001544 (Aminotransferase, class IV), IPR005786 (Branched-chain amino acid aminotransferase II)
49E03H12.7E03H12.7n/achrIV 4,988,167contains similarity to Danio rerio Protein FAM133.; SW:A1A5I1
50F41G4.4F41G4.4n/achrX 16,830,293